ОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ. ВИЧ-ИНФЕКЦИЯ
В работе представлены результаты молекулярно-эпидемиологического мониторинга за ВИЧ-1 в Томской области. Целью исследования был анализ развития и распространения ВИЧ-1, резистентных к препаратам антиретровирусной терапии. Показано, что на территории Томской области продолжает доминировать генетический вариант ВИЧ-1 CRF63_02A6, выявленный в 75% образцов, субтип А6 выявляется примерно в 15% и в 10% случаев – возникающие уникальные рекомбинантные формы вируса. Передача первично резистентных ВИЧ происходит в 9,5% случаев, в 50% регистрируется ВИЧ-1 с мутацией K103N, вызывающей высокие уровни резистентности к невирапину и эфавиренцу. При неэффективности АРТ в 78% случаев развивается резистентность ВИЧ-1 среднего и высокого уровня, в 53% случаев выделены ВИЧ-1, резистентные к НИОТ и ННИОТ. Лидирует по частоте выявления среди НИОТ мутация M184V/I (65,6%), ответственная за резистентность высокого уровня к ламивудину и эмтрицитабину. Встречаемость других мутаций ВИЧ к НИОТ не превышает 10%. Среди мутаций ВИЧ к ННИОТ K103N найдена в 28% случаев, чаще выявляется мутация V106I (29,3%), являющаяся основной мутацией резистентности вируса к элсульфавирину (ESV). Присутствуют и другие замены, связанные со снижением чувствительности вируса к ESV – это мутации в кодонах E138K (16,0%), Y181C (13,3%), A98G (10,7%), Y188L/Н (6,6%), L100I (2,7%), M230L (2,7%) и F227L (1,3%). У 10 из 77 (13,0%) пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ выделены ВИЧ-1 со сниженной чувствительностью к ИИ. В 18,2% случаев ЛЖВ с неэффективной АРТ имели вирусную нагрузку от 200 тыс. до 2 млн копий РНК/мл, выделенные у них вирусы обладали высоким и средним уровнями резистентности к 2-4 классам препаратов АРТ одновременно. Полученные результаты указывают на актуальность расширения доступа ЛЖВ к анализу резистентности ВИЧ и важность усиления мониторинга эффективности проводимой АРТ.
Эпидемия ВИЧ-инфекции – медико-социальная проблема, которая составляет угрозу сохранению здоровья населения. Несмотря на тенденцию к относительной стабилизации заболеваемости, все еще сохраняется актуальность распространения ВИЧ-инфекции в Дальневосточном федеральном округе. В статье представлен ретроспективный эпидемиологический анализ данных за период 2018-2024 гг. об особенностях гендерного и возрастного состава, путей заражения среди вновь выявленных случаев ВИЧ-инфицирования среди населения. Определены некоторые особенности развития эпидемиологической ситуации. Отмечено изменение возрастной структуры в сторону увеличения лиц старше 40 лет, преобладание лиц мужского пола, а также увеличение роли гетеросексуального пути передачи ВИЧ.
Проблема ВИЧ-инфекции, несмотря на современные подходы к лечению и профилактике, сохраняет актуальность во всем мире и является глобальным вызовом здравоохранения уже около 40 лет. Несмотря на то, что ВИЧ-инфекция остается неизлечимым заболеванием, современная антиретровирусная терапия (АРВТ) делает ее контролируемым заболеванием. До 2005-2006 гг. заболеваемость ВИЧ-инфекцией у военнослужащих Министерства обороны Российской Федерации (Минобороны России) имела такие же тенденции распространения, как и в стране в целом. Однако впоследствии, введение системы противодействию ВИЧ-инфекции, включающей в себя обязательное скрининговое обследование при призыве на военную службу и заключении первого контракта, а также ежегодное обследование при прохождении диспансеризации военнослужащими, позволило существенно изменить ситуацию. Военнослужащие Минобороны России получают АРВТ в соответствии с программой государственных гарантий, финансируемой из средств федерального бюджета. Однако на фоне специальной военной операции возникла потребность назначения АРВТ пациентам в условиях военно-медицинских организаций. В настоящее время недостаточно данных о влиянии ВИЧ-инфекции на течение травматической болезни, о развитии феномена взаимного отягощения и послеоперационных осложнений. Указанные направления нуждаются в дальнейшем изучении и разработке.
ДРУГИЕ ВИРУСНЫЕ И БАКТЕРИАЛЬНЫЕ ИНФЕКЦИИ
Из крови сирийского хомячка (Mesocricetus auratus) выделяли первичную культуру адгезивных лейкоцитов и заражали ex vivo SARS-CoV-2 (штаммы Omicron и Delta) в двух различных дозах, определяли изменения активности дегидрогеназной системы в динамике инфицирования. Обнаруженный в ходе исследования характер активации клеток зависит от штамма и дозы вируса. Снижение ферментативной активности инфицированных клеток свидетельствуют о снижении микробицидного потенциала клеток врождённого иммунитета при COVID-19. Это является ещё одним подтверждением дисфункции иммунной системы в процессе SARS-CoV-2-инфекции.
