Review of science-to-practice activity of the Khabarovsk research institute of epidemiology and microbiology of the Federal service for surveillance on consumers rights protection and human wellbeing including molecular-genetic research obtained during year 2022

Various genetic rearrangements occur in the process of evolution of the enteroviruses, rotaviruses, noroviruses, HIV, HBV, HCV and SARS-CoV-2. They lead to emergence of new genetic variants that cause aggravation of the epidemic situation in various regions of the country. Currently, wide application of molecular-genetic methods based on the analysis of nucleotide sequences of causative agent’s genome in the Far Eastern Federal District of the Russian Federation allows to establish epidemiological relationship between disease cases and estimate whether the foci of infection were formed due to a single pathogen or several causative agents. It has been shown that constant surveillance of the above mentioned viruses circulation is necessary to identify signs of epidemic situation deterioration in a particular geographical area. One of these signs is detection of a new genetic variant of pathogen that was most likely imported from a different constituent entity of the Russian Federation or other countries.

1. Акимкин В.Г., Попова А.Ю., Хафизов К.Х., Дубоделов Д.В., Углева С.В. и др. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение II: динамика циркуляции геновариантов вируса SARS-CoV-2 // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2022. – Том 99, №4. – С. 381-396. DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-295.

2. Беляков В.Д., Яфаев Р.Х. Эпидемиология / М.: Медицина. – 1989. – 416 с.

3. Бобкова М.Р. Молекулярно-генетические методы в изучении эпидемиологии инфекций, возбудители которых передаются парентеральным путем: Автореф. дисс. … д-ра. биол. наук. – М., 2002. – 42 с.

4. Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Троценко О.Е., Каравянская Т.Н., Карлов И.С. и др. Расследование очага групповой заболеваемости норовирусной инфекцией в дошкольном образовательном учреждении Хабаровского края (случай из практики) // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 139-141.

5. Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Карлов И.С. Водные вспышки норовирусной инфекции в пос. Многовершинный Хабаровского края // Материалы XII Съезда ВНПОЭМП (26-28 октября 2022 г., Москва) / под ред. профессора А.Ю. Поповой, академика РАН, профессора В.Г. Акимкина. – М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2022. – 654 с. (С. 334-335).

6. Зайцева Н.Н., Ефимов Е.И., Носов Н.Н., Парфенова О.В., Пекшева О.Ю. Современные молекулярно-генетические методы исследования в эпидемиологическом надзоре за ВИЧ-инфекцией // МЕДИАЛЬ. – 2014. - №2 (12). – С. 122-133.

7. Зайцева Т.А., Каравянская Т.Н., Чистяк В.М., Гарбуз Ю.А., Резник В.И., Лебедева Л.А., Троценко О.Е., Корита Т.В. Роль водного фактора в возникновении вспышечной заболеваемости острыми кишечными инфекциями вирусной этиологии (на примере Хабаровского края) // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2015. - №29. – С. 17-25.

8. Котова В.О., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, выделенных на территориях Дальневосточного федерального округа (анализ за 2021-2022 гг. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №43. – С. 84-92.

9. Котова В.О., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А., Троценко О.Е. Мутации резистентности ВИЧ к у пациентов Сахалинской области и Республики Саха (Якутия) // Материалы XII Съезда ВНПОЭМП (26-28 октября 2022 г., Москва) / под ред. профессора А.Ю. Поповой, академика РАН, профессора В.Г. Акимкина. – М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2022. – 654 с. (С. 392-393).

10. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Курганова О.П. и др. Особенности эпидемического прцесса энтеровирусной инфекции в субъектах Дальневосточного и Сибирского федеральных округов в 2021 г. и прогноз заболеваемости на 2022 г. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 70-79.

11. Троценко О.Е., Котова В.О., Сапега Е.Ю., Балахонцева Л.А., Бутакова Л.В. и др. Внедрение методов молекулярно-генетического анализа в практику этиологической расшифровки очагов инфекционных болезней в Хабаровском крае // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2016. - №31. – С. 6-11.

12. Троценко О.Е., Корита Т.В., Котова В.О., Сапега Е.Ю., Курганова О.П., Зайцева Т.А. и др. Эпидемиологические и молекулярно-генетические особенности инфекции COVID-19 в пятую волну пандемии в субъектах Дальневосточного федерального округа Российской Федерации // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 54-69.