Характеристика и клиническое значение некоторых малоизученных возбудителей рода Chryseobacterium (обзор литературы)
Аннотация
Некоторые представители рода Chryseobacterium семейства Flavobacteriaceae, являющиеся условно-патогенными микроорганизмами, остаются относительно новыми и малоизученными патогенами для российских исследователей, в то время как во многих странах Европы, Азии и других континентов они рассматриваются как потенциальные возбудители инфекционной патологии, в особенности для иммунокомпроментированных больных и недоношенных новорожденных. Анализ литературы свидетельствуют о том, что микроорганизмы рода Chryseobacterium следует рассматривать как потенциальные патогены, для которых характерен широкий спектр природной видовой устойчивости к антимикробным препаратам, что определяет уникальный профиль восприимчивости к антибиотикам. В обзоре приведены данные литературы о роли в патологии наиболее известного представителя хризеобактерий - Chryseobacterium indologenes.
Об авторах
А. О. Голубева
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора, г. Хабаровск, Российская Федерация
Россия
Россия
Голубева Александра Олеговна – младший научный сотрудник лаборатории бактериальных инфекций
А. П. Бондаренко
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора, г. Хабаровск, Российская Федерация
Россия
Россия
O. E. Троценко
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора, г. Хабаровск, Российская Федерация
Россия
Россия
Список литературы
1. Боронина Л.Г., Кукушкина М.П., Крутова К.В. и др. Род Chryseobacterium (Flavobacterium): клиническое значение, идентификация, чувствительность к антибиотикам // КМАХ. – 2003. – Т. 5, № 3. – С. 243-250.
2. Боронина Л.Г., Мамаев И.Л., Кукушкина М.П. и др. Антибиотикорезистентность бактерий, вызывающих инфекции новорожденных в реанимационных отделениях / Сборник «Интенсивная терапия в педиатрии». – Екатеринбург, 1999. – C. 7-9.
3. Зубова К. В., Кондратенко О.В., Глинская Е.В. Видовой состав представителей порядка Flavobacteriales, выделенных от пациентов с муковисцидозом в РФ за 2019-2021 гг. / Всероссийский конгресс по медицинской микробиологии, клинической микологии и иммунологии (XXV Кашкинские чтения). – Санкт-Петербург, 2022.
4. Семанин А. Г. Васильев Д. А. Золотухин C.Н. Конструирование дифференциальнодиагностической среды для идентификации и первичной дифференциации бактерий рода Flavobacterium // Вестник Ульяновской государственной сельскохозяйственной академии. – 2018. – Т. 41, №1. – С. 99-108.
5. Семанин A.Г., Пекарская Н.П., Золотухин С.Н. и др. Разработка селективной добавки для выделения возбудителя флавобактериоза / Аграрная наука и образование на современном этапе развития: опыт, проблемы и пути их решения: Материалы VIII Международной научно-практической конференции. – Ульяновск: УГСХА им. П.А. Столыпина, 2017. – Ч. III. – С. 265-267.
6. Хасанова Г.Ф., Мавзютов А.Р., Мирсаяпова И.А. и др. Этиологическое значение и антибиотикочувствительность неферментирующих грамотрицательных бактерий в клинической практике // Медицинский вестник Башкортостана. – 2012. – Т. 7, № 1. – С. 63-65.
7. Aber R.C., Wennersten C., Moellering Jr. R.C. Antimicrobial susceptibility of Flavobacteria // Antimicrob Agents Chemother. – 1978. – № 3, Vol. 14. – P. 483–487.
8. Afshar M., Nobakht E., Lew S.Q. Chryseobacterium indologenes peritonitis in peritoneal dialysis // BMJ Case Rep. – 2013. http://dx.doi.org/10.1136/bcr-2013-009410
9. Alon D., Karniel E., Zohar I. et al. Chryseobacterium indologenes bacteremia: clinical and microbiological characteristics of an emerging infection // Int J Clin Med. – 2018. – № 6, Vol. 9. – P. 520-527.