В Приморском крае силами НИИЭМ им. Г.П. Сомова Роспотребнадзора были секвенированы 478 образцов SARS-CoV-2, отобранных после 05 мая 2023 г. В результате образцы были идентифицированы как принадлежащие к 93 различным линиям Pango, наиболее часто встречающимися оказались линии JN.1.7 (98 образцов, 20,5%), JN.1 (45 образцов, 9,4%) и XBB.2.3.11 (30 образцов, 6,3%). Региональной особенностью Приморского края стала значительная доля линии JN.1.7 (до 58,0% в марте 2024 г.), в основном характерная для США (47% от числа всех зарегистрированных случаев этой линии в мире) и почти неизвестная в КНР, Южной Корее и Японии.
Широкое распространение вируса простого герпеса, Simplexvirus humanalpha1 (Herpesvirales: Orthoherpesviridae), актуализирует поиск и разработку новых эффективных противогерпетических препаратов. В представленной работе описаны результаты изучения способности каррагинанов (КРГ), выделенных из тихоокеанской красной морской водоросли Ahnfeltiopsis flabelliformis (Gigartinales: Phyllophoraceae), ингибировать различные стадии инфекции S. humanalpha1 в клетках Vero. Сравнительный анализ антигерпетической активности полисахарида (ι/κ-КРГ) и его олигосахарида (ι/κ-КРГ-ОС) продемонстрировал, что профилактический эффект ι/κ-КРГ выше, чем ι/κ-КРГ-ОС, тогда как вирулицидное действие поли- и олигосахарида отличается незначительно. Методом молекулярного докинга показано, что КРГ способны связываться с поверхностным гликопротеином gD S. humanalpha1, предотвращая взаимодействие вируса с клеткоймишенью.
Эпидемиологический надзор за острыми респираторными вирусными инфекциями, оперативный мониторинг за циркуляцией их возбудителей с углубленными исследованиями биологических свойств выделенных штаммов являются актуальными направлениями деятельности структур Роспотребнадзора. В представленной работе приводятся данные по эпидемическому и этиологическому надзору, осуществляемому в рамках деятельности Центра гигиены и эпидемиологии в Приморском крае в сотрудничестве с НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова Роспотребнадзора, проанализирована эпидемиологическая ситуация по острым респираторным вирусным инфекциям в Приморском крае в эпидемическом сезоне с 40 недели 2024 г. по 20 неделю 2025 г., проведён сравнительный анализ с заболеваемостью предыдущего сезона, а также определение этиологической структуры острых респираторных заболеваний.
Под воздействием биотических и абиотических факторов патогенные микроорганизмы в морской экосистеме могут образовывать дормантные клеточные фенотипы.
Целью исследования стало изучение возможности формирования дормантного фенотипа Salmonella Enteritidis при инокуляции штамма в стерилизованной морской воде. Детекцию и идентификацию ДНК бактерий проводили с помощью бактериологических и молекулярногенетических (ПЦР в режиме «реального времени») методов исследования. Установлено, что морская вода может инициировать трансформацию вегетативного фенотипа S. Enteritidis в дормантную форму, а также обратную реверсию бактерий в вегетативную форму после инокулирования per os в организм лабораторных животных.
Проведён анализ циркуляции редко регистрируемых штаммов Salmonella Bredeney на территории Приморского края. Ретроспективный анализ, идентификация штаммов и плазмидный анализ проведены с помощью микробиологических методов исследования. Установлено разнообразие плазмидных типов штаммов S. Bredeney. В основном у штаммов S. Bredeney преобладают легкие плазмидные типы от 1,4 до 3,8 МДа. В двух случаях установлен плазмидный тип 38 МДа, и в двух случаях зарегистрированы тяжёлые плазмидные типы 80 и 60 МДа. Следует отметить, что ранее редко встречаемый серотип S. Bredeney в Приморском крае начиная с 2017 г. и по настоящее время регистрируется как от пострадавших людей, так и из продуктов питания, вызывая развитие заболевания.
Необоснованное применение широкого спектра антибактериальных препаратов при лечении и профилактике инфекционных заболеваний у людей и животных привело к появлению резистентных бактерий.
Целью исследования было суммирование данных по антибиотикорезистентности штаммов Salmonella spp., циркулирующих на территории Приморского края в 2020-2025 гг. Идентификацию штаммов и анализ антигенной характеристики проводили с использованием агглютинирующих сывороток. Исследование антибиотикорезистентности штаммов S. enterica проведено диско-диффузионным методом. Установлено, что подавляющее большинство штаммов сальмонелл обладают выраженной устойчивостью к налидиксовой кислоте и тетрациклину, оставаясь чувствительными к амикацину, гентамицину и имипенему. Выявлено увеличение полирезистентности к 2 и более антибиотикам. Полученные результаты свидетельствуют о необходимости постоянного мониторинга антибиотикорезистентности бактерий в рамках эпидемиологического надзора для своевременной корректировки фармакотерапии в медицине и ветеринарии.
