infectpataogДальневосточный журнал инфекционной патологииFar Eastern Journal of Infectious Pathology2073-2899ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора10.62963/2073-2899-2025-50-94-99infectpataog-536Research ArticleМАТЕРИАЛЫ IX НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКОЙ КОНФЕРЕНЦИИ «АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ИНФЕКЦИОННОЙ ПАТОЛОГИИ НА ДАЛЬНЕМ ВОСТОКЕ РОССИИ», ПРИУРОЧЕННОЙ К 100-ЛЕТИЮ СО ДНЯ ОСНОВАНИЯ ФЕДЕРАЛЬНОГО БЮДЖЕТНОГО УЧРЕЖДЕНИЯ НАУКИ «ХАБАРОВСКИЙ НАУЧНОИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ЭПИДЕМИОЛОГИИ И МИКРОБИОЛОГИИ» ФЕДЕРАЛЬНОЙ СЛУЖБЫ ПО НАДЗОРУ В СФЕРЕ ЗАЩИТЫ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ И БЛАГОПОЛУЧИЯ ЧЕЛОВЕКА (30-31 ОКТЯБРЯ 2025 Г., ХАБАРОВСК)MATERIALS OF THE IX SCIENTIFIC AND PRACTICAL CONFERENCE "TOPICAL ISSUES OF INFECTIOUS PATHOLOGY IN THE RUSSIAN FAR EAST", DEDICATED TO THE 100TH ANNIVERSARY OF THE FOUNDING OF THE KHABAROVSK SCIENTIFIC RESEARCH INSTITUTE OF EPIDEMIOLOGY AND MICROBIOLOGY OF THE FEDERAL SERVICE FOR SUPERVISION OF CONSUMER RIGHTS PROTECTION AND HUMAN WELL-BEING (OCTOBER 30-31, 2025, KHABAROVSK)СИСТЕМА ПРАЙМЕРОВ ДЛЯ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ ОРТОХАНТАВИРУСА СЕУЛPRIMER SYSTEM FOR THE COMPLETE GENOME SEQUENCING OF ORTHOHANTAVIRUS SEOULИунихинаО. В.IunikhinaO. V.

Иунихина Ольга Викторовна - к.м.н., заведующая лабораторией природно-очаговых вирусных инфекций,

доцент кафедры эпидемиологии, микробиологии и паразитологии,

Владивосток

Vladivostok

olga_iun@inbox.ruПоттА. Б.PottA. B.

Владивосток

Vladivostok

ЛубоваВ. А.LubovaV. A.

Владивосток

Vladivostok

ШутиковаА. Л.ShutikovaA. L.

Владивосток

Vladivostok

БеликА. А.BelikA. A.

Владивосток

Vladivostok

ЩелкановМ. Ю.ShchelkanovM. Y.

Владивосток

Vladivostok

НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова Роспотребнадзора; Школа медицины и наук о жизни Дальневосточного федерального университетаРоссияG.Р. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology of Rospotrebnadzor; School of Medicine and Life Sciences, Far Eastern Federal UniversityRussian FederationНИИ эпидемиологии и микробиологии им. Г.П. Сомова РоспотребнадзораРоссияG.Р. Somov Institute of Epidemiology and Microbiology of RospotrebnadzorRussian Federation2025200420260509499Copyright © Иунихина О.В., Потт А.Б., Лубова В.А., Шутикова А.Л., Белик А.А., Щелканов М.Ю., 20262026Иунихина О.В., Потт А.Б., Лубова В.А., Шутикова А.Л., Белик А.А., Щелканов М.Ю.Iunikhina O.V., Pott A.B., Lubova V.A., Shutikova A.L., Belik A.A., Shchelkanov M.Y.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://infectpataog.elpub.ru/jour/article/view/536

Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом (ГЛПС) – природно-очаговая вирусная инфекция широко распространенная на территории Российской Федерации. Ортохантавирус Сеул (Orthohantavirus seoulense), один из возбудителей ГЛПС, – единственный убиквитарно распространенный ортохантавирус, патогенный для человека, ассоциирован с серыми крысами (Rattus norvegicus). В работе представлены результаты подбора и верификации системы праймеров для полногеномного секвенирования O. seoulense.

