MASS SPECTROMETRIC ANALYSIS OF ANTIBIOTIC-RESISTANT S. AUREUS AND P. AERUGINOSA USING THE MALDIQUANT R PACKAGE
Abstract
The purpose of this paper is to study the differences in the mass spectra of bacterial strains that are sensitive or resistant to antibiotics. The resistance of eight P. aeruginosa strains and nine S. aureus strains to several antibiotics such as azithromycin, meropenem, ciprofloxacin, amikacin, cefixime, cefotaxime was studied. One antibiotic-sensitive strain and one antibiotic-resistant strain were selected for each bacterium. Mass spectra of bacteria were obtained using a MALDI-TOF microflex mass spectrometer (Bruker, Germany). The R software environment and the MALDIquant package were used for processing of mass spectrometry data. It was found that the presence of peaks in the regions m / z = 5383, 6977, 4882, 3005, 6621 of P. aeruginosa spectra and m / z = 3876, 6556, 12542 of S. aureus spectra may indicate their antibiotic resistance.
About the Authors
V. V. Denisenko
Rostov Research Institute of Microbiology and Parasitology; Southern Federal University
Russian Federation
Russian Federation
Rostov-on-Don
A. V. Aleshukina
Rostov Research Institute of Microbiology and Parasitology
Russian Federation
Russian Federation
Rostov-on-Don
I. S. Aleshukina
Rostov Research Institute of Microbiology and Parasitology
Russian Federation
Russian Federation
Rostov-on-Don
V. S. Zubtsov
Southern Federal University
Russian Federation
Russian Federation
Rostov-on-Don
A. A. Gorovtsov
Southern Federal University
Russian Federation
Russian Federation
Rostov-on-Don
References
1. Новик Е.С., Резник В.И., Т.Н. Каравянская и др. Значимость водного фактора в возникновении вспышек энтеровирусной инфекции на территории Хабаровского края и Приморья // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2009. – № 14. – С. 6-13.
2. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е. и др. Особенности эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Сахалинской области на современном этапе// Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2019. –№5 (18). – С. 33-41.
3. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ энтеровирусов, циркулирующих на территории Дальневосточного и Сибирского федеральных округов Российской Федерации, в том числе участвующих в возникновении очагов групповой заболеваемости // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2018. – № 35. – С. 6-14.
4. Петрухина М.И., Старостина Н.В. Статистические методы в эпидемиологическом анализе. – М., 2006. – 99 с.
Review
For citations:
Denisenko V.V., Aleshukina A.V., Aleshukina I.S., Zubtsov V.S., Gorovtsov A.A. MASS SPECTROMETRIC ANALYSIS OF ANTIBIOTIC-RESISTANT S. AUREUS AND P. AERUGINOSA USING THE MALDIQUANT R PACKAGE. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2021;(40):56-65. (In Russ.)
Views:
5
Email this article 