10. Antonello V.S., Daht P., Polli J. et al. Ventilator-associated pneumonia in neonatal intensive care unit due to Chryseobacterium indologenes // Pediatr Infect Dis J. – 2017. –№ 12, Vol. 36. – Р. 353-355.
11. Arif N., Khullar S., Kumar R. et al. Pleural effusion caused by Chryseobacterium indologenes: a clinical case and review of the literature// J Lab. – 2019. – № 3, Vol.11. – P. 284–286.
12. Aydin Teke T., Oz F.N., Metin O. et al. Chryseobacterium indologenes septicaemia in an infant // Case Rep Infect Dis. – 2014. – № 8, Vol. 2014. – doi:10.1155/2014/270521.
13. Bagely D.H., Alexander J.C., Gill V.J. et al. Late Flavobacterium species meningitis after craniofacial exenteration // Arch Intern Med. – 1976. – № 2, Vol. 136. – P. 229–231.
14. Barrow G.I., Feltham R.K.A. Gowan and Steel’s Manual for the identification of medical bacteria // Cambridge University Press. – 1993. – Vol. 3. – Р.116-117.
15. Bellais S., Léotard S., Poirel L. et al. Molecular characterization of a carbapenem-hydrolyzing beta-lactamase from Chryseobacterium (Flavobacterium) indologenes // FEMS Microbiol Lett. – 1999. –№ 2, Vol. 171. – Р.127-132.
16. Bellais S., Poirel L., Leotard S., P Nordmann. Genetic diversity of carbapenem-hydrolyzing metallo-beta-lactamases from Chryseobacterium (Flavobacterium) indologenes // Antimicrob Agents Chemother. – 2000. – № 11, Vol. 44. – P. 3028-3034.
17. Bernardet J.F., Nakagawa Y., Holmes B., et al. Proposed minimal standards for describing new taxa of the family Flavobacteriaceae and emended description of the family // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. – 2002. – Vol. 52. – Р. 1049 –1070.
18. Bhagawati G., Bhardwaj A., Sajikumar R. et al. Bacteremia by Chryseobacterium indologenes in a Patient with Lung Cancer: A Clinical and Microbiological Investigation // Indian J Crit Care Med. – 2019. – № 3, Vol.23. – P. 157–159.
19. Bhuyar G., Jain S., Shah H., Mehta V.K. Urinary tract infection by Chryseobacterium indologenes // Indian J Med Microbiol. – 2012. – № 3, Vol. 30. – P. 370–372.
20. Bloch K. C., Nadarajah R., Jacobs R. Chryseobacterium meningosepticum: an emerging pathogen among immunocompromised adults. Report of 6 cases and literature review // Medicine (Baltimore). – 1997. – № 1, Vol.76. – P. 30–41.
21. Bonten M.J., van Tiel F.H., van der Geest S. et al. Topical antimicrobial prophylaxis of nosocomial pneumonia in mechanically ventilated patients // Microbiological observations Infection. – 1993. – № 3, Vol. 21. – P. 137–139.
22. Brown R.B., Phillips D., Barker M.J. et al. Outbreak of nosocomial Flavobacterium meningosepticum respiratory infections associated with use of aerosolized polymyxin B // Am J Infect Control. – 1989. – № 3, Vol.17. – P. 121-125.
23. Calderón G., García E., Rojas P. et al. Chryseobacterium indologenes infection in a newborn: a case report // J Med Case Rep. – 2011. – Vol. 5. – Р.10.
24. Cantero M., Parra L.M., Munez E. et al. A cluster of Chryseobacterium indologenes cases related to drainage water in intensive care units // Infect Control Hosp Epidemiol. – 2018. – № 8, Vol 39. – Р. 997-999.
25. Chang Y.C., Lo H.H., Hsieh H.Y. et al. Identification, epidemiological relatedness, and biofilm formation of clinical Chryseobacterium indologenes isolates from central Taiwan // J Microbiol Immunol Infect. – 2015. – № 5, Vol. 48. – Р. 559-564.