Hemorrhagic fever with renal syndrome (HFRS) is a natural focal viral infection widespread in the Russian Federation. Orthohantavirus Seoul (Orthohantavirus seoulense), one of etiological agents of HFRS, is the only ubiquitously widespread orthohantavirus pathogenic to humans associated with brown rats (Rattus norvegicus). The paper presents the results of the selection and verification of a primer system for the O. seoulense complete genome sequencing.

ортохантавирус СеулГЛПСпраймерыполногеномное секвенированиенанопоровая технология секвенированияorthohantavirus seoulenseHFRSprimerscomplete genome sequencingnanopore sequencing technologyReferencesЗапорожец Т.С., Беседнова Н.Н., Калинин А.В. и др. 80 лет на страже биологической безопасности у восточных рубежей России // Здоровье населения и среда обитания. 2021; (5): 5-15. DOI: 10.35627/2219-5238/2021-338-5-5-15Запорожец Т.С., Беседнова Н.Н., Калинин А.В. и др. 80 лет на страже биологической безопасности у восточных рубежей России // Здоровье населения и среда обитания. 2021; (5): 5-15. DOI: 10.35627/2219-5238/2021-338-5-5-15Иунихина О.В., Потт А.Б., Панкратов Д.В., Щелканов М.Ю. Актуальность геморрагической лихорадки с почечным синдромом для юга российского Дальнего Востока // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2023; 45(45): 122-123.Иунихина О.В., Потт А.Б., Панкратов Д.В., Щелканов М.Ю. Актуальность геморрагической лихорадки с почечным синдромом для юга российского Дальнего Востока // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2023; 45(45): 122-123.Иванис В.А., Иунихина О.В., Попов А.Ф. и др. Клинико-эпидемиологические аспекты геморрагической лихорадки с почечным синдромом в Приморском крае // Тихоокеанский медицинский журнал. 2024; 4(98): 76-81. DOI: 10.34215/1609-1175-2024-4-76-81Иванис В.А., Иунихина О.В., Попов А.Ф. и др. Клинико-эпидемиологические аспекты геморрагической лихорадки с почечным синдромом в Приморском крае // Тихоокеанский медицинский журнал. 2024; 4(98): 76-81. DOI: 10.34215/1609-1175-2024-4-76-81Компанец Г.Г., Кушнарева Т.В., Максема И.Г. и др. Эпидемиологическая ситуация и меры неспецифической профилактики ГЛПС в очагах циркуляции вируса Сеул // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2008; 13: 187-188.Компанец Г.Г., Кушнарева Т.В., Максема И.Г. и др. Эпидемиологическая ситуация и меры неспецифической профилактики ГЛПС в очагах циркуляции вируса Сеул // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2008; 13: 187-188.Компанец Г.Г., Максема И.Г., Иунихина О.В. и др. Особенности функционирования смешанного очага хантавирусной инфекции на территории Владивостокского городского округа // Тихоокеанский медицинский журнал. 2010; 3(41): 40-43.Компанец Г.Г., Максема И.Г., Иунихина О.В. и др. Особенности функционирования смешанного очага хантавирусной инфекции на территории Владивостокского городского округа // Тихоокеанский медицинский журнал. 2010; 3(41): 40-43.Кузнецова Н.А., Компанец Г.Г., Иунихина О.В. Характерные особенности эпидемиологии геморрагической лихорадки с почечным синдромом в антропургическом очаге хантавирусной инфекции // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2016; 2-1: 21-24.Кузнецова Н.А., Компанец Г.Г., Иунихина О.В. Характерные особенности эпидемиологии геморрагической лихорадки с почечным синдромом в антропургическом очаге хантавирусной инфекции // Международный журнал прикладных и фундаментальных исследований. 2016; 2-1: 21-24.Максема И.Г., Афанасьева В.В., Слонова Р.А. и др. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом у беременных женщин в Приморском крае // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2013; 2: 47-50.