Preview

Дальневосточный журнал инфекционной патологии

Расширенный поиск

МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ЦИРКУЛЯЦИИ ЭНТЕРОВИРУСОВ В ДАЛЬНЕВОСТОЧНОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2014-2015 ГОДАХ

Аннотация

Энтеровирусная инфекция остается актуальной проблемой для населения всего мира, при этом заболеваемость в странах Азиатско-Тихоокеанского региона выше, чем в Европейских странах и странах Америки. На территории Дальневосточного федерального округа Российской Федерации ежегодно регистрируются подъемы заболеваемости. При исследовании проб клинического материала молекулярно-биологическим методом в период с 2014 по 2015 годы получено и идентифицировано 512 нуклеотидных последовательностей. Наиболее распространенными были серотипы Коксаки A-6 и ЕСНО-30. Все штаммы Коксаки А-6, согласно классификации Y.Q. He (2013 г.), отнесены к генотипу D и в пределах данного генотипа разделены на три субтипа (D1, D2 и D3). Типированные нами штаммы энтеровируса ЕСНО-30 принадлежат к генотипу Н, по классификации J.Bailly (2009 г.).

Об авторах

Елена Юрьевна Сапега
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


Л. В. Бутакова
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


В. О. Котова
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


Е. Н. Амяга
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


О. Е. Троценко
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


Список литературы

1. Онищенко Г.Г., Осипова Т.В., Грачева Е.В. и др. Сезон энтеровирусного серозного менингита в Нижнем Новгороде в 2007 году: молекулярно-эпидемиологические аспекты// Журнал микробиологии - 2009. - №2.- С.24-30.

2. Шишко Л.А., Романенкова Н. И., Бичурина М. А. и др. Этиология сезонных подъемов заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Архангельской области // Инфекция и иммунитет. - 2013. - Т. 3, №1. - С. 65-72.

3. Энтеровирусы [Электронный ресурс] Режим доступа: http://www.picornaviridae.com/enterovirus/enterovirus.htm

4. Bailly J.L., Mirand A., Henquell C. at al. Phylogeography of circulating populations of human echovirus 30 over 50 years: nucleotide polymorphism and signature of purifying selection in the VP1 capsid protein gene.// Infect. Genet. Evol. - 2009. - Vol. 9. - № 4. - P. 699-708.

5. Batts A.F., Jalalat S.Z., Hunter-Ellul L. at al. Exacerbation of bullous pemphigoid after hand, foot, and mouth disease treated with rituximab.// JAAD Case Rep. - 2016. - Vol. 8. - № 2(1). - P. 7-9.

6. Buttery V.W., Kenyon C., Grunewald S. at al. Atypical Presentations of Hand, Foot, and Mouth Disease caused by Coxsackievirus A6-Minnesota, 2014.// MMWR. - 2015. - Vol. 31. - № 64(29). - P. 805.

7. Chatproedprai S., Tempark T., Wanlapakorn N., at al. Unusual skin manifestation of hand, foot and mouth disease associated with coxsackievirus A6: cases report.// Springerplus. - 2015. - Vol. 17. - № 4. - P. 362.

8. Drummond A.J., Rambaut A. BEAST: Bayesian evolutionary analysis by sampling trees // BMC Evol Biol - 2007. - Vol. 7. - P. 214.

9. Henry M., Feder Jr., Nicholas Bennett, MBB Chir, John F. Modli. Atypical hand, foot, and mouth disease: a vesiculobullous eruption caused by Coxsackievirus A6. // The Lancet Infectious Disease. - Vol. 14. - №1. - Р. 83-86

10. Hong Xiao, Keyong Huang, Ling Li et al. Complete genome sequence analysis of human echovirus 30 isolated during a large outbreak in Guangdong Province of China, in 2012. //Arch Virol - 2014. - Vol. 159. - P. 379-383.

11. Hye-Jin Kim, Byounghak Kang, Seoyeon Hwang et al. Epidemics of viral meningitis caused by echovirus 6 and 30 in Korea in 2008. // Virology Journal - 2012. - Vol. 9. - P. 38.

