СИСТЕМА ПРАЙМЕРОВ ДЛЯ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ОРТОХАНТАВИРУСА СЕУЛ

Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС) – природно-очаговая вирусная инфекция широко распространенная на территории Российской Федерации. Ортохантавирус Сеул (Orthohantavirus seoulense), один из возбудителей ГЛПС, – единственный убиквитарно распространенный ортохантавирус, патогенный для человека, ассоциирован с серыми крысами (Rattus norvegicus). В работе представлены результаты подбора и верификации системы праймеров для полногеномного секвенирования O. seoulense.

1. Запорожец Т.С., Беседнова Н.Н., Калинин А.В. и др. 80 лет на страже биологической безопасности у восточных рубежей России // Здоровье населения и среда обитания. 2021; (5): 5-15. DOI: 10.35627/2219-5238/2021-338-5-5-15

2. Иунихина О.В., Потт А.Б., Панкратов Д.В., Щелканов М.Ю. Актуальность геморрагической лихорадки с почечным синдромом для юга российского Дальнего Востока // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2023; 45(45): 122-123.

3. Иванис В.А., Иунихина О.В., Попов А.Ф. и др. Клинико-эпидемиологические аспекты геморрагической лихорадки с почечным синдромом в Приморском крае // Тихоокеанский медицинский журнал. 2024; 4(98): 76-81. DOI: 10.34215/1609-1175-2024-4-76-81

4. Компанец Г.Г., Кушнарева Т.В., Максема И.Г. и др. Эпидемиологическая ситуация и меры неспецифической профилактики ГЛПС в очагах циркуляции вируса Сеул // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2008; 13: 187-188.

5. Компанец Г.Г., Максема И.Г., Иунихина О.В. и др. Особенности функционирования смешанного очага хантавирусной инфекции на территории Владивостокского городского округа // Тихоокеанский медицинский журнал. 2010; 3(41): 40-43.

6. Кузнецова Н.А., Компанец Г.Г., Иунихина О.В. Характерные особенности эпидемиологии геморрагической лихорадки с почечным синдромом в антропургическом очаге хантавирусной инфекции // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2016; 2-1: 21-24.

7. Максема И.Г., Афанасьева В.В., Слонова Р.А. и др. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом у беременных женщин в Приморском крае // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2013; 2: 47-50.

8. Медицинская вирусология / Ред.: академик Д.К. Львов. М.: МИА, 2008; 655 с.

9. Потт А.Б., Иунихина О.В., Щелканов М.Ю. Подбор системы праймеров для полногеномного секвенирования ортохантавируса Hantaan (Hantaviridae, Bunyavirales) // В сб.: Ветеринарные и биологические аспекты в диагностике и лечении диких животных. Материалы Национальной (Всероссийской) научно-практической конференции (Уссурийск, Россия; 31 марта 2023 г.). Уссурийск: Приморский ГАТУ, 2023; 80-83.

10. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных / Ред.: академик Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 1200 с.

11. Слонова Р.А., Компанец Г.Г., Подогова Л.М и др. Циркуляция хантавируса Сеул в популяциях синантропных грызунов и его значение в заболеваемости геморрагической лихорадкой с почечным синдромом в Приморском крае // Вопросы вирусологии. 1999; 5: 213-217.

12. Слонова Р.А., Компанец Г.Г., Сокотун С.А. и др. Характеристика эпидемического процесса хантавирусной инфекции в очагах циркуляции вирусов Хантаан и Сеул // Тихоокеанский медицинский журнал. 2001; 2: 52-54.

13. Ткаченко Е.А., Ишмухаметов А.А. История изучения этиологии геморрагической лихорадки с почечным синдромом // Медицинский совет. 2017; 4: 86-92. DOI: 10.21518/2079-701X-2017-4-86-92

14. Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Львов Д.К. Коронавирусы человека (Nidovirales, Coronaviridae): возросший уровень эпидемической опасности // Лечащий врач. 2013; 10: 49-54.

15. Щелканов М.Ю., Львов Д.К. Экология: история становления основных концепций // В сб.: Новые и возвращающиеся инфекции в системе биобезопасности Российской Федерации. М.: Издво Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, 2014; 6-20.