ПРИРОДНО-ОЧАГОВЫЕ ИНФЕКЦИИ
Цель работы – сравнительная оценка результатов непрямой иммунофлуоресценции (НМФА) с применением конъюгатов антител (АТ) кролика к IgG, IgA, IgM мыши или человека с ФИТЦ и конъюгата стафилококкового протеина (Staphylococcal Protein A) (SPA) с ФИТЦ для верификации специфичности иммунных к вирусу клещевого энцефалита (ВКЭ) сывороток мышей и иммунизированных вакциной ВКЭ людей. Полученные результаты свидетельствуют, что конъюгат SPA с ФИТЦ может быть использован в НМФА для оценки специфичности иммунных к ВКЭ сывороток мыши или человека, но чувствительность конъюгата SPA с ФИТЦ статистически значимо ниже по сравнению с конъюгатом АТ кролика к IgG, IgA, IgM мыши или человека с ФИТЦ.
На сегодняшний день, в лаборатории природно-очаговых вирусных инфекций находится 103 штамма вируса клещевого энцефалита дальневосточного генотипа, депонированных в Коллекцию патогенных микроорганизмов НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова Роспотребнадзора. Более 80 лет ведется работа по изучению биологических и молекулярно-генетических свойств этого вируса. Накопленные многолетние данные позволяют генерировать новые знания об эволюции, генетическом разнообразии и динамике биологических свойств возбудителя клещевого энцефалита.
Клеточные культуры насекомых являются эффективными моделями для изучения арбовирусов. В работе представлен анализ литературных данных о применении наиболее популярных клеточных культур насекомых (C6/36, A20, Aag2) для исследования коинфекции опасных для человека арбовирусов Зика (Orthoflavivirus zikaense), денге (O. denguei), японского энцефалита (O. japonicum), чикунгунья (Alphavirus chikungunya), Синдбис (A. sindbis), Гета (A. getah) и вирусов насекомых Менгай (Almendravirus menghai), комаров Anopheles gambiae (Brevihamaparvovirus dipteran1), Шиноби (Alphapermutotetravirus shinobi). Делается вывод о том, что культуры клеток насекомых могут применяться для изучения многогранных взаимодействий различных арбовирусов как друг с другом, так и с хозяйскими клетками.
Глэмпинг (от англ. glamorous, «гламурный», и camping, «лагерь», то есть «гламурный лагерь») – это вид туризма или познавательного отдыха на природе, в котором обеспечивается высокий уровень комфорта, который требует специальной организации логистических мероприятий и увеличенного штата обслуживающего персонала. Кроме того, комфорт подразумевает и определённый уровень безопасности. При этом, как показывает имеющийся опыт, глэмпинг-туристы желают ознакомиться с природными территориями, которые значительно удалены от населённых пунктов. В этих условиях чрезвычайно важен анализ рисков обеспечения биологической безопасности, которому и посвящена данная работа.
В работе представлен обзор экологических, эпидемиологических и молекулярно-генетических данных о циркуляции вируса Повассан, или Orthoflavivirus powassanense (Amarillovirales: Flaviviridae), на юге российского Дальнего Востока в сопоставлении с аналогичными данными для Северной Америки. Делается вывод о том, что этот вирус сохраняет свою актуальность для Дальнего Востока и его эколого-эпидемиологический мониторинг требуется проводить на регулярной основе.
ПАРАЗИТАРНЫЕ ИНВАЗИИ
В работе представлен анализ опубликованных данных за последние 10 лет для представителей рода Echinochasmus и семейства Echinochasmidae. В этих публикациях использовались молекулярно-генетические данные, которые соотносились с морфологическими критериями и особенностями циркуляции паразитов. Применение комплексного подхода позволило не только выявить новые виды внутри семейства, но и отметить проблемы в выделении таксонов более высокого ранга – в частности, парафилию внутри рода Echinochasmus, который включает паразитов, имеющих существенные морфологические отличия на разных стадиях жизненного цикла.
При паразитологическом исследовании моллюсков Gabbia fuchsiana, собранных во Вьетнаме, а также у Helicorbis sujfunensis и Gyraulus centrifugops из России были выявлены амфостомные церкарии. Анализ морфологических и молекулярных данных показал, что обнаруженные церкарии принадлежат разным видам трематод. Таксономическая принадлежность трематод из российских моллюсков была определена до рода, тогда как для церкарий, собранные от моллюсков из Вьетнама установлена принадлежность только к семейству. Анализ филогенетической реконструкции выявил острую необходимость ревизии доступных на настоящий момент морфологических и молекулярных данных для представителей надсемейства Paramphistomoidea.
В условиях урбанизированной среды синантропные виды животных являются главным источником распространения паразитарных инвазий. В данной работе проведено сравнение видового состава паразитофауны почвы с видовым составом паразитофауны домашних собак и кошек. Выявлено 9 общих видов гельминтов, которые также представляют опасность для человека.



