ИССЛЕДОВАНИЕ АУТОПСИЙНОГО МАТЕРИАЛА В ПОИСКАХ ВИРУСНОЙ ЭТИОЛОГИИ ФАТАЛЬНЫХ ПНЕВМОНИЙ В Г. ХАБАРОВСКЕ В 2023-2024 ГГ.

Исследования последних лет демонстрируют изменение этиологии инфекций нижних дыхательных путей с бактериальной на вирусную. Выявление возбудителей в посмертном (аутопсийном) материале может дать более точную этиологическую причину фатальных пневмоний.

Цель исследования: сравнительный анализ видового состава вирусных патогенов, выявленных в аутопсийных пробах больных разных возрастных групп с летальным исходом внебольничной пневмонии в г. Хабаровске в 2023-2024 гг.

Материалы и методы. Материалом для анализа послужили результаты исследования 140 аутопсийных проб, выполненного в 2023 г., и 155 проб, изученных в 2024 г. Поиск был направлен на выявление ДНК-РНК 11 респираторных вирусных патогенов и четырёх вирусов – возбудителей оппортунистических заболеваний. Исследование проведено методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием реагентов отечественных производителей.

Результаты и обсуждение. При поиске 11 вирусных патогенов ДНК-РНК респираторных вирусов в 2023 г. были выделены в 46,43% случаев (65 ДНК-РНК патогенов из 140 проб), в 2024 г. почти в 2 раза реже – в 27,74% случаев (43 ДНК-РНК патогена из 155 проб). Снижение частоты выделения отмечено в 2024 г. по 10 из 11 наименований респираторных вирусов, в том числе по вирусу SARS-CoV-2 показатель снизился в 1,7 раза (с 15,71% до 9,03%). Вирус гриппа А/Н1N1 и респираторно-синцитиальный вирус в 2024 г. не зарегистрированы (в 2023 г. их доли составляли 7,14% и 3,57%, соответственно). Установлена замена ушедшего вируса гриппа А/Н1N1 на вирус гриппа А/Н3N2 (с 0,71% в 2023 г. до 7,74% в 2024 г.). Отмечено также снижение в 1,6 раза частоты выявления группы вирусов, вызывающих оппортунистические заболевания (с 27,14% в 2023 г. до 16,77% в 2024 г.). В 2024 г. среди лиц с летальным исходом болезни наиболее уязвимыми в отношении вирусных патогенов оказались младшая возрастная группа (от 0 до 2 лет) и лица старше 60 лет. Среди младенцев 0-2 лет отмечен максимально высокий суммарный показатель выявления вирусных возбудителей (78,57%) с выделением вирусов 7 наименований, в том числе вируса гриппа А/Н3N2, риновируса (по 7,14%), SARS-CoV-2, сезонных коронавирусов (по 3,57%), а также вирусов оппортунистических заболеваний (цитомегаловируса, вируса герпеса 6 типа и вируса Эпштейн-Барра – 57,15%). У лиц старше 60 лет общая доля обнаруженных вирусных патогенов составила 34,15% с выделением вирусов 8 наименований. В данной возрастной группе отмечена наибольшая частота выделения вирусов гриппа А/Н3N2 и SARS-CoV-2 (по 12,2%).

Заключение. Результаты исследований обосновывают необходимость продолжения мониторинговых наблюдений за вирусными возбудителями фатальных пневмоний.

1. Орлова Е.Д., Бабаченко И.В., Тян Н.С., Козырев Е.А., Алексеева Л.А. Клиниколабораторные особенности вирусных инфекций нижних дыхательных путей у детей. Журнал инфектологии. 2023; 15(2): 84-92. DOI:10.22625/2072-6732-2023-15-2-84-92.

2. Febbo J., Revels J., Ketai L. Viral Pneumonias. Radiol Clin North. 2022; 60(3): 383-397. DOI:10.1016/j.rcl.2022.01.010.

