Исследование генетической гетерогенности области генома ВИЧ-1, кодирующей вирусную интегразу
Аннотация
Эпидемия ВИЧ-инфекции в России уникальна, для неё характерно распространение своих специфических вариантов ВИЧ-1 субтипов А, В и рекомбинантной формы CRF63_02A1. Нами изучены генетическая гетерогенность и натуральный полиморфизм области генома ВИЧ-1, кодирующей интегразу вируса среди 55 вариантов ВИЧ-1, выделенных из клинических образцов плазмы, собранных в 2015 году от инфицированных пациентов Сибирского региона. Исследование показало, что на развитие российской эпидемии оказывают существенное влияние рекомбинантные варианты ВИЧ-1; первичная распространенность мутаций лекарственной устойчивости в области, кодирующей интегразу, составила 7,3%; выявлен натуральный полиморфизм ВИЧ-1, специфичный для субтипа А и CRF63_02A1
Об авторах
Наталья Матвеевна Гашникова
Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
А. В. Тотменин
Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
В. В. Ивлев
Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
Д. П. Зырянова
Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
Е. М. Астахова
Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
М. П. Гашникова
Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
Т. Н. Исмаилова
Томский областной Центр по профилактике и борьбе со СПИД и другими инфекционными заболеваниями
Россия
Россия
А. С. Чернов
Томский областной Центр по профилактике и борьбе со СПИД и другими инфекционными заболеваниями
Россия
Россия
В. Н. Михеев
Федеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»
Россия
Россия
Список литературы
1. Baryshev PB, Bogachev VV, Gashnikova NM. The HIV-1 Genetic Diversity in Russia: CRF63_02A1, a New HIV-1 Genetic Variant Spreading in Siberia // AIDS Research and Human Retroviruses. doi:10.1089/aid.2013.0196
2. Riva C, Romano L, Saladini F, et al.: Identification of a possible ancestor of the subtype A1 HIV Type 1 variant circulating in the former Soviet Union // AIDS Res Hum Retroviruses. - 2008. - V. 24(10). - Р. 1319-1325.
3. Robertson DL, Anderson, J.A. Bradac JA et al.: HIV-1 nomenclature proposal // Science. - 2000. - V. 288. - Р. 55-56.
4. Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. // Mol. Biol. Evol. - 2007, V. 24. - P. 1596-1599.
5. Zelalem Temesgen and Dawd S Siraj Raltegravir: first in class HIV integrase inhibitor Ther Clin Risk Manag. 2008 Apr; 4(2): 493-500; Blanco JL, et al. // J Infect Dis. - 2011. V. 203. - P. 1204-1214.
6. Zixin Hu and Daniel R. Kuritzkes Effect of Raltegravir Resistance Mutations in HIV-1 Integrase on Viral Fitness.
Рецензия
Для цитирования:
Гашникова Н.М., Тотменин А.В., Ивлев В.В., Зырянова Д.П., Астахова Е.М., Гашникова М.П., Исмаилова Т.Н., Чернов А.С., Михеев В.Н. Исследование генетической гетерогенности области генома ВИЧ-1, кодирующей вирусную интегразу. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015;(28):58-61.
For citation:
Gashnikova N.M., Totmenin A.V., Ivlev V.V., Zyryanova D.P., Astahova E.M., Gashnikova M.P., Ismailova T.N., Chernov A.S., Mikheev V.N. Investigation of HIV-1 diversity in the integrase coding region. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2015;(28):58-61. (In Russ.)
Просмотров:
96
Послать статью по эл. почте 