ЦИРКУЛИРУЮЩИЕ РЕКОМБИНАНТНЫЕ ФОРМЫ ВИЧ-1 НА ТЕРРИТОРИЯХ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА
Аннотация
Проведенное молекулярно-эпидемиологическое исследование показало, что несмотря на доминирование в Дальневосточном федеральном округе (ДФО)суб-субтипа А6, генетический профиль ВИЧ-инфекции на обследованных территориях округа достаточно разнообразен. Среди ВИЧ-инфицированных пациентов ДФО обнаружена 91 рекомбинантная форма.
Всего выявлено 7 типов циркулирующих и 1 уникальная рекомбинантная форма ВИЧ-1: CRF03_AB – 4 (4,4±2,2%), CRF02_AG – 14 (15,6±3,8%), CRF63_02A1 – 65 (71,1±4,8%), CRF11_cpx – 1 (1,1±1,1%), CRF01_AE – 4 (4,4±2,2%), CRF09_cpx 1(1,1±1,1%), CRF07_BC– 1 (1,1±1,1%), URF63_02A– 1 (1,1±1,1%). Наибольшая распространенность циркулирующих рекомбинантных форм отмечена на территориях Еврейской автономной области и Амурской области. Причиной роста распространения рекомбинантных форм ВИЧ-1 в ДФО может быть высокий уровень как внутренней, так и внешней миграции населения.
При поддержке: За предоставленные сведения и биологический материал авторы выражают благодарность сотрудникам региональных центров по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями в ДФО: в Магаданской, Еврейской автономной, Сахалинской, Амурской областях, Республике Саха (Якутия), Чукотском автономном округе, Хабаровском крае
Об авторах
В. О. Котова
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
Котова Валерия Олеговна – старший научный сотрудник-заведующая лабораторией эпидемиологии и профилактики ВИЧ-инфекции и вирусных гепатитов.
Хабаровск
Л. А. Балахонцева
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
Хабаровск
Е. А. Базыкина
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
Хабаровск
О. Е. Троценко
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
Хабаровск
Список литературы
1. World Health Organization. Global report: UNAIDS report on the global AIDS epidemic 2020. [Electronic resource]. Available from: (http://www.unaids.org/en/resources/documents/2020/unaids-data2020).
2. Справка Федерального научно-методического центра по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН Центрального НИИ эпидемиологии Роспотребнадзора «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации на 31.12.2020 г.».
3. Ramirez BC, Simon-Loriere E, Galetto R, Negroni M. Implications of recombination for HIV diversity // Virus research. 2008; 134(1–2):64–73. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2008.01.007PMID:18308413.
4. Konings FA, Burda ST, Urbanski MM, Zhong P, Nadas A, Nyambi PN. Human immunodeficiency virus type1 (HIV-1) circulating recombinant form 02_AG (CRF02_AG) has a higher in vitro replicative capacity than its parental subtypes A and G // J Med Virol.2006; 78(5):523–34. Epub 2006/03/24. https://doi.org/10.1002/jmv.20572PMID:16555291.
5. Nora T, Charpentier C, Tenaillon O, Hoede C, Clavel F, Hance AJ. Contribution of recombination to the evolution of human immunodeficiency viruses expressing resistance to antiretroviral treatment //Journal of virology.2007;81(14):76208. https://doi.org/10.1128/JVI.0008307PMID:17494080.
6. Turk G, Carobene MG. Deciphering How HIV-1 Intersubtype Recombination Shapes Viral Fitness and Disease Progression. EBioMedicine.2015;2(3):188-9. https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2015.02.011P MID:26137559.
7. Robertson D.L., Anderson J.P., Bradac J.A. et al. HIV-1 nomenclature proposal // Science. – 2000. – Vol. 288 – N. 5463. – P. 55–56.
8. Arien K.K., Vanham G., Arts E.J. Is HIV-1 evolving to a less virulent formin humans? Nat Rev Microbiol. 2007; 5(2):141–51.
9. Los Alamos Database. HIV Circulating Recombinant Forms (CRFs). https://http://www.hiv.lanl.gov/content/sequence/HIV/CRFs/CRFs.html. Accessed 2021 April.
10. Hemelaar J. Implications of HIV diversity for the HIV-1 pandemic // Journal of Infections. 2013; 66: 391–400.
11. Hemelaar J, Elangovan R, Yun J, Dickson-Tetteh L, Fleminger I, Kirtley S, et al. Global and regional molecular epidemiology of HIV-1, 1990–2015: a systematic review, global survey, and trend analysis // Lancet Infect Dis.2019;19(2):143–55. https://doi.org/10.1016/S1473-3099(18)30647-9 PMID:30509777.
