ВОЗМОЖНОСТЬ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТИПИРОВАНИЯ ВИЧ-1 В ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОЙ ПРАКТИКЕ В ДАЛЬНЕВОСТОЧНОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
Аннотация
Цель работы – охарактеризовать современную эпидемиологическую ситуацию по ВИЧ-инфекции в Дальневосточном федеральном округе (ДФО), оценить молекулярно-генетическое разнообразие вируса иммунодефицита человека и продемонстрировать возможность использования полученных результатов исследования в практической эпидемиологии.
Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ эпидемической ситуации по ВИЧинфекции в ДФО за 2006-2018 гг. с использованием показателей пораженности и заболеваемости. Молекулярно-генетическим анализом охвачено 211 образцов плазмы крови от ВИЧинфицированных пациентов, проживающих на территории Дальневосточного федерального округа. Нуклеотидные последовательности генома ВИЧ-1 выявляли методом секвенирования амплифицированных фрагментов гена pol, кодирующей протеазу и часть обратной транскриптазы ВИЧ-1. Филогенетический анализ выполняли с помощью программы MEGA версии 6.0, путем построения филогенетических деревьев методом ближайших соседей.
Результаты исследования. В ДФО отмечен поступательный характер динамики эпидемического процесса с темпами ежегодного прироста заболеваемости ВИЧ-инфекцией, опережающими среднероссийские показатели. Эпидемии ВИЧ-инфекции в ДФО свойственна выраженная территориальная неравномерность проявлений. Наибольшая интенсивность эпидемического процесса реализуется в регионах с приграничным расположением к КНР (Приморский и Хабаровский края). Проведенное молекулярно-генетическое исследование показало, что на большинстве анализируемых территорий ДФО продолжает доминировать генетический вариант IDU-A, на долю которого пришлось 70,1±3,2%. В ДФО отмечена циркуляция субтипа В, который был выявлен в 14 случаях (6,6±1,7%), и субтипа С, идентифицированного у 4 (1,9±0,9%) ВИЧ-инфицированных округа. Среди остальных обследованных ВИЧ-инфицированных пациентов ДФО обнаружены рекомбинантные формы ВИЧ-1 и определён их спектр.
Заключение. Результаты молекулярно-генетических исследований могут быть использованы в выявлении завозных случаев заболевания, эпидемиологической связи между случаями ВИЧ-инфицирования, возможных путей заражения и географического распространения возбудителей.
Об авторах
В. О. КотоваРоссия
Котова Валерия Олеговна – заведующая лабораторией эпидемиологии и профилактики ВИЧ-инфекции и вирусных гепатитов
Хабаровск
Е. А. Базыкина
Россия
Хабаровск
Л. А. Балахонцева
Россия
Хабаровск
О. Е. Троценко
Россия
Хабаровск
Список литературы
1. Богачев В.В., Тотменин А.В., Барышев П.Б. и др. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1 субтипов А и В, выделенных на территории Новосибирской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2012.- № 6. - С.45–52.
2. Вазкез де Парга Е., Рахманова А.Г., Перез-Альварез Л. и др. Анализ мутаций, связанных с лекарственной резистентностью, у нелеченных пациентов, зараженных различными генетическими формами ВИЧ 1 типа, распространенными в странах бывшего Советского Союза // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. – 2009. - № 1 (2). –С. 50–56.
3. Гашникова Н.М., Сафронов П.Ф., Никонорова Ю.В., Унагаева Н.В., Лаптева Т.А. Свойства изолятов CRF02_AG ВИЧ-11, циркулирующих на территории Новосибирской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2011. - №3. – С. 38–43.
4. Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. – 2011. - № 3(4). – С. 34–43.
5. Калачёва Г.А., Довгополюк Е.С., Мордык А.В. и др. Эпидемиологическая ситуация сочетанной патологии ВИЧ-инфекции, туберкулеза и наркомании в Сибирском федеральном округе // Сибирское медицинское обозрение. - 2011. - №6 (72). - C. 40-43.
6. Конькова-Рейдман А.Б., Селютина Л.И., Кузюкин Н.Н., Рухтина О.Л., Буланьков Ю.И. ВИЧинфекция в Южно-Уральском регионе России на современном этапе: анализ эпидемиологической ситуации и новые подходы к оценке эффективности системы противодействия эпидемии //Журнал инфектологии. - 2016. - Т. 7, №. 4. - С. 77-82.
7. Сандырева, Т. П., Герасимова, Н. А., Лопатухин, А. Э., Киреев, Д. Е., Куевда, Д. А., Шипулин, Г. А., Подымова, А. С. Филогенетический анализ в эпидемиологических расследованиях случаев ВИЧинфекции // Эпидемиология и инфекционные болезни. – 2014. - № 1. - С. 117-121.
8. Смольская Т.Т., Огурцова С.В. Обзор состояния эпидемии ВИЧ-инфекции в Северо-Западном федеральном округе РФ в 1987-2009 гг. // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. - 2011. - Т. 3, №. 1. - С. 27-36.
9. Справка Федерального научно-методического центра по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН Центральный НИИЭ Роспотребнадзора: ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2018 году. - 4 с.
10. Справка Федерального научно-методического центра по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН Центральный НИИЭ Роспотребнадзора: ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2019 году. – 4 с.
11. Стратегия ЮНЭЙДС, 2016.
12. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. – 2013. - №15(4). – С. 204–12.
13. Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeter M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature. Infect Genet Evol. 2016; 46: 150–158.
14. Montavon C, Vergne L, Bourgeois A., Mpoudi-Ngole E., Malonga-Mouellet G., Butel C. et al. Identification of a new circulating recombinant form of HIV type 1, CRF11-cpx, involving subtypes A, G, J, and CRF01-AE, in Central Africa. AIDS Res Hum Retroviruses. 2002; 18(3):231-6.
15. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Molecular Biology and Evolution. 2013; (30): 2725-29.
16. WHO Fact sheet. HIV/AIDS, 17 July 2019.
Рецензия
Для цитирования:
Котова В.О., Базыкина Е.А., Балахонцева Л.А., Троценко О.Е. ВОЗМОЖНОСТЬ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОГО ТИПИРОВАНИЯ ВИЧ-1 В ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОЙ ПРАКТИКЕ В ДАЛЬНЕВОСТОЧНОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2020;(38):69-79.
For citation:
Kotova V.O., Bazykina E.A., Balakhontseva L.A., Trotsenko O.E. APPLICATION OF RESULTS OF HIV-1 MOLECULAR-GENETIC TYPING IN EPIDEMIOLOGICAL PRACTICE IN THE FAR EASTERN FEDERAL DISTRICT OF THE RUSSIAN FEDERATION. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2020;(38):69-79. (In Russ.)