Максема И.Г., Афанасьева В.В., Слонова Р.А. и др. Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом у беременных женщин в Приморском крае // Эпидемиология и инфекционные болезни. 2013; 2: 47-50.Медицинская вирусология / Ред.: академик Д.К. Львов. М.: МИА, 2008; 655 с.Медицинская вирусология / Ред.: академик Д.К. Львов. М.: МИА, 2008; 655 с.Потт А.Б., Иунихина О.В., Щелканов М.Ю. Подбор системы праймеров для полногеномного секвенирования ортохантавируса Hantaan (Hantaviridae, Bunyavirales) // В сб.: Ветеринарные и биологические аспекты в диагностике и лечении диких животных. Материалы Национальной (Всероссийской) научно-практической конференции (Уссурийск, Россия; 31 марта 2023 г.). Уссурийск: Приморский ГАТУ, 2023; 80-83.Потт А.Б., Иунихина О.В., Щелканов М.Ю. Подбор системы праймеров для полногеномного секвенирования ортохантавируса Hantaan (Hantaviridae, Bunyavirales) // В сб.: Ветеринарные и биологические аспекты в диагностике и лечении диких животных. Материалы Национальной (Всероссийской) научно-практической конференции (Уссурийск, Россия; 31 марта 2023 г.). Уссурийск: Приморский ГАТУ, 2023; 80-83.Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных / Ред.: академик Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 1200 с.Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных / Ред.: академик Д.К. Львов. М.: МИА, 2013; 1200 с.Слонова Р.А., Компанец Г.Г., Подогова Л.М и др. Циркуляция хантавируса Сеул в популяциях синантропных грызунов и его значение в заболеваемости геморрагической лихорадкой с почечным синдромом в Приморском крае // Вопросы вирусологии. 1999; 5: 213-217.Слонова Р.А., Компанец Г.Г., Подогова Л.М и др. Циркуляция хантавируса Сеул в популяциях синантропных грызунов и его значение в заболеваемости геморрагической лихорадкой с почечным синдромом в Приморском крае // Вопросы вирусологии. 1999; 5: 213-217.Слонова Р.А., Компанец Г.Г., Сокотун С.А. и др. Характеристика эпидемического процесса хантавирусной инфекции в очагах циркуляции вирусов Хантаан и Сеул // Тихоокеанский медицинский журнал. 2001; 2: 52-54.Слонова Р.А., Компанец Г.Г., Сокотун С.А. и др. Характеристика эпидемического процесса хантавирусной инфекции в очагах циркуляции вирусов Хантаан и Сеул // Тихоокеанский медицинский журнал. 2001; 2: 52-54.Ткаченко Е.А., Ишмухаметов А.А. История изучения этиологии геморрагической лихорадки с почечным синдромом // Медицинский совет. 2017; 4: 86-92. DOI: 10.21518/2079-701X-2017-4-86-92Ткаченко Е.А., Ишмухаметов А.А. История изучения этиологии геморрагической лихорадки с почечным синдромом // Медицинский совет. 2017; 4: 86-92. DOI: 10.21518/2079-701X-2017-4-86-92Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Львов Д.К. Коронавирусы человека (Nidovirales, Coronaviridae): возросший уровень эпидемической опасности // Лечащий врач. 2013; 10: 49-54.Щелканов М.Ю., Колобухина Л.В., Львов Д.К. Коронавирусы человека (Nidovirales, Coronaviridae): возросший уровень эпидемической опасности // Лечащий врач. 2013; 10: 49-54.Щелканов М.Ю., Львов Д.К. Экология: история становления основных концепций // В сб.: Новые и возвращающиеся инфекции в системе биобезопасности Российской Федерации. М.: Издво Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, 2014; 6-20.Щелканов М.Ю., Львов Д.К. Экология: история становления основных концепций // В сб.: Новые и возвращающиеся инфекции в системе биобезопасности Российской Федерации. М.: Издво Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, 2014; 6-20.Щелканов М.Ю., Аристова В.А., Чумаков В.