Идентификация лептоспир методами мультилокусного секвенирования и прямого белкового профилирования
Аннотация
Апробированы современные методы идентификации лептоспир с помощью мультилокусного сиквенс-типирования и прямого белкового профилирования с использованием технологии масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией и времяпролетным разделением. Проведена проверка рабочей коллекции лептоспир ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора. Выявлено два штамма с таксономической ошибкой. Определены изменения в последовательностях гена sucA у шести штаммов.
Об авторах
Мунко Баярович Шаракшанов
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора, г. Иркутск
Россия
Россия
Наталья Владимировна Бренёва
ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора, г. Иркутск
Россия
Россия
Список литературы
1. Бренева Н.В., Афанасьев М.В., Шаракшанов М.Б. MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ клеточных белков в идентификации представителей рода Leptospira // Журн. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. - 2014. - № 4. - С. 36-43.
2. van Belkum A., Tassios P.T., Dijkshoorn L. et al. Guidelines for the validation and application of typing methods for use in bacterial epidemiology // Clin Micro Biol Infect. -2007. - Vol. 13 (Suppl. 3). - P. 1-46.
3. Boonsilp S., Thaipadungpanit J., Amornchai P. et al. A Single Multilocus Sequence Typing (MLST) Scheme for Seven Pathogenic Leptospira Species // PLoS Negl Trop Dis. - 2013. - Vol. 7 (1). e. 1954.
4. Bruker Daltonics GmbH. MALDI Biotyper 3.0 User Manual. Revision 2 - February 2011. - 184 p.
5. Djelouadji Z., Roux V., Raoult D. et al. Rapid MALDI-TOF mass spectrometry identification of Leptospira organisms // Vet. Microbiol. - 2012. - Vol. 158. - Р. 142-146.
6. Maiden M.S. Multilocus Sequence Typing of Bacteria // Ann Rev Microbiol. - 2006. - Vol. 60. - P. 561-588.
7. Paster B.J. Phylum XV. Spirochaetes Garrity and Holt 2001 / Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. - Springer, 2010. - Vol. 4. - P. 471-566.
Рецензия
Для цитирования:
Шаракшанов М.Б., Бренёва Н.В. Идентификация лептоспир методами мультилокусного секвенирования и прямого белкового профилирования. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015;(27):35-40.
For citation:
Sharakshanov M.B., Breneva N.V. Leptospira cultures Identification by Multilocus Sequencing and Direct Protein Profiling . Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2015;(27):35-40. (In Russ.)
Просмотров:
124
Послать статью по эл. почте 