16. Щелканов М.Ю., Аристова В.А., Чумаков В.М., Львов Д.К. Историография термина «природный очаг» // В сб.: Новые и возвращающиеся инфекции в системе биобезопасности Российской Федерации. М.: Изд-во Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, 2014; 21-32.

17. Щелканов М.Ю., Ананьев В.Ю., Кузнецов В.В., Шуматов В.Б. Эпидемическая вспышка Ближневосточного респираторного синдрома в Республике Корея (май-июль 2015 г.): причины, динамика, выводы // Тихоокеанский медицинский журнал. 2015; (3): 89-93.

18. Щелканов М.Ю., Дунаева М.Н., Москвина Т.В. и др. Каталог вирусов рукокрылых (2020) // Юг России: экология, развитие. 2020; 15. 3(56): 6-30. DOI: 10.18470/1992-1098-2020-3-6-30

19. Щелканов М.Ю., Леонова Г.Н., Галкина И.В., Андрюков Б.Г. У истоков концепции природной очаговости // Здоровье населения и среда обитания. 2021; (5): 16-25. DOI: 10.35627/2219- 5238/2021-338-5-16-25

20. Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Любченко Е.Н. и др. Рукокрылые: общая характеристика отряда. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2021; 130 с. DOI: 10.24866/7444-5119-6

21. Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Щелканов Е.М. и др. Паукообразные-эктопаразиты рукокрылых. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2022; 126 с. DOI: 10.24866/7444-5377-0

22. Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Щелканов Е.М. и др. Насекомые-эктопаразиты рукокрылых. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2022; 242 с. DOI: 10.24866/7444-5404-3

23. Щелканов М.Ю., Татонова Ю.В., Табакаева Т.В. и др. Эндопаразиты рукокрылых: нематоды. Владивосток: Изд-во ДФВУ, 2023; 112 с. DOI: 10.61726/5457.2024.48.27.001

24. Щелканов М.Ю. Этиология COVID-19 // В кн.: COVID-19: от этиологии до вакцинопрофилактики. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2023; 11-53.

25. Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Компанец Г.Г. и др. Молекулярная эпидемиология патогенных хантавирусов на Дальнем Востоке России, 2015-2018 гг. // Проблемы особо опасных инфекций. 2019; 4: 102-108. DOI: 10.21055/0370-1069-2019-4-102-108

26. Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Здановская Н.И. и др. Новый очаг хантавируса Сеул на Дальнем Востоке России // Проблемы особо опасных инфекций. 2024; 3: 170-177. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-3-170-177

27. Clement J., LeDuc J.W., McElhinney L.M., et al. Clinical characteristics of ratborne Seoul hantavirus disease // Emer. Infect. Dis. 2019; 25(2): 387-388. DOI:10.3201/eid2502.181643

28. Khotimchenko Yu.S., Shchelkanov M.Yu. Viruses of the Ocean: On the shores of the aqua incognita. Horizons of taxonomic diversity // Russian Journal of Marine Biology. 2024; 50(1): 1-24. DOI: 10.1134/S106307402401005X

29. Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Alkhovsky S.V., Deryabin P.G. Zoonotic viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and Ecology. Academic Press, 2015; 452 p.

30. Plyusnin A., Morzunov S.P. Virus evolution and genetic diversity of hantaviruses and their rodent hosts // Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2001; 256: 47-75. DOI: 10.1007/978-3-642-56753-7_4

31. Plyusnina A., Heyman P., Baert K., et al. Genetic characterization of Seoul hantavirus originated from norway rats (Rattus norvegicus) captured in Belgium // J. Med. Virol. 2012; 84(8): 1298-1303. DOI: 10.1002/jmv.23321

32. Yashina L.N., Hay J., Smetannikova N.A., et al. Hemorrhagic fever with renal syndrome in Vladivostok City, Russia // Front. Pub. Health. 2021; 9: 620279. DOI: 10.3389/fpubh.2021.620279

33. Zhang Y.Z. Discovery of hantaviruses in bats and insectivores and the evolution of the genus Hantavirus // Virus Res. 2014; 187: 15-21. DOI: 10.1016/j.virusres.2013.12.035