Preview

Дальневосточный журнал инфекционной патологии

Расширенный поиск

МЕТОДЫ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ И ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА В ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИХ РАССЛЕДОВАНИЯХ СЛУЧАЕВ ЭНТЕРОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ НА ТЕРРИТОРИЯХ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ, ПОДВЕРГШИХСЯ ПОДТОПЛЕНИЮ В 2013 ГОДУ

Аннотация

Чрезвычайная ситуация, вызванная массивным подтоплением территорий Хабаровского края, Амурской и Еврейской автономной областей, потребовала более широкого использования молекулярно-генетических методов типирования и изучения происхождения энтеровирусов, вызвавших значительный подъем заболеваемости энтеровирусной инфекцией в 2013 году. Филогенетическому анализу подвергнуты наиболее часто выявляемые в 2013 году энтеровирусы Коксаки В-5, Коксаки А-6, А-9, А-10, А-16, ЕСНО-6. Степень генетического родства и возможность установления эпидемиологической связи проанализированы и для энтеровируса 71 типа, способного к активному эпидемическому распространению. Проведенные исследования позволили предположить различное происхождение энтеровирусов, в том числе «завозной» характер распространения возбудителей, преимущественно из стран Азиатско-Тихоокеанского региона.

Об авторах

Е. Ю. Сапега
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


О. Е. Троценко
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


О. П. Курганова
Управление Роспотребнадзора по Амурской области
Россия


В. А. Отт
Управление Роспотребнадзора по Хабаровскому краю
Россия


Н. В. Коршунова
Амурская государственная медицинская академия
Россия


Т. В. Корита
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


В. О. Котова
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


В. А. Янович
Управление Роспотребнадзора по Еврейской автономной области
Россия


Ю. А. Гарбуз
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Хабаровском крае»
Россия


П. В. Копылов
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Еврейской автономной области»
Россия


Л. В. Бутакова
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


Т. А. Зайцева
Управление Роспотребнадзора по Хабаровскому краю
Россия


А. А. Перепелица
Управление Роспотребнадзора по Амурской области
Россия


Т. Н. Каравянская
Управление Роспотребнадзора по Хабаровскому краю
Россия


Е. Н. Присяжнюк
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Хабаровском крае»
Россия


Е. М. Голубева
Управление Роспотребнадзора по Хабаровскому краю
Россия


В. И. Резник
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Хабаровском крае»
Россия


Е. С. Мироненко
Управление Роспотребнадзора по Еврейской автономной области
Россия


Л. А. Балахонцева
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


А. П. Бондаренко
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия


А. Н. Лукашев
ФГБУ «Институт полиомиелита и вирусных энцефалитов им. М.П.Чумакова» РАМН
Россия


С. В. Балахонов1О
ФБУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока» Роспотребнадзора
Россия


А. К. Носков1О
ФБУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока» Роспотребнадзора
Россия


С. А. Косилко1О
ФБУЗ «Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока» Роспотребнадзора
Россия


Н. А. Новикова
ФБУН «Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. И.Н.Блохиной» Роспотребнадзора
Россия


Л. Н. Голицына
ФБУН «Нижегородский НИИ эпидемиологии и микробиологии им. И.Н.Блохиной» Роспотребнадзора
Россия


М. Е. Игнатьева
Управление Роспотребнадзора по Республике Саха (Якутия)
Россия


А. А. Рубцова
Управление Роспотребнадзора по Магаданской области
Россия


Б. Б. Дарижапов
Управление Роспотребнадзора по Сахалинской области
Россия


Г. Г. Онищенко
Российская Академия Наук
Россия


Список литературы

1. Сапега Е.Ю., Янович В.А., Троценко О.Е., Онищенко Г.Г., Корита Т.В., Никулина О.Н., Копылов П.В., Мироненко Е.С., Бутакова Л.В., Балахонов С.В., Носков А.К., Севостьянова А.Н., Новикова Н.А., Голицына Л.Н. Эпидемиологические особенности энтеровирусной инфекции в условиях паводка на территории Еврейской автономной области // Проблемы особо опасных инфекций. - 2014. - Выпуск 1. - С. 71-74.