26. Chen F.L., Wang G.C., Teng S.O. et al. Clinical and epidemiological features of Chryseobacterium indologenes infections: Analysis of 215 cases // J Microbiol Immunol Infect. – 2013. – № 6, Vol. 46. – P. 425 – 432.
27. Choi M.W., Oh S.S., Choi M.R. et al. Chryseobacterium indologenes // Kor J Med. – 2018. – № 1, Vol.93. – P. 65–67.
28. Choi M.W., Oh S.S., Choi M.R. et al. Peritoneal Dialysis-associated Peritonitis Caused by Chryseobacterium indologenes // Korean J Med. – 2018. – №1, Vol. 93. – P. 65-67.
29. Chou D.W., Wu S.L., Lee C.T. et al. Clinical characteristics, antimicrobial susceptibilities, and outcomes of patients with Chryseobacterium indologenes bacteremia in an intensive care unit // Jpn J Infect Dis. – 2011. – № 6, Vol.64. – P. 520-524.
30. Christakis G.B., Perlorentzou S.P., Chalkiopoulou I. et al. Chryseobacterium indologenes noncatheter-related bacteremia in a patient with a solid tumor // J Clin Microbiol. – 2005. – № 4, Vol. 43. – P. 2021– 2023.
31. Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. In: 17th informational supplement. CLSI Document M100-S17. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute, 2007.
32. Corbella M., Brandolini M., Cambieri P. et al. A catheter-related bloodstream infection caused by Chryseobacterium indologenes successfully treated with antibiotic-lock rescue therapy // New Microbiol. – 2017. – № 3, Vol. 40. – P. 223–225.
33. Cunha V., Ferreira M., Fonseca A. et al. Community-acquired Chryseobacterium indologenes in an immunocompetent patient // JMM Case Rep. – 2014. – № 1, Vol. 1. – Р.1-2.
34. Douvoyiannis M., Kalyoussef S., Philip G. Chryseobacterium indologenes bacteremia in an infant // Int J Infect Dis. – 2010. –№ 6, Vol. 14. – Р. 531–532.
35. Du Moulin G.C. Airway colonization by Flavobacterium in an intensive care unit // J. Clin. Microbiol. – 1979. – № 2, Vol. 10. – P. 155–160.
36. Esposito S., Russo E., De Simone G. et al. Transient bacteraemia due to Chryseobacterium indologenes in an immunocompetent patient: a case report and literature review // J Chemother. – 2015. –№ 6, Vol. 27. – Р. 324-329.
37. Ferreira R.S., Brandao F.F., Lobo S.M. Chryseobacterium indologenes infection: a case report // Rev Bras Ter Intensiva. – 2010. –№ 1, Vol. 22. – Р. 96–98.
38. Fraser S. L., Jorgensen J. H. Reappraisal of the antimicrobial susceptibilities of Chryseobacterium and Flavobacterium species and methods for reliable susceptibility testing // Antimicrob Agents Chemother. – 1997. – № 12, Vol. 41. – P. 2738–2741.
39. González-Castro A., Alsasua A., Peñasco Y. et al. Tracheo-bronchitis and pneumonia associated with mechanical ventilation by Chryseobacterium indologenes // Rev Esp Anestesiol Reanim. – 2017. –№ 5, Vol. 64. – Р. 294-298.
40. Green B.T., Nolan P.E. Cellulitis and bacteraemia due to Chryseobacterium indologenes // J.Infect. – 2001. –№ 3, Vol. 42. – Р. 219–220.
41. Hantsis-Zacharov E., Shakéd T., Senderovich Y. et al. Chryseobacterium oranimense sp. nov., a psychrotolerant, proteolytic and lipolytic bacterium isolated from raw cow's milk // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. – 2008. – Vol. 58. – Р. 2635–2639.
42. Hirsh B. E., Wong B., Kiehn T. E. et al. Flavobacterium meningosepticum bacteremia in an adult with acute leukemia. Use of rifampin to clear persistent infection // Diagn Microbiol Infect Dis. – 1986. – № 1, Vol. 4. – P. 65-69.