12. Chow W.Z., Takebe Y., Syafina N.E., Prakasa M.S., Chan K.G., Abed Al-Darraji H.A., Koh C., Kamarulzaman A., Tee K.K. A newly emerging HIV-1 recombinant lineage (CRF58_01B) disseminating among people who inject drugs in Malaysia // PLoSONE, 2014. Vol.9, N 1: e85250.
13. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Васильев А.В., Лага В.Ю., Грезина Л.А., Волова Л.Ю. и др. Проблемы субтипирования ВИЧ-1на основе анализа гена pol и способы их разрешения // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2010; 3 (2): 42–48.
14. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. Molecular Biology and Evolution. 2013; (30): 2725-29.
15. Казеннова Е.В., Бронникова А.В., Кузин С.Н., Кириллова И.Л., Ершова О.Н., Афанасьева Л.Р. и др. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, циркулирующих в г. Череповце Вологодской области: второй случай эпидемической вспышки, вызванной рекомбинантом gagA envB // Вопросы вирусологии. – 2008. Т.53, №5. С.23-27.
16. Bobkov A., Kazennova E., Selimova L., Bobkova M., Khanina T., Ladnaya N., et al. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: Identification of subtype A, subtype B, and novel gagA/envB recombinants. AIDS Res // Hum. Retroviruses. – 1998. – Vol.14, №8. – Р.669-676.
17. Liitsola K., Tashkinova I., Laukkanen T., Korovina G., Smolskaja T., Momot O. HIV-1 genetic subtype A/B recombinant strain causing an explosive epidemic in injecting drug users in Kaliningrad //AIDS. —1998. —Vol.12. —P. 1907–1919.
18. Wilbe K., Casper C., Albert J., Leitner T. Identification of two CRF11-cpxgenomes and two preliminary representatives of a new circulating recombinant form (CRF13_cpx) of HIV type 1 in Cameroon //AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2002; 18(12): 849-56. Doi: https://doi.org/10.1089/08892220260190326
19. Montavon C., Vergne L., Bourgeois A., Mpoudi-Ngole E., Malonga-Mouellet G., Butel C., et al. Identification of a new circulating recombinant form of HIV type 1, CRF11-cpx, involving subtypes A, G, J, and CRF01-AE, in Central Africa // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2002; 18(3): 231-6. Doi: https://doi.org/10.1089/08892220252781301.
20. Brodine SK, Starkey MJ, Shaffer RA, Ito SI, Tasker SA, Barile AJ, Tamminga CL, Stephan KT, Aronson NE, Fraser SL, Wallace MR, Wegner SA, Mascola JR, McCutchan FE. Diverse HIV-1 subtypes and clinical, laboratory and behavioral factors in a recently infected US military cohort // AIDS. 2003 Nov 21;17(17):2521-7. doi: 10.1097/00002030-200311210-00016. PMID: 14600525.
21. McCutchan FE. Understanding the genetic diversity of HIV-1 // AIDS. 2000;14 Suppl 3:S31-44. PMID: 11086847.
22. Su L, Graf M, Zhang Y, von Briesen H, Xing H, Köstler J, Melzl H, Wolf H, Shao Y, Wagner R. Characterization of a virtually full-length human immunodeficiency virus type 1 genome of a prevalent intersubtype (C/B') recombinant strain in China // J Virol. 2000 Dec;74(23):11367-76. doi: 10.1128/jvi.74.23.11367-11376.2000. PMID: 11070037; PMCID: PMC113242.
23. Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. Genetic characterization of an isolate of HIV type 1 AG recombinant form circulating in Siberia, Russia. Arch. Virol. 2012; 157(12): 2335-41. Doi: https://doi.org/10.1007/s00705-012-1442-4.
24. Baryshev PB, Bogachev VV, Gashnikova NM. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia. AIDS Res Hum Retroviruses. 2014 Jun;30(6):592-7. doi: 10.1089/aid.2013.0196. Epub 2014 Feb 6. PMID: 24279614; PMCID: PMC4046202.
Рецензия
Для цитирования:
Котова В.О., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А., Троценко О.Е. ЦИРКУЛИРУЮЩИЕ РЕКОМБИНАНТНЫЕ ФОРМЫ ВИЧ-1 НА ТЕРРИТОРИЯХ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2021;(40):79-87.
For citation:
Kotova V.O., Balakhontseva L.A., Bazykina E.A., Trotsenko O.E. CIRCULATING RECOMBINANT FORMS OF HIV-1 IN CONSTITUENT ENTITIES OF THE FAR EASTERN FEDERAL DISTRICT. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2021;(40):79-87. (In Russ.)
Просмотров:
5
Послать статью по эл. почте 