ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЕ И МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ИНФЕКЦИИ COVID-19 В ПЯТУЮ ВОЛНУ ПАНДЕМИИ В СУБЪЕКТАХ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

Пятая волна пандемии COVID-19 пришлась в Дальневосточном федеральном округе (ДФО) Российской Федерации на зимне-весенний период 2022  г.  с  максимумом  числа  заболевших (931,3 _0/0000) в шестую календарную неделю (с 7 по 13 февраля). Признаками территориальной неравномерности заболеваемости стали наиболее высокие её показатели в Республике Саха (Якутия), а также выраженная нестабильность уровней в трёх субъектах: Сахалинской, Амурской и Еврейской автономной областях. В целом по ДФО отмечена тенденция уменьшения недельного показателя летальности от новой коронавирусной инфекции (с 1,8 до 1,34%) и установлена обратная, статистически значимая зависимость показателей летальности от вклада в заболеваемость геноварианта Omicron. Последний к началу десятой календарной недели 2022 года (с 7 по 13 марта) полностью вытеснил вариант Delta. При этом, долевое соотношение двух генетических линий варианта Omicron в динамике изменялось: для ВА.1 характерным оказался рост удельного веса с последующим его снижением, для линии ВА.2 – еженедельное возрастание активности циркуляции среди населения. Выявлена значимая прямая связь показателей заболеваемости с долевым распределением линии ВА.1, а для линии ВА.2 – с удельным весом привитых лиц в структуре заболевших COVID-19. Общими для субъектов ДФО причинами роста заболеваемости COVID-19 и снижения показателей летальности от инфекции в пятую волну пандемии стали завоз и дальнейшее стремительное распространение нового генетического варианта Omicron, обладающего по сравнению с предыдущим вариантом Delta большей степенью заразности и умения обходить иммунный ответ, сформированный в результате вакцинации или после заболевания, а также способностью вызывать более легкие формы течения заболевания.

1. Антонец Д.В., Старчевская М.Е., Колосова Н.П., Суслопаров И.М., Даниленко А.В., Боднев С.А., Швалов А.Н., Трегубчак Т.В., Рыжиков А.Б., Пьянков О.В., Максютов Р.А. 2022. Предварительный анализ генетической изменчивости изолятов вируса SARS-CoV-2, относящихся к варианту Омикрон, циркулирующих на территории Российской Федерации. COVID-19-PREPRINTS.MICROBE.RU. https://doi.org/10.21055/preprints-3112049.

2. Молекулярно-генетический мониторинг штаммов возбудителя новой коронавирусной инфекции: Методические рекомендации МР 3.1.0272-22 / Роспотребнадзор, 2022.

3. Савилов Е.Д. Статистические методы анализа. – М.: Наука-Центр, 2011. – 156 с.

4. Эпидемиологический анализ: учебное пособие / А.В. Слободенюк, А.А. Косова, Р.Н. Ан. – Екатеринбург: Изд. ГБОУ ВПО УГМУ Минздрава России, 2015. – 36 с.

5. Dzinamarira T. et al. Unpacking the Implications of SARS-CoV-2 Breakthrough Infections on COVID-19 Vaccination Programs //Vaccines. – 2022. – vol. 10. – №. 2. – С. 252.

6. Gaspersic J., Dolzan V. Viral and Host Genetic and Epigenetic Biomarkers Related to SARS-CoV-2 Cell Entry, Infection Rate, and Disease Severity //Biology. – 2022. – vol. 11. – №. 2. – p. 178.

7. Guo T., Fan Y., Chen M. et al. Cardiovascular implications of fatal outcomes of patients with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). JAMA Cardiol. 2020; e201017. Doi: 10.1001/Jamacardio.2020.1017.

8. Kuster G.M., Pfister O., Burkardet T. et al. SARS-CoV-2: should inhibitors of the renin-angiotensin system be withdrawn in patients with COVID-19. Eur Heart J. 2020; 41 (19): 1801-1803. Doi: 10.1093/eurheart/ehaa235.

9. Peacock T.P., Sheppaed C.M., Brown J.C., Goonawardane N., Zhou J., Whiteley M. et al. The SARSCoV-2 variants associated with infections in India, B.1.617, show enhanced spike cleavage by furin. bioRxiv (2021). DOI: 10.1101/2021.05.28.446163.

10. SeyedAlinaghi S, Mirzapour P, Dadras O. et al. Characterization of SARS-CoV-2 different variants and related morbidity and mortality: a systematic review. Eur J Med Res. 2021; 26(1):51. Published 2021 Jun 8. doi:10.1186/s40001-021-00524-8.

11. Suzuki R., Yamasoda D., Kimura I., Wang L., Kishimoto M., Ito J. et al. Attenuated fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron variant. Nature (2022). DOI: 10.1038/s41586-022-04462-1.

12. Tracking SARS-CoV-2 variants. https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants (дата обращения: 26.01.22).

13. Ulrich L., Halwe N.J., Taddeo A., Ebert N., Schon J., Devisme C. et al. Enhanced fitness of SARSCoV-2 variant of concern Alpha but not Beta. Nature (2021). 602 (7896): 307-3013. DOI: 10.1038/s41586-021-04342-0.

14. Willet B.J., Grove J., MacLean O.A., Wilkie C., Logan N., De Lorenzo G. et al. The hyper-transmissible SARS-CoV-2 Omicron variant exhibits significant antigenic change, vaccine escape and a switch in cell entry mechanism. medRxiv (2022). DOI: 10.1101/2022.01/03.21268111.

15. Yi S, Kim JM, Choe YJ, et al. SARS-CoV-2 Delta Variant Breakthrough Infection and Onward Secondary Transmission in Household. J Korean Med Sci. 2022; 37(1):e12. Published 2022 Jan 3. doi:10.3346/jkms.2022.37.e12.

16. Zhou F., Yu T., Du R. et al. Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study. Lancet. 2020; 395(10229): 1054-1062. Doi: 10.1016/S0140-6736(20)30566-3.