43. Hoque S.N., Graham J., Kaufmann M. E., Tabaqchali S. Chryseobacterium (Flavobacterium) meningosepticum outbreak associated with colonization of water taps in a neonatal intensive care unit // J Hosp Infect. – 2001. – № 3, Vol. 47. – P. 188-192.
44. Holmes B., Owen R.J., Steigerwalt A.G. et al. Flavobacterium gleum, a new species found in human clinical specimens // Int J Syst Bacteriol. – 1984. – № 1, Vol. 34. – Р.21–25.
45. Hsueh P.R., Hsiue T.R., Wu J.J. et al. Flavobacterium indologenes bacteremia: clinical and microbiological characteristics // Clin Infect Dis. – 1996. – № 3, Vol. 23. – P. 550 – 555.
46. Hsueh P.R., Teng L.J., Ho S.W. et al. Clinical and microbiological characteristics of Flavobacterium indologenes infections associated with indwelling devices // J. Clin Microbiol. – 1996. – № 8, Vol. 34. – P. 1908–1913.
47. Hsueh P. R., Teng L. J., Yang P. C. et al. Increasing incidence of nosocomial Chryseobacterium indologenes infections in Taiwan // Eur J Clin Microbiol Infect Dis. – 1997. – № 8, Vol. 16. – P. 568–574.
48. Izaguirre-Anariba D. E., Sivapalan V. Chryseobacterium indologenes, an Emerging Bacteria: A Case Report and Review of Literature // Cureus. – 2020. – № 1, Vol.12. – P.1-7.
49. Kim K.K., Kim M.K., Lim J.H. et al. Transfer of Chryseobacterium meningosepticum and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and Elizabethkingia miricola comb. nov. // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. – 2005. – Vol. 55. – Р. 1287–1293.
50. Kirby J.T., Saderm H.S., Walsh T.R. et al. Antimicrobial Susceptibility and Epidemiology of a Worldwide Collection of Chryseobacterium spp.: Report from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (1997-2001) // J Clin Microbiol. – 2004. – № 1, Vol. 42. – P. 445 – 448.
51. Lambiase A., Del Pezzo M., Raia V. et al. Chryseobacterium respiratory tract infections in patients with cystic fibrosis // J Infect. – 2007. –№ 6, Vol 55. – Р. 518-523.
52. Liang C.Y., Yang C.H., Lai C.H. et al. Genomic features, comparative genomic analysis, and antimicrobial susceptibility patterns of Chryseobacterium arthrosphaerae strain ED882-96 isolated in Taiwan // Genes. – 2019. –№ 4, Vol. 10. – Р. 309.
53. Lin J.N., Lai C.H., Yang C.H. et al. Differences in clinical manifestations, antimicrobial susceptibility patterns, and mutations of fluoroquinolone target genes between Chryseobacterium gleum and Chryseobacterium indologenes // Antimicrob Agents Chemother. – 2019. –№ 5, Vol. 63. doi: 10.1128/AAC.02256-18
54. Lin Y.T., Chan Y.J., Chiu C.H. et al. Tigecycline and colistin susceptibility of Chryseobacterium meningosepticum isolated from blood in Taiwan // Int J Antimicrob Agents. – 2009. – № 1, Vol.34. – P. 100-101.
55. Lin Y.T., Jeng Y.Y., Lin M.L. et al. Clinical and microbiological characteristics of Chryseobacterium indologenes bacteremia // J Microbiol Immunol Infect. – 2010. – № 6, Vol. 43. – P. 498-505.
56. Loch T.P., Faisal M. Emerging flavobacterial infections in fish: A review // Journal of Advanced Research. – 2015. – № 3, Vol. 6. – Р. 283–300.
57. Matsumoto T., Nagata M., Ishimine N. et al. Characterization of CIA-1, an Ambler class A extended-spectrum β-lactamase from Chryseobacterium indologenes // Antimicrob Agents Chemother. – 2012. – № 1, Vol. 56. – P. 588-590.
58. Matu A., Lum Nde A., Oosthuizen L., Hitzeroth A. et al. Draft Genome Sequences of Seven Chryseobacterium Type Strains // Microbiol Resour Announc. 2019. – № 1, Vol. 8. – Р. e01518-18.