2. Троценко О.Е., Т.Н.Каравянская, Отт В.А., Онищенко Г.Г., Резник В.И., Сапега Е.Ю., Корита Т.В., Гарбуз Ю.А., Зайцева Т.А., Присяжнюк Е.Н., Лукашев А.Н., Чистяк В.М., Голубева Е.М., Котова В.О., Лебедева Л.А., Балахонцева Л.А., Бутакова Л.В. Многолетний анализ проявлений эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Хабаровском крае и основные факторы, определяющие ухудшение эпидемиологической ситуации в условиях наводнения // Проблемы особо опасных инфекций. - 2014. - Выпуск 1. - С.75-78.

3. Троценко О.Е., Онищенко Г.Г., Курганова О.П., Сапега Е.Ю., Перепелица А.А., Корита Т.В., Котова В.О., Бутакова Л.В., Балахонов С.В., Косилко С.А. Ретроспективный анализ заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Амурской области и особенности эпидемического процесса в период крупномасштабного наводнения // Проблемы особо опасных инфекций. - 2014. - Выпуск 1. - С. 79-82.

4. Троценко О.Е., Отт В.А., Онищенко Г.Г., Каравянская Т.Н., Гарбуз Ю.А., Сапега Е.Ю., Зайцева Т.А., Присяжнюк Е.Н., Резник В.И., Корита Т.В., Лебедева Л.А., Голубева Е.М., Котова В.О., Бутакова Л.В., Балахонцева Л.А., Атаманчук И.Л., Балахонов С.В., Носков А.К., Севостьянова А.В. Эпидемиологическая характеристика энтеровирусной инфекции в Хабаровском крае в условиях чрезвычайной гидрологической ситуации // Проблемы особо опасных инфекций. - 2014. - Выпуск 1. - С. 83-86.

5. Oberste M. S. Maher K, Kilpatrick DR, Pallansch MA. Molecular evolution of the human enteroviruses: correlation of serotype with VP1 sequence and application to Picornavirus classification // J. Virol. - 1999. - Vol. 73. - № 3. - P. 1941-1948.

6. Tamura K. Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees // Mol. Biol. Evol. - 1993. - Vol. 10. - P. 512-526.

7. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - Vol. 30. - Р. 2725-2729.

8. Puepa J., Chieochansin T., Linsuwanon P. et al. Hand, foot and mouth disease caused by coxsackievirus A6, Thailand, 2012 // J. Emerging Infect. Disease. - 2013. - Vol. 19 (7). - P. 641-643.


Рецензия

Для цитирования:


Сапега Е.Ю., Троценко О.Е., Курганова О.П., Отт В.А., Коршунова Н.В., Корита Т.В., Котова В.О., Янович В.А., Гарбуз Ю.А., Копылов П.В., Бутакова Л.В., Зайцева Т.А., Перепелица А.А., Каравянская Т.Н., Присяжнюк Е.Н., Голубева Е.М., Резник В.И., Мироненко Е.С., Балахонцева Л.А., Бондаренко А.П., Лукашев А.Н., Балахонов1О С.В., Носков1О А.К., Косилко1О С.А., Новикова Н.А., Голицына Л.Н., Игнатьева М.Е., Рубцова А.А., Дарижапов Б.Б., Онищенко Г.Г. МЕТОДЫ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ И ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА В ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИХ РАССЛЕДОВАНИЯХ СЛУЧАЕВ ЭНТЕРОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ НА ТЕРРИТОРИЯХ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ, ПОДВЕРГШИХСЯ ПОДТОПЛЕНИЮ В 2013 ГОДУ. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2014;(25):119-127.

For citation:


Sapega E.Yu., Trotsenko O.E., Kurganova O.P., Ott V.A., Korshunova N.V., Korita T.V., Kotova V.O., Yanovich V.A., Garbuz Yu.A., Kopilov P.V., Butakova L.V., Zaitseva T.A., Perepelitsa A.A., Karavyanskaya T.N., Prisyazhnyuk E.N., Golubeva E.M., Reznik V.I., Mironenko E.S., Balahontseva L.A., Bondarenko A.P., Lukashev A.N., Balakhonov1O S.V., Noskov1O A.K., Kosilko1O S.A., Novikova N.A., Golitsina L.N., Ignat’Eva M.E., Rubtsova A.A., Darizhapov B.B., Onishchenko G.G. Methods of genotyping and phylogenetic analysis of epidemiological investigations of enterovirus infection on the territory of the Far Eastern Federal District of the Russian Federation, that were exposed to flood in 2013. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2014;(25):119-127. (In Russ.)

Просмотров: 96


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-2899 (Print)