М., Львов Д.К. Историография термина «природный очаг» // В сб.: Новые и возвращающиеся инфекции в системе биобезопасности Российской Федерации. М.: Изд-во Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, 2014; 21-32.Щелканов М.Ю., Аристова В.А., Чумаков В.М., Львов Д.К. Историография термина «природный очаг» // В сб.: Новые и возвращающиеся инфекции в системе биобезопасности Российской Федерации. М.: Изд-во Первого МГМУ им. И.М. Сеченова, 2014; 21-32.Щелканов М.Ю., Ананьев В.Ю., Кузнецов В.В., Шуматов В.Б. Эпидемическая вспышка Ближневосточного респираторного синдрома в Республике Корея (май-июль 2015 г.): причины, динамика, выводы // Тихоокеанский медицинский журнал. 2015; (3): 89-93.Щелканов М.Ю., Ананьев В.Ю., Кузнецов В.В., Шуматов В.Б. Эпидемическая вспышка Ближневосточного респираторного синдрома в Республике Корея (май-июль 2015 г.): причины, динамика, выводы // Тихоокеанский медицинский журнал. 2015; (3): 89-93.Щелканов М.Ю., Дунаева М.Н., Москвина Т.В. и др. Каталог вирусов рукокрылых (2020) // Юг России: экология, развитие. 2020; 15. 3(56): 6-30. DOI: 10.18470/1992-1098-2020-3-6-30Щелканов М.Ю., Дунаева М.Н., Москвина Т.В. и др. Каталог вирусов рукокрылых (2020) // Юг России: экология, развитие. 2020; 15. 3(56): 6-30. DOI: 10.18470/1992-1098-2020-3-6-30Щелканов М.Ю., Леонова Г.Н., Галкина И.В., Андрюков Б.Г. У истоков концепции природной очаговости // Здоровье населения и среда обитания. 2021; (5): 16-25. DOI: 10.35627/2219- 5238/2021-338-5-16-25Щелканов М.Ю., Леонова Г.Н., Галкина И.В., Андрюков Б.Г. У истоков концепции природной очаговости // Здоровье населения и среда обитания. 2021; (5): 16-25. DOI: 10.35627/2219- 5238/2021-338-5-16-25Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Любченко Е.Н. и др. Рукокрылые: общая характеристика отряда. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2021; 130 с. DOI: 10.24866/7444-5119-6Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Любченко Е.Н. и др. Рукокрылые: общая характеристика отряда. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2021; 130 с. DOI: 10.24866/7444-5119-6Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Щелканов Е.М. и др. Паукообразные-эктопаразиты рукокрылых. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2022; 126 с. DOI: 10.24866/7444-5377-0Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Щелканов Е.М. и др. Паукообразные-эктопаразиты рукокрылых. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2022; 126 с. DOI: 10.24866/7444-5377-0Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Щелканов Е.М. и др. Насекомые-эктопаразиты рукокрылых. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2022; 242 с. DOI: 10.24866/7444-5404-3Щелканов М.Ю., Табакаева Т.В., Щелканов Е.М. и др. Насекомые-эктопаразиты рукокрылых. Владивосток: Изд-во ДВФУ, 2022; 242 с. DOI: 10.24866/7444-5404-3Щелканов М.Ю., Татонова Ю.В., Табакаева Т.В. и др. Эндопаразиты рукокрылых: нематоды. Владивосток: Изд-во ДФВУ, 2023; 112 с. DOI: 10.61726/5457.2024.48.27.001Щелканов М.Ю., Татонова Ю.В., Табакаева Т.В. и др. Эндопаразиты рукокрылых: нематоды. Владивосток: Изд-во ДФВУ, 2023; 112 с. DOI: 10.61726/5457.2024.48.27.001Щелканов М.Ю. Этиология COVID-19 // В кн.: COVID-19: от этиологии до вакцинопрофилактики. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2023; 11-53.Щелканов М.Ю. Этиология COVID-19 // В кн.: COVID-19: от этиологии до вакцинопрофилактики. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2023; 11-53.Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Компанец Г.