infectpataogДальневосточный журнал инфекционной патологииFar Eastern Journal of Infectious Pathology2073-2899ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзораinfectpataog-131Research ArticleСтатьиИсследование генетической гетерогенности области генома ВИЧ-1, кодирующей вирусную интегразуInvestigation of HIV-1 diversity in the integrase coding regionГашниковаНаталья МатвеевнаGashnikovaN. M.ngash@vector.nsc.ruТотменинА. В.TotmeninA. V.noemail@neicon.ruИвлевВ. В.IvlevV. V.noemail@neicon.ruЗыряноваД. П.ZyryanovaD. P.noemail@neicon.ruАстаховаЕ. М.AstahovaE. M.noemail@neicon.ruГашниковаМ. П.GashnikovaM. P.noemail@neicon.ruИсмаиловаТ. Н.IsmailovaT. N.noemail@neicon.ruЧерновА. С.ChernovA. S.noemail@neicon.ruМихеевВ. Н.MikheevV. N.noemail@neicon.ruФедеральное бюджетное учреждение науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»РоссияDepartment of Retroviruses, State research Center of Virology and Biotechnology VectorRussian FederationТомский областной Центр по профилактике и борьбе со СПИД и другими инфекционными заболеваниямиРоссияTomsk Regional Center for Prevention and Control of AIDS and Other Infectious DiseasesRussian Federation2015140320180285861Copyright © Гашникова Н.М., Тотменин А.В., Ивлев В.В., Зырянова Д.П., Астахова Е.М., Гашникова М.П., Исмаилова Т.Н., Чернов А.С., Михеев В.Н., 20182018Гашникова Н.М., Тотменин А.В., Ивлев В.В., Зырянова Д.П., Астахова Е.М., Гашникова М.П., Исмаилова Т.Н., Чернов А.С., Михеев В.Н.Gashnikova N.M., Totmenin A.V., Ivlev V.V., Zyryanova D.P., Astahova E.M., Gashnikova M.P., Ismailova T.N., Chernov A.S., Mikheev V.N.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://infectpataog.elpub.ru/jour/article/view/131

Эпидемия ВИЧ-инфекции в России уникальна, для неё характерно распространение своих специфических вариантов ВИЧ-1 субтипов А, В и рекомбинантной формы CRF63_02A1. Нами изучены генетическая гетерогенность и натуральный полиморфизм области генома ВИЧ-1, кодирующей интегразу вируса среди 55 вариантов ВИЧ-1, выделенных из клинических образцов плазмы, собранных в 2015 году от инфицированных пациентов Сибирского региона. Исследование показало, что на развитие российской эпидемии оказывают существенное влияние рекомбинантные варианты ВИЧ-1; первичная распространенность мутаций лекарственной устойчивости в области, кодирующей интегразу, составила 7,3%; выявлен натуральный полиморфизм ВИЧ-1, специфичный для субтипа А и CRF63_02A1

The AIDS epidemic in Russia has unique features, showing co-circulation of HIV-1 subtypes A, B and CRF63_02A1. We have characterized the HIV-1 genetic diversity and natural polymorphisms at the integrase coding region from 55 plasma specimens collected in 2015 from HIV-1-infected patients in Siberian region. This study indicates an evolving HIV-1 epidemic in Russia with recombinant viruses; pretreatment HIV drug resistance was 7.3% and the occurrence of natural polymorphism in the IN region was subtype or CRF dependent.

ВИЧ-1лекарственная устойчивостьсубтип-специфический полиморфизмСRF63_02A1HIV-1 drug resistanceintegrasesubtype dependent polymorphismReferencesBaryshev PB, Bogachev VV, Gashnikova NM. The HIV-1 Genetic Diversity in Russia: CRF63_02A1, a New HIV-1 Genetic Variant Spreading in Siberia // AIDS Research and Human Retroviruses. doi:10.1089/aid.2013.0196Baryshev PB, Bogachev VV, Gashnikova NM. The HIV-1 Genetic Diversity in Russia: CRF63_02A1, a New HIV-1 Genetic Variant Spreading in Siberia // AIDS Research and Human Retroviruses. doi:10.1089/aid.2013.0196Riva C, Romano L, Saladini F, et al.: Identification of a possible ancestor of the subtype A1 HIV Type 1 variant circulating in the former Soviet Union // AIDS Res Hum Retroviruses. - 2008. - V. 24(10). - Р. 1319-1325.Riva C, Romano L, Saladini F, et al.: Identification of a possible ancestor of the subtype A1 HIV Type 1 variant circulating in the former Soviet Union // AIDS Res Hum Retroviruses. - 2008. - V. 24(10). - Р. 1319-1325.Robertson DL, Anderson, J.A. Bradac JA et al.: HIV-1 nomenclature proposal // Science. - 2000. - V. 288. - Р. 55-56.Robertson DL, Anderson, J.A. Bradac JA et al.: HIV-1 nomenclature proposal // Science. - 2000. - V. 288. - Р. 55-56.Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. // Mol. Biol. Evol. - 2007, V. 24. - P. 1596-1599.Tamura K., Dudley J., Nei M., Kumar S. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. // Mol. Biol. Evol. - 2007, V. 24. - P. 1596-1599.Zelalem Temesgen and Dawd S Siraj Raltegravir: first in class HIV integrase inhibitor Ther Clin Risk Manag. 2008 Apr; 4(2): 493-500; Blanco JL, et al. // J Infect Dis. - 2011. V. 203. - P. 1204-1214.Zelalem Temesgen and Dawd S Siraj Raltegravir: first in class HIV integrase inhibitor Ther Clin Risk Manag. 2008 Apr; 4(2): 493-500; Blanco JL, et al. // J Infect Dis. - 2011. V. 203. - P. 1204-1214.Zixin Hu and Daniel R. Kuritzkes Effect of Raltegravir Resistance Mutations in HIV-1 Integrase on Viral Fitness.Zixin Hu and Daniel R. Kuritzkes Effect of Raltegravir Resistance Mutations in HIV-1 Integrase on Viral Fitness.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.