59. Mirza H.C., Tuncer O., Olmez S. et al. Clinical strains of Chryseobacterium and Elizabethkingia spp. isolated from pediatric patients in a university hospital: performance of MALDI-TOF MS-based identification, antimicrobial susceptibilities, and baseline patient characteristics // Microb Drug Resist. – 2018. –№ 6, Vol. 24. – Р. 816-821.
60. Mukerji R., Kakarala R., Smith S.J., Kusz H.G. . Chryseobacterium indologenes: an emerging infection in the USA // BMJ Case Rep. – 2016. – bcr2016214486.
61. National Committee for Clinical Laboratory Standards. Performance standards for antimicrobial susceptibility testing. NCCLS Document M100-S4. – 2002. – Vol. 22, №1.
62. Nulens E., Bussels B., Bols A. et al. Recurrent bacteremia by Chryseobacterium indologenes in an oncology patient with a totally implanted intravenous device // Clin Microbiol Infect. – 2001. – № 7, Vol. 7. – P. 391-393.
63. Page A.P., Roberts M., Félix M.A. et al. The golden death bacillus Chryseobacterium nematophagum is a novel matrix digesting pathogen of nematodes // BMC Biology. – 2019. – № 1, Vol. 17. – Р.10.
64. Palewar M.S., Mudshingkar S.S., Dohe V. et al. Infection by multidrug-resistant Chryseobacterium indologenes in cases of obstructive uropathy: case series with short review // Medical Journal of Dr. DY Patil Vidyapeeth. – 2017. – №4, Vol.10. – P. 376-380.
65. Pan H.J., Teng L.J., Chen Y.C. et al. High protease activity of Chryseobacterium indologenes isolates associated with invasive infection // J Microbiol Immunol Infect. – 2000. – № 4, Vol.33. – P. 223-226.
66. Perilli M., Caporale B., Celenza G. et al. Identification and characterization of a new metallobeta-lactamase, IND-5, from a clinical isolate of Chryseobacterium indologenes // Antimicrob Agents Chemother. – 2007. – № 8, Vol. 51. – P. 2988-2990.
67. Pickett M.J. Methods for identification of flavobacteria // J Clin Microbiol. – 1989. – № 10, Vol. 27. – Р. 2309-2315.
68. Pokrywka M., Viazanko K., Medvick J. et al. A Flavobacterium meningosepticum outbreak among intensive care patients // Am J Infect Control. – 1993. – № 3, Vol. 21. – Р.139-145.
69. Schreckenberger P.C., von Gravenitz A. Acinetobacter, Achromobacter, Alcaligenes, Moraxella, Methylobacterium, and other nonfermentative Gram-negative rods // Manual of Clinical Microbiology. – 1999. – Vol. 7. – Р. 539-560.
70. Shivananda P.G. An unusual case of Flavobacterium meningosepticum pneumonia in an immunocompromised patient // Indian J Pathol Microbiol. – 1999. – № 4, Vol. 42. – Р. 491-492.
71. Siegman-Igra Y., Schwartz D., Soferman G., Konforti N. Flavobacterium group II b bacteremia: report of a case and review of Flavobacterium infections // Med Microbiol Immunol. – 1987. – № 2, Vol. 176 – P.103–111.
72. Spangler S.K., Visalli M.A., Jacobs M.R., Appelbaum P.C. Susceptibilities of nonPseudomonas aeruginosa gram-negative nonfermentative rods to ciprofloxacin, ofloxacin, levofloxacin, dofloxacin, sparfloxacin, cef- tazidime, piperacillin, piperacillin-tazobactam, trimetho- prim-sulfamethoxazole, and imipenem // Antimicrob Agents Chemother. – 1996. – № 3, Vol. 40. – Р. 772-775.
73. Srinivasan G., Muthusamy S., Raveendran V. et al. Unforeseeable presentation of Chryseobacterium indologenes infection in a paediatric patient // BMC Res Notes. – 2016. – Vol. 9. – Р. 212.