Г. и др. Молекулярная эпидемиология патогенных хантавирусов на Дальнем Востоке России, 2015-2018 гг. // Проблемы особо опасных инфекций. 2019; 4: 102-108. DOI: 10.21055/0370-1069-2019-4-102-108Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Компанец Г.Г. и др. Молекулярная эпидемиология патогенных хантавирусов на Дальнем Востоке России, 2015-2018 гг. // Проблемы особо опасных инфекций. 2019; 4: 102-108. DOI: 10.21055/0370-1069-2019-4-102-108Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Здановская Н.И. и др. Новый очаг хантавируса Сеул на Дальнем Востоке России // Проблемы особо опасных инфекций. 2024; 3: 170-177. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-3-170-177Яшина Л.Н., Сметанникова Н.А., Здановская Н.И. и др. Новый очаг хантавируса Сеул на Дальнем Востоке России // Проблемы особо опасных инфекций. 2024; 3: 170-177. DOI: 10.21055/0370-1069-2024-3-170-177Clement J., LeDuc J.W., McElhinney L.M., et al. Clinical characteristics of ratborne Seoul hantavirus disease // Emer. Infect. Dis. 2019; 25(2): 387-388. DOI:10.3201/eid2502.181643Clement J., LeDuc J.W., McElhinney L.M., et al. Clinical characteristics of ratborne Seoul hantavirus disease // Emer. Infect. Dis. 2019; 25(2): 387-388. DOI:10.3201/eid2502.181643Khotimchenko Yu.S., Shchelkanov M.Yu. Viruses of the Ocean: On the shores of the aqua incognita. Horizons of taxonomic diversity // Russian Journal of Marine Biology. 2024; 50(1): 1-24. DOI: 10.1134/S106307402401005XKhotimchenko Yu.S., Shchelkanov M.Yu. Viruses of the Ocean: On the shores of the aqua incognita. Horizons of taxonomic diversity // Russian Journal of Marine Biology. 2024; 50(1): 1-24. DOI: 10.1134/S106307402401005XLvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Alkhovsky S.V., Deryabin P.G. Zoonotic viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and Ecology. Academic Press, 2015; 452 p.Lvov D.K., Shchelkanov M.Yu., Alkhovsky S.V., Deryabin P.G. Zoonotic viruses of Northern Eurasia. Taxonomy and Ecology. Academic Press, 2015; 452 p.Plyusnin A., Morzunov S.P. Virus evolution and genetic diversity of hantaviruses and their rodent hosts // Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2001; 256: 47-75. DOI: 10.1007/978-3-642-56753-7_4Plyusnin A., Morzunov S.P. Virus evolution and genetic diversity of hantaviruses and their rodent hosts // Curr. Top. Microbiol. Immunol. 2001; 256: 47-75. DOI: 10.1007/978-3-642-56753-7_4Plyusnina A., Heyman P., Baert K., et al. Genetic characterization of Seoul hantavirus originated from norway rats (Rattus norvegicus) captured in Belgium // J. Med. Virol. 2012; 84(8): 1298-1303. DOI: 10.1002/jmv.23321Plyusnina A., Heyman P., Baert K., et al. Genetic characterization of Seoul hantavirus originated from norway rats (Rattus norvegicus) captured in Belgium // J. Med. Virol. 2012; 84(8): 1298-1303. DOI: 10.1002/jmv.23321Yashina L.N., Hay J., Smetannikova N.A., et al. Hemorrhagic fever with renal syndrome in Vladivostok City, Russia // Front. Pub. Health. 2021; 9: 620279. DOI: 10.3389/fpubh.2021.620279Yashina L.N., Hay J., Smetannikova N.A., et al. Hemorrhagic fever with renal syndrome in Vladivostok City, Russia // Front. Pub. Health. 2021; 9: 620279. DOI: 10.3389/fpubh.2021.620279Zhang Y.Z. Discovery of hantaviruses in bats and insectivores and the evolution of the genus Hantavirus // Virus Res. 2014; 187: 15-21. DOI: 10.1016/j.virusres.2013.12.035Zhang Y.Z. Discovery of hantaviruses in bats and insectivores and the evolution of the genus Hantavirus // Virus Res. 2014; 187: 15-21. DOI: 10.1016/j.virusres.2013.12.035

The authors declare that there are no conflicts of interest present.