MICROBIOLOGICAL AND MOLECULAR-BIOLOGICAL METHODS IN EPIDEMIOLOGICAL EVALUATION OF HEALTHCARE ASSOCIATED INFECTIONS CAUSED BY KLEBSIELLA PNEUMONIAE

Current article presents results of epidemiological diagnosis and epidemiological assessment of events that took place in years 2017-2018 and in year 2021. First of them was a long-lasting outbreak of respiratory diseases and pneumonia in the Birobidzhan psychoneurological asylum with number of affected patients equaled 166 people (150 patients and 16 staff members). Fatal outcomes were registered. Main pathogens were as follows – Influenza virus B, S. pneumoniae, H. influenzae. Other bacteriological pathogens were also identified and all of them did not have sings of multiple drug resistance (MDR). Evaluation of autopsy material (lung tissue of patient that died from pneumonia) showed presence of K. pneumoniae with MDR and ESBL-production formation of which was associated with hospital environment.Second situation was associated with development purulent-septic infection among newborns (12 children) in an obstetric hospital of the Khabarovsk city. Phenotypical and molecular-biological typing showed differences between the strains isolated from children (K. pneumoniae ESBL +, RAPD-type А) and staff members (strains sensitive to drugs of different RAPD-types – B, C, D but hypermucoviscous,). Two independent strains of K. pneumoniae among newborns and staff members that caused outbreak in and obstetric hospital were detected. Third situation – formation of pneumonia outbreaks associated with SARS-CoV-2 during years 20202021. During the period of new coronavirus pandemic in year 2021 a total number of 106 samples of autopsy material obtained from patients with pneumonia were examined. Prevalence of carbapenem-resistant K. pneumoniae (43.4%) that replaced ESBL-variants was observed.Efficiency of task-oriented utilization of bacteriological and molecular-biological methods and techniques in order to provide scientifically grounded evaluation of different epidemiological situations was showed.

1. Акимкин В.Г., Тутельян А.В., Шулакова Н.И., Воронин Е.М. Пандемия COVID-19: новый виток нарастания антибиотикорезистентности // Инфекционные болезни. – 2021. – Т. 19, № 3. – С. 133- 138.

2. Анганова Е.В., Ветохина А.В., Распопина Л.А. и др. Состояние антибиотикорезистентности Klebsiella pneumoniae // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2017. - № 5. – С. 70-77.

3. Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Зайцева Т.А. Некоторые аспекты развития эпидемического процесса инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (обзор литературы) // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2019. - № 36. – С. 92-97.

4. Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Каравянская Т.Н., Присяжнюк Е.Н., Алекминская И.М., Тригорлова Т.Н., Ардашева Т.А., Асташкин Е.И. Эпидемиологическая оценка инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, выявленных в акушерском стационаре Хабаровска // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2020. - № 2 (10). – С. 15-24.

5. Бондаренко А.П., Шмыленко В.А., Троценко О.Е., Яцышина С.Б., Копылов П.В., Гарбуз Ю.А., Сапега Е.Ю., Базыкина Е.А. Длительный очаг респираторных заболеваний и пневмоний, сформировавшийся в Биробиджанском интернате для психоневрологических больных в марте-апреле 2018 года // Бюллетень физиологии и патологии дыхания. – 2021. – Вып. 81. – С. 27-37.

6. Гончаров А.Е., Зуева Л.П., Мохов А.С., Колоджиева В.В., Мельцер А.А., Смирнова М.В., Хавлина Т.В., Оришак Е.А. Распространение мультиантибиотикорезистентных возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в стационарах для лечения пациентов с COVID-19 // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2021. – Т. 20, № 2. – С. 68-73.

7. Комиссарова Е.В., Воложанцев Н.В. Гипервирулентная Klebsiella pneumoniae – новая инфекционная угроза // Инфекционные болезни. – 2019. - № 17(3). – С. 81- 89.

8. Маржохова А.Р., Плоскирева А.А., Хараева З.Ф., Маржохова М.Ю., Балагова Л.Э., Иванова М.Р., Шомахова З.А., Пазова Ж.Ю. Характеристика больных с тяжелым и крайне тяжелым течением коронавирусной инфекции, вызванной SARS-CoV-2, по данным реанимационного отделения госпиталя № 1 г. Нальчика // Инфекционные болезни. – 2021. – Т. 19, № 3. – С. 37-42.

9. Руднов В.А., Багин В.А., Бельский ДВ. и др. Современный портрет вентиляторассоциированной инфекции нижних дыхательных путей: этиология и проблемы диагностики // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2021. - № 23(1). - С. 17-25.

10. Середкина М.А., Кречикова А.И., Сухорукова М.В. Микробиологическое исследование аутопсийного материала и интерпретация его результатов // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2000. - № 2(2). – С. 79-85.

11. Синопальников АИ. Пандемия COVID-19 «пандемия» антибактериальной терапии // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2021. - № 23(1). – С. 5-15.

12. Скачкова Т.С., Шипулина О.Ю., Шипулин Г.А. и др. Изучение генетического разнообразия штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных в многопрофильном медицинском центре г. Москвы с помощью секвенирования нового поколения // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2019. - № 21(1). – С. 69-74.

13. Тапальский Д.В., Петровская Т.А., Бонда Н.А. и др. Распространенность карбапенемазопродуцирующих Klebsiella pneumoniae в Гомельской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2019. - № 4. – С. 53-58.

14. Тапальский Д.В., Петренёв Д.Р. Распространенность Klebsiella pneumoniae – продуцентов карбапенемаз в Беларуси и их конкурентноспособность // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. – 2017. - № 19(2). – С. 139-144.

15. Чубаков Т. Туберкулез легких у больных психическими заболеваниями и наркоманиями: специальность 14.00.26 «Фтизиатрия»; 14.00.18 «Психиатрия»: автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора медицинских наук / Чубаков Тулеген; Кыргызский государственный медицинский институт. - Москва, 1992. – 33 с.

16. Эйсмонт Н.В. Организация комплексных противотуберкулезных мероприятий в стационарных учреждениях длительного пребывания (на примере психоневрологических интернатов Свердловской области): специальность 14.00.33 «Общественное здоровье и здравоохранение»: автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Эйсмонт Наталья Владимировна; ЦНИИ организации и информатизации здравоохранения МЗ РФ. – Москва, 2002. – 23 с.

17. Gupta N., Limbago B.M., Patel J.B., et al. Carbapenem-resistent Enterobacteriaceae: epidemiology and prevention // Clin. Infect. Dis. – 2011. - № 53(1). – P. 60-67.

18. Woodford N., Turton J.F., Livermore D.M. Multiresistent Gram-negative bacteria: the role of highrisk clones in the dissemination of antibiotic reitence // FEMS Microbiol. Rev. – 2011. - № 35. – С. 736-755.