Мониторинг неферментирующих грамотрицательных бактерий, выделенных от больных пневмонией в стационарах города Хабаровска в период пандемии COVID-19 (май 2020 - июнь 2022 гг.)

В работе представлены результаты микробиологического изучения 301 клинического изолята неферментирующих грамотрицательных бактерий (НГОБ), выделенных от 1740 больных пневмонией, находящихся в четырех стационарах г. Хабаровска в период пандемии COVID-19 (май 2020 - июнь 2022 гг). Проанализированы уровни выделения и структура возбудителей, а также резистентность 15 наименований НГОБ к антимикробным лекарственным средствам. Установлено, что в структуре НГОБ, выделенных в данный период, ведущими патогенами являлись Acinetobacter baumannii (59,5%), Pseudomonas aeruginosa (21,6%) и Stenotrophomonas maltophilia (7,0%). На долю остальных 12 видов приходилось 11,9 %. Определен высокий уровень доли карбапенем-резистентных штаммов.

1. Боронина Л.Г., Кукушкина М.П., Крутова К.В. и др. Род Chryseobacterium (Flavobacterium): клиническое значение, идентификация, чувствительность к антибиотикам // КМАХ. – 2003. – Т. 5, № 3. – С. 195-298.

2. Воронина О.Л., Кунда М.С., Рыжова Н.Н. и др. Разнообразие и опасность Achromobacter spp., поражающих дыхательные пути больных муковисцидозом // Пульмонология. – 2015. – Т. 25, № 4. – С. 389-402.

3. Воронина О.Л., Кунда М.С., Рыжова Н.Н. и др. Закономерности селекции полигостальных убиквитарных микроорганизмов на примере представителей трех таксонов // Молекулярная биология. – 2015. – Т. 49, № 3. – С. 430–441. DOI: 10.7868/S0026898415030179.

4. Воронина О.Л., Чернуха М.Ю., Шагинян И.А. и др. Характеристика генотипов штаммов Burkholderia cepacia complex, выделенных от больных в стационарах Российской Федерации // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2013. – Т. 2. – С. 20–30.

5. Демиховская Е.В. Неферментирующие бактерии в аспекте множественной антибиотикорезистентности возбудителей внутрибольничных инфекций // Болезни и антибиотики. – 2012 г. – Т.1, № 6. – С. 1-6.

6. Зайцева В.Н., Рогачева Т.А., Анисько Л.А. и др. Анализ распространенности неферментирующих грамотрицательных бактерий и их резистентности к антимикробным препаратам // Клиническая инфектология и паразитология. – 2020. – Т. 9, № 2. – C. 151-160.

7. Красовский С.А., Никонова В.С., Каширская Н.Ю. и др. Клинико-генетическая, микробиологическая и функциональная характеристика больных муковисцидозом, проживающих в Москве и Московской области // Вопросы современной педиатрии. – 2013. – Т. 12, №1 . С – 24–30.

8. Махмутова В.Р., Гембицкая Т.Е., Черменский А.Г. и др. Мониторинг инфицирования и резистентности Achromobacter xylosoxidans у взрослых пациентов с муковисцидозом // РМЖ. Медицинское обозрение. – 2021. – Т.7. – С. 462-467.

9. Национальный консенсус (2-е изд-е) «Муковисцидоз: определение, диагностические критерии, терапия» / Под ред. Е.И. Кондратьевой, Н.Ю. Каширской, Н.И. Капранова. – 2018. – C. 47-52.

10. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В. и др. Этиология внебольничных пневмоний в период эпидемического распространения COVID-19 и оценка риска возникновения пневмоний, связанных с оказанием медицинской помощи // Здоровье населения и среда обитания. – 2021. – Т. 29, №7. – С. 67-75. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-29-7-67-75

11. Рекомендации МАКМАХ «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам» Версия 2021-01.

12. Решедько Г.К., Рябкова Е.Л., Фаращук А.Н. и др. Неферментирущие грамотрицательные возбудители нозокомиальных инфекций в ОРИТ России: проблемы антибиотикорезистентности // КМАХ. – 2006. – Т. 8, №3. – С. 243-260.

13. Хасанова Г.Ф., Мавзютов А.Р., Мирсаяпова И.А. и др. Этиологическое значение и антибиотикочувствительность неферментирующих грамотрицательных бактерий в клинической практике // Медицинский вестник Башкортостана. – 2012. – Т. 7, № 1. – С. 63-65.

14. Чеботарь И.В., Бочарова Ю.А. Загадочный Achromobacter // КМАХ. – 2022. – Т. 24, №1. – С.4-13. DOI: 10.36488/cmac.2022.1.4-13.

15. Черненькая Т.В., Годков М.А. «Проблемные» полирезистентные бактерии — возбудители внутрибольничных инфекций у пациентов в критических состояниях (обзор литературы) // Журнал им. Н.В. Склифосовского «Неотложная медицинская помощь». – 2015. – Т.3. – С. 30-35.

16. Шагинян И.А., Чернуха М.Ю. Неферментирующие грамотрицательные бактерии в этиологии внутрибольничных инфекций: клинические, микробиологические и эпидемиологические особенности // Болезни и возбудители. – 2005. – Т. 7, № 3. – С. 271-285.

17. Asano K., Tada S., Matsumoto T. et al. A novel bacterium Achromobacter xylosoxidans as a cause of liver abscess: three case reports // J. Hepatol. – 2005. – Vol.43, № 2. – P. 362-365. DOI: 10.1016/j.jhep.2005.03.031.