3. Reimann H.A. An acute infection of the respiratory tract with atypical pneumonia: a disease entity probably caused by a filtrable virus. JAMA. 1984; 111(26): 77–84. https://jamanetwork.com/journals/jama/article-abstract/283403

4. Харитонов М.А., Салухов В.В., Крюков Е.В. и др. Вирусные пневмонии: новый взгляд на старую проблему (обзор литературы). Медицинский совет. 2021; 16: 60–77. DOI:10.21518/2079-701X2021-16-60-77.

5. Минаков А.А., Вахлевский В.В., Волошин Н.И. и др. Новый взгляд на этиологию и иммунологические аспекты пневмонии. Медицинский Совет. 2023; 4: 141-153. https://doi.org/10.21518/ms2023-056.

6. Pagliano P., Sellitto C., Conti V., Ascione T., Esposito S. Characteristics of viral pneumonia in the COVID-19 era:an update. Infection. 2021; 29: 1–10. https://doi.org/10.1007/s15010-021-01603-y.

7. Лаптева И.М. Особенности диагностики и лечения первичных вирусных, вторичных бактериальных и вирусно-бактериальных пневмоний при гриппе. Рецепт. 2009; 6 (68): 74–79. EDN: NURSCT.

8. Cilla G., Oñate E., Perez-Yarza E.G., Montes M., Vicente D., Perez-Trallero E. Viruses in community-acquired pneumonia in children aged less than 3 years old: High rate of viral coinfection. J. Med. Virol. 2008; 80(10):1843–1849. https://doi.org/10.1002/jmv.21271.

9. do Carmo Debur M., Raboni S.M., Flizikowski F.B. at al. Immunohistochemical assessment of respiratory viruses in necropsy samples from lethal non-pandemic seasonal respiratory infections. J. Clin. Pathol. 2010; 63(10): 930–934. https://doi.org/10.1136/jcp.2010.077867.

10. Егоров А.Ю. Проблема бактериальных осложнений при респираторных вирусных инфекциях. Microbiology Independent Research Journal. 2018; 5(1): 1-11. https://doi.org/10.18527/2500-2236-2018-5-1-1-11

11. Charlson E.S., Bittinger K., Haas A.R. at al. Topographical continuity of bacterial populations in the healthy human respiratory tract. Am. J. Respir. Crit. Care. Med. 2011. 184 (8): 957–963. https://doi.org/10.1164/rccm.201104-0655OC.14.

12. Исаева Г.Ш., Чумарев Н.С. Микробиота верхних дыхательных путей при COVID-19. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2024; 26(1): 21-30. https://doi.org/10.36488/cmac.2024.1.21-30.

13. Arunachalam P.S., Wimmers F., Mok C.K.P. et al. Systems biological assessment of immunity to mild versus severe COVID-19 infection in humans. Science. 2020;369(6508): 1210-1220. DOI: 10.1126/science.abc6261.

14. Rossi G.A., Fanous H., Colin A.A. Viral strategies predisposing to respiratory bacterial superinfections. Pediatr Pulmonol. 2020; 55(4): 1061-1073. DOI: 10.1002/ppul.24699.

15. Drysdale SB, Kelly DF. How use respiratory viral studies. Arch Dis Child Educ Pract Ed. 2019; 104(5): 274-278. DOI: 10.1136/archdischild-2016-311858.

16. Esposito S., Mencacci A., Cenci E. et al. Multiplex Platforms for the Identification of Respiratory Pathogens: Are They Useful in Pediatric Clinical Practice? Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2019; 9(196): 1-8. DOI: 10.3389/fcimb.2019.00196

17. Pinsky B.A, Hayden R.T. Cost-Effective Respiratory Virus Testing. J Clin Microbiol. 2019;57(9): e00373-19. DOI: 10.1128/JCM.00373-19.

18. Lee B.R, Hassan F., Jackson M.A, Selvarangan R. Impact of multiplex molecular assay turnaround-time on antibiotic utilization and clinical management of hospitalized children with acute respiratory tract infections. Journal of Clinical Virology. 2019; 110: 11-16. DOI: 10.1016/j.jcv.2018.11.006