74. Stamm W.E., Colella J.J., Anderson R.L., Dixon R.E. Indwelling arterial catheters as a source of nosocomial bacteremia: an outbreak caused by Flavobacterium species // N Engl J Med. – 1975. – № 21, Vol. 292. – P. 1099-1102.
75. Steinberg J.P., Del Rio C. Other Gram-negative bacilli // Principles and Practice of Infectious Diseases. – 2000. – Vol. 5. – Р. 2466-2467.
76. Sudharani V., Asiya, Saxena N.K. Chryseobacterium indologenes bacteremia in a preterm baby // Indian J Med Microbiol. – 2011. – № 2, Vol. 29. – P. 196-198.
77. Tekerekoglu M.S., Durmaz R., Ayan M. et al. Analysis of an outbreak due to Chryseobacterium meningosepticum in a neonatal intensive care unit // New Microbiol. – 2003. – № 1, Vol. 26. – Р. 57-63.
78. Vandamme P., Bernardet J.F., Segers P. et al. New perspectives in the classification of the flavobacteria: description of Chryseobacterium gen. nov., Bergeyella gen. nov., and Empedobacternom. rev. // Int J Syst Bacteriol. – 1994. –№ 4, Vol. 44. – P. 827–831.
79. Vaneechoutte M., Dijkshoorn L., Nemec A. et al. Acinetobacter, Chryseobacterium, Moraxella, and other nonfermentative Gram-negative rods J. Versalovic (Ed.) // Manual of clinical microbiology. – 2011. – Vol.10. – P. 714-738.
80. Visalli M. A., Bajaksouzian S., Jacobs M. R., Appelbaum P.C. Comparative activity of trovafloxacin, alone and in combination with other agents, against gram-negative nonfermentative rods // Antimicrob Agents Chemother. – 1997. – № 7, Vol. 41. – P. 1475-1481.
81. Yabuuchi E., Hashimoto Y., Ezaki T. et al. Genotypic and phenotypic differentiation of Flavobacterium indologenes Yabuuchi et al 1983 from Flavobacterium gleum Holmes et al 1984 // Microbiol Immunol. – 1990. – Vol. 34. – Р. 73–76.
82. Yabuuchi E., Kaneko T., Yano I. et al. Sphingobacterium gen. nov., Sphingobacterium spiritivorum comb. nov., Sphingobacterium multivorum comb.nov., Sphingobacterium mizutae sp.nov., and Flavobacterium indologenes sp. nov.: glucose-nonfermenting, gram-negative rods in CDC group IIk-2 and IIb. // Int J Syst Bacteriol. – 1983. – № 3, Vol. 33. – Р. 580–598.
83. Yamaguchi Y., Takashio N., Wachino J. et al. Structure of metallo-beta-lactamase IND-7 from a Chryseobacterium indologenes clinical isolate at 1.65-A resolution // J Biochem. – 2010. – № 6, Vol. 147. – P. 905-915.
84. Zeba B., De Luca F., Dubus A. et al. IND-6, a highly divergent IND-type metallo-beta-lactamase from Chryseobacterium indologenes strain 597 isolated in Burkina Faso // Antimicrob Agents Chemother. – 2009. – № 10, Vol. 53. – P. 4320-4326.
85. Zhang Y., Li D., Yang Y. et al. Clinical and molecular characteristics of Chryseobacterium indologenes isolates at a teaching hospital in Shanghai, China // Journal Annals of Translational Medicine. – 2021. – № 8, Vol 9. – Р. 668.
Рецензия
Для цитирования:
Голубева А.О., Бондаренко А.П., Троценко O.E. Характеристика и клиническое значение некоторых малоизученных возбудителей рода Chryseobacterium (обзор литературы). Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2023;(44):86-98.
For citation:
Golubeva A.O., Bondarenko A.P., Trotsenko O.E. Характеристика и клиническое значение некоторых малоизученных возбудителей рода Chryseobacterium (обзор литературы) Characteristics and clinical significance some little study pathogens of the genus Chryseobacterium: A literature review. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2023;(44):86-98. (In Russ.)
Просмотров:
13
Послать статью по эл. почте 