ОСОБЕННОСТИ ЦИРКУЛЯЦИИ ЭНТЕРОВИРУСОВ В СЕЗОН ПОДЪЕМА ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ НАСЕЛЕНИЯ ЭНТЕРОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИЕЙ В ДАЛЬНЕВОСТОЧНОМ И СИБИРСКОМ ФЕДЕРАЛЬНЫХ ОКРУГАХ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2019 ГОДУ
Аннотация
Цель исследования – выявить молекулярно-генетические и эпидемиологические особенности циркуляции различных энтеровирусов на территориях Дальневосточного и Сибирского федеральных округов (ДФО и СФО) Российской Федерации.
Материалы и методы. Биологический материал от лиц с подозрением на энтеровирусную инфекцию (ЭВИ) и из объектов окружающей среды исследовали методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) для обнаружения РНК энтеровирусов. Для получения нуклеотидных последовательностей энтеровирусов и определения их типа использовали секвенирование по Сэнгеру с последующим филогенетическим анализом.
Результаты исследования. В целом, по данным молекулярно-генетических исследований, проведенных в ДФО и СФО, установлено, что сезонный подъем заболеваемости ЭВИ в 2019 г. был обусловлен разными типами энтеровирусов, из них вирус Коксаки А-6 преобладал в Хабаровском, Приморском и Красноярском краях, Еврейской автономной и Иркутской областях, республиках Алтай и Саха (Якутия); вирус Коксаки А-16 лидировал в Магаданской и Амурской областях, Республике Хакасия, ЕСНО-6 – в Республике Тыва. С помощью углубленного филогенетического анализа показано, что распространение одной из генетических линий энтеровируса ЕСНО-6 по территориям РФ, в том числе её завоз в Хабаровский край и Республику Тыва, произошли не ранее 2018 г.
Заключение. Результаты проведенного исследования подтвердили важность такого компонента эпидемиологического надзора за ЭВИ, как молекулярно-генетический мониторинг циркуляции энтеровирусов, проводимый на высокотехнологичном уровне и позволяющий осуществлять генотипирование, выявлять возможные эпидемиологические связи случаев заболеваний, предполагать трансграничную импортацию энтеровирусов преимущественно из стран Азиатско-Тихоокеанского региона.
Об авторах
Е. Ю. СапегаРоссия
Сапега Елена Юрьевна – кандидат медицинских наук, руководитель Дальневосточного регионального научно-методического центра по изучению энтеровирусных инфекций
Хабаровск
Л. В. Бутакова
Россия
Хабаровск
О. Е. Троценко
Россия
Хабаровск
В. О. Котова
Россия
Хабаровск
Л. А. Балахонцева
Россия
Хабаровск
Т. А. Зайцева
Россия
Хабаровск
О. П. Курганова
Россия
Благовещенск
М. Е. Егорова
Россия
Якутск
Т. Н. Детковская
Россия
Владивосток
Н. И. Жданова
Россия
П-Камчатский
О. А. Фунтусова
Россия
Южно-Сахалинск
П. В. Копылов
Россия
Биробиджан
С. А. Корсунская
Россия
Магадан
А. В. Семенихин
Россия
Анадырь
С. Э. Лапа
Россия
Чита
Д. Ф. Савиных
Россия
Иркутск
С. С. Ханхареев
Россия
Улан-Удэ
Л. К. Салчак
Россия
Кызыл
Д. В. Горяев
Россия
Красноярск
Т. Г. Романова
Россия
Абакан
Л. В. Щучинов
Россия
Горно-Алтайск
Список литературы
1. Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Троценко О.Е. и др. Молекулярно-эпидемиологическая характеристика групповой заболеваемости энтеровирусной инфекцией, обусловленной вирусом Коксаки А6, среди населения Дальнего Востока Российской Федерации в 2016-2017 гг. // Тихоокеанский медицинский журнал. - 2018. - №3. – С.92-96.
2. Лукашев А.Н., Голицына Л.Н., Вакуленко Ю.А. и др. Современные возможности и направления развития молекулярно-эпидемиологического мониторинга в надзоре за энтеровирусными инфекциями. Опыт Российской Федерации // Инфекция и иммунитет. -2018. – Том 8, №4. – С. 452-464.
3. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е. и др. Роль молекулярно-генетических методов исследования в выявлении потенциальных рисков завоза энтеровирусной инфекции на территорию Хабаровского края // Здоровье населения и среда обитания. – 2018. - №2 (299). - С. 44-51.
4. Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Фунтусова О.А., Ковтонюк Г.П. Особенности эпидемического процесса энтеровирусной инфекции в Сахалинской области на современном этапе // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2019. – Том 19, №5. – С. 33-41.
5. Троценко О.Е., Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В. и др. Оценка риска возникновения вспышечной заболеваемости энтеровирусной инфекцией в Красноярском крае в период проведения XXIX Всемирной зимней универсиады // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2019. - №2 (9). – С.6-17.
6. Trotsenko O.E., Sapega E.Yu., Butakova L.V., Molochniy V.P., Chepel T.V. The role of moleculargenetic research in the system of epidemiological surveillance over enterovirus infection in the Russian Far East and Siberia // Russian Journal of Infection and Immunity. – 2018. – Vol. 8, №4. – P. 538.
7. Drummond A.J., Suchard M.A., Xie D. et al. Bayesian phylogenetics with BEAUTi and the BEAST 1.7. // Molecular Biology and Evolution. - 2012. - Vol. 29, N8. - P. 1969-1973.
8. Shapiro B., Rambaut A., Drummond A.J. Choosing appropriate substitution models for the phylogenetic analysis of protein-coding sequences // Molecular Biology and Evolution. - 2006. - Vol. 23, N1. - P. 7- 9.
Рецензия
Для цитирования:
Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Котова В.О., Балахонцева Л.А., Зайцева Т.А., Курганова О.П., Егорова М.Е., Детковская Т.Н., Жданова Н.И., Фунтусова О.А., Копылов П.В., Корсунская С.А., Семенихин А.В., Лапа С.Э., Савиных Д.Ф., Ханхареев С.С., Салчак Л.К., Горяев Д.В., Романова Т.Г., Щучинов Л.В. ОСОБЕННОСТИ ЦИРКУЛЯЦИИ ЭНТЕРОВИРУСОВ В СЕЗОН ПОДЪЕМА ЗАБОЛЕВАЕМОСТИ НАСЕЛЕНИЯ ЭНТЕРОВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИЕЙ В ДАЛЬНЕВОСТОЧНОМ И СИБИРСКОМ ФЕДЕРАЛЬНЫХ ОКРУГАХ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ В 2019 ГОДУ. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2020;(38):36-43.
For citation:
Sapega E.Yu., Butakova L.V., Trotsenko O.E., Kotova V.O., Balakhontseva L.A., T.A. Zaitseva T.A., Kurganova O.P., Egorova M.E., Detkovskaya T.N., Zdanova N.I., Funtusova O.A., Kopilov P.V., Korsunskaya S.A., Semenihin A.V., Lapa S.E., Savinikh D.F., Khankhareev S.S., Salchak L.K., Goryaev D.V., Romanova T.G., Shuchinov L.V. PECULIARITIES OF ENTEROVIRUS CIRCULATION DURING THE SEASON OF ENTEROVIRUS INFECTION INCIDENCE RAISE IN THE FAR EASTERN AND SIBERIAN FEDERAL DISTRICTS OF THE RUSSIAN FEDERATION IN THE YEAR 2019. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2020;(38):36-43. (In Russ.)