Molecular genetic characteristics of HIV-1 variants isolated in the subjects of the Russian Far East (analysis for 2021-2022)
Abstract
Molecular genetic analysis was carried out for 113 blood plasma samples obtained from patients diagnosed with HIV infection residing in the Sakhalin and Amur regions, Republic of Sakha (Yakutia), Khabarovsk and Primorsky territories. It was revealed that sub-subtype A6 which was found in 77 samples (68,2±4,4%) continues to dominate among the examined patients. Subtype B was identified in 12 samples (10,6±2,9%), subtype C – in 4 (3,5±1,7%). Subtype G was identified in 1 sample (0.9±0.9%) that was obtained from a patient residing in the Republic of Sakha (Yakutia). Recombinant forms of the virus were found In 16.8% of cases (n=19). Recombinant form CRF63_02A1 was revealed in 13 cases (11,5±3,0%), CRF02_AG – in 2 cases (1,8±1,3%). Primary drug resistance mutations, hence a necessity to change therapy, were identified in 34 patients receiving ART (34/81, 41,9±5,5%). The structure of mutations that determine HIV resistance to ART is predominantly presented by substitutions that cause immunological and virological inefficiency of NRTI and NNRTI groups. Virus strains with two-class antiretroviral drug resistance were detected in 61,8±8,3% of samples.
About the Authors
V. O. Kotova
Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Rospotrebnadsor
Russian Federation
Russian Federation
Khabarovsk
O. E. Trotsenko
Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Rospotrebnadsor
Russian Federation
Russian Federation
Khabarovsk
L. A. Balakhontseva
Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Rospotrebnadsor
Russian Federation
Russian Federation
Khabarovsk
E. A. Bazykina
Khabarovsk Research Institute of Epidemiology and Microbiology of the Rospotrebnadsor
Russian Federation
Russian Federation
Khabarovsk
References
1. Богачев В.В., Тотменин А.В., Барышев П.Б., Мещерякова Ю.В., Черноусова Н.Я., Гашникова Н.М. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1 субтипов А и В, выделенных на территории Новосибирской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2012. - №6. - С.45–52.
2. Гашникова Н.М., Сафронов П.Ф., Никонорова Ю.В., Унагаева Н.В., Лаптева Т.А. Свойства изолятов CRF02_AG ВИЧ-11, циркулирующих на территории Новосибирской области // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2011.- №3. – С.38–43.
3. Казеннова Е.В., Лаповок И.А., Лебедев А.В., Лага В.Ю. и др. Анализ резистентности ВИЧ в Приволжском федеральном округе Российской Федерации // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. – 2015. – Т. 7, № 3. – С. 56-66.
4. Калачёва Г.А., Довгополюк Е.С., Мордык А.В., Плеханова М. А., Ситникова С. В., Кондря А. В., Николаева И. И. Эпидемиологическая ситуация сочетанной патологии ВИЧ-инфекции, туберкулеза и наркомании в Сибирском федеральном округе // Сибирское медицинское обозрение. - 2011. – Т.72, №6. - C. 40-43.
5. Конькова-Рейдман А.Б., Селютина Л.И., Кузюкин Н.Н., Рухтина О.Л., Буланьков Ю.И. ВИЧ-инфекция в Южно-Уральском регионе России на современном этапе: анализ эпидемиологической ситуации и новые подходы к оценке эффективности системы противодействия эпидемии // Журнал инфектологии. - 2016. - Т. 7, №. 4. -С. 77-82.
6. Москалейчик Ф.Ф., Лага В.Ю., Корнилаева Г.В. и др. Антигенная и генетическая изменчивость ВИЧ-1 в Российской Федерации на современном этапе. Физиология и патология иммунной системы // Иммунофармакогеномика. — 2015. — Т. 19, № 7. — С. 3–12.
7. Смольская Т.Т., Огурцова С.В. Обзор состояния эпидемии ВИЧ-инфекции в Северо-Западном федеральном округе РФ в 1987-2009 гг. // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. - 2011. - Т. 3, №. 1. - С. 27-36.
8. Справка Федерального информационно-методического центра по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН Центральный НИИЭ Роспотребнадзора «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации на 31 декабря 2021 года».
9. Таенкова И.О., Балахонцева Л.А., Котова В.О., Базыкина Е.А., Троценко О.Е. Эпидемиологическая ситуация по ВИЧ-инфекции в Дальневосточном федеральном округе на современном этапе (краткий обзор за 2020 год) //Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2021. - № 40. - С. 88-92.
10. Таенкова И.О., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А., Котова В.О., Базыкина Е.А. Анализ эпидемиологической ситуации распространения ВИЧ-инфекции в Дальневосточном федеральном округе за