12. Kobayashi M., Makino T., Hanaoka N. at al. Clinical Manifestations of Coxsackievirus A6 Infection Associated with a Major Outbreak of Hand, Foot, and Mouth Disease in Japan. // Jpn. J. Infect. Dis. - 2013. - Vol. 66. - P. 260-261.

13. Leveque N., Jacques J., Renois F. at al. Phylogenetic analysis of Echovirus 30 isolated during the 2005 outbreak in France reveals existence of multiple lineages and suggests frequent recombination events.// J. Clin. Virol. - 2010. - Vol. 48. - № 2. - P. 137-141.

14. Molecular evolution, phylogenetics and epidemiology [Электронный ресурс] Режим доступа: http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/

15. Nix W.A, Oberste M.S, Pallansch M.A. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens. //J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44. - № 8. - P. 2698-704.

16. Osterback R., Koskinen S., Merilahti P. at al. Genome Sequence of Coxsackievirus A6, Isolated during a Hand-Foot-and-Mouth Disease Outbreak in Finland in 2008. // Genome Announc. - 2014. - № 16. - 2(5).

17. Österback R., Vuorinen T., Mervi Linna at al. Coxsackievirus A6 and Hand, Foot, and Mouth Disease, Finland. // Emerg. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 15. - № 9. - P. 1485-1488.

18. Renert-Yuval Y., Marva E., Weil M. at al. Coxsackievirus A6 Polymorphic Exanthem in Israeli Children.// Acta. Derm. Venereol. - 2016. - Vol. 12. - № 96 (4). - P. 546-9.

19. Roth B, Enders M, Arents A. at al. Epidemiologic aspects and laboratory features of enterovirus infections in Western Germany, 2000-2005.// J.Med.Virol. - 2007. - Vol. 79. - P. 956-962.

20. Sinclair C., Gaunt E., Simmonds P. at al. Atypical hand, foot, and mouth disease associated with coxsackievirus a6 infection, edinburgh, united kingdom, january to february 2014. // Eurosurveillance. - 2014. - Vol. 19. - № 12. - P. 27.

21. Vuorinen T., Osterback R., Kuisma J. at al. Epididymitis caused by coxsackievirus A6 in association with hand, foot, and mouth disease. // J. Clin. Microbiol. - 2014. Vol. 52. - № 12. - P. 4412-3.

22. Ya Nan Zhao, David S. Perlin, Steven Park et al. FDJS03 Isolates Causing an Outbreak of Aseptic Meningitis in China That Evolved from a Distinct Echovirus 30 Lineage Imported from Countries of the Commonwealth of Independent States. //Journal of clinical microbiology. - 2006. - Vol. 44. - № 11. - P. 4142-4148.

23. Ya-Qing He, Long Chen, Wen-Bo Xu at al. Emergence, Circulation, and Spatiotemporal Phylogenetic Analysis of Coxsackievirus A6- and Coxsackievirus A10-Associated Hand, Foot, and Mouth Disease Infections from 2008 to 2012 in Shenzhen, China. // J. Clin. Microbiol. - 2013. - Vol. 51. - № 11. - P. 3560-3566.


Рецензия

Для цитирования:


Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Котова В.О., Амяга Е.Н., Троценко О.Е. МОЛЕКУЛЯРНО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ЦИРКУЛЯЦИИ ЭНТЕРОВИРУСОВ В ДАЛЬНЕВОСТОЧНОМ ФЕДЕРАЛЬНОМ ОКРУГЕ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2014-2015 ГОДАХ. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2016;(30):38-44.

For citation:


Sapega E.Yu., Butakova L.V., Kotova V.O., Amyaga E.N., Trotsenko O.E. MOLECULAR GENETIC PECULIARITIES OF ENTEROVIRUS CIRCULATION IN THE FAR EASTERN FEDERAL DISTRICT OF THE RUSSIAN FEDERATION IN 2014-2015. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2016;(30):38-44. (In Russ.)

Просмотров: 90


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-2899 (Print)