18. Busse H.-J., Auling G. Achromobacter // In: Bergey’s Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. – 2015. – DOI: 10.1002/9781118960608.gbm00926.

19. Duggan J., Goldstein S., Chenoweth C. et al. Achromobacter xylosoxidans Bacteremia: Report of Four Cases and Review of the Literature // Clinical Infectious Diseases. – 1996. – Vol. 23, № 3. – P. 569–576. https://doi.org/10.1093/clinids/23.3.569.

20. European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Intrinsic Resistance and Unusual Phenotypes. Version 3.3, October 2021. – https://www.eucast.org/clinical_breakpoints, Accessed January 2022.

21. Frans de Baets F., Schelstraete P., van Daele S. et al. Achromobacter xylosoxidans in cystic fibrosis: prevalence and clinical relevance // J. Cyst. Fibros. – 2007. – Vol. 6, № 1. – P.75–78.

22. Gradon J.D, Mayer A.R., J. Hayes Pulmonary аbscess associated with Alcaligenes xylosoxidans in a patient with AIDS // Clin. Infec. Diseases. – 1993. – Vol. 17, №6. – P. 1071-1072.

23. Hansen C.R., Pressler T., Nielsen K.G. et al. Inflammation in Achromobacter xylosoxidans in fected cystic fibrosis patients // J. Cyst. Fibros. – 2010. – Vol.9, №1. – P. 51-58. DOI: 10.1016/j.jcf.2009.10.005.

24. Kanellopoulou M., Pournaras S., Iglezos H. et al. Persistent colonization of nine cystic fibrosis patients with an Achromobacter (Alcaligenes) xylosoxidans clone // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. – 2004. – Vol. 23, № 4. – P. 336–339.

25. Magni A., Trancassini M., Varesi P. et al. Achromobacter xylosoxidans Genomic Characterization and Correlation of Randomly Amplified Polymorphic DNA Profiles of Cystic Fibrosis Patients // J. Clin. Microbiol. – Vol. 48, № 4. – P. 1035 – 1039.

26. Marion-Sanchez K., Lion F., Olive C., et al. Mediastinitis superinfected by Achromobacter xylosoxidans. A case report // Journal of Infection and Chemotherapy. – 2018. – Vol. 24. – P. 987-989.

27. Marsac C., Berdah L., Thouvenin G. et al. Achromobacter xylosoxidans airway infection is associated with lung disease severity in children with cystic fibrosis // ERJ Open Research. – 2021. – Vol. 7, № 2. – P. 00076-2021. DOI:10.1183/23120541.00076-2021.

28. Morrison A.J., Boyes K. Peritonitis due to Alcaligenes denitrificans subsp. xylosoxydans: a clinical case and review of the literature // J. Clin. Microbiol. – 1986. – Vol. 24. – P. 879-881.

29. Peltroche-Llacsahuanga H., Haase G., Kentrup H. Persistent airway colonization with Alcaligenes xylosoxidans in two brothers with cystic fibrosis [letter] // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. – 1998. – Vol. 17, № 2 – P. 132–134.

30. Reverdy M.E., Freney J., Fleurette J. et al. Nosocomial colonization and infection by Achromobacter xylosoxidans // J. Clin. Microbiol. – 1984. – Vol.19, №2. – P. 140–143. – DOI: 10.1128/jcm.19.2.140-143.1984.

31. Ridderberg W., Bendstrup K.E., Olesen H.V. et al. Marked increase in incidence of Achromobacter xylosoxidans infections caused by sporadic acquisition from the environment // J. Cyst. Fibros. – 2011. – Vol. 10. – P. 466 – 469.

32. Ronin E., Derancourt C., Cabié A. Achromobacter spp. Surgical site infections: a systematic review of case reports and case series // Microorganisms. – 2021. – Vol.9, № 12. DOI: 10.3390/microorganisms9122471.

33. Sindhu S. Achromobacter meningitis in the newborn // J. Singapore Paediatr. Soc. – 1971. – Vol.13, №1. – P. 31-36.

34. Somayaji R., Stanojevic S., Tullis D.E. et al. Clinical outcomes associated with Achromobacter species infection in patients with cystic fibrosis //Annals of the American Thoracic Society. – 2017. – Vol. 4, № 9. – P. 1412-1418 DOI: 10.1513/AnnalsATS.201701-071OC.

35. Swenson C.E., Sadikot R.T. Achromobacter respiratory infections // Annals of the American Thoracic Society. – 2015. – Vol.12. – P. 252-258. DOI: 10.1513/AnnalsATS.201406-288FR.

36. The Main Site PubMLST of the Faculty of Zoology. Great Britain, Oxford: Oxford of University. https://pubmlst.org/bigsdb?db=pubmlst_achromobacter_isolates

37. Trancassini M., Iebba V., Citera N. et al. Outbreak of Achromobacter xylosoxidans in an Italian Cystic fibrosis center: genome variability, biofilm production, antibiotic resistance, and motility in isolated strains // Front. Microbiol. – 2014. – Vol. 5. – P. 138.

38. Yabuuchi E., Yano I. Achromobacter gen. nov. and Achromobacter xylosoxidans (ex Yabuuchi and Ohyama 1971) norn. rev // Int. J. Syst. Bacteriol. – 1981. – Vol. 31, № 4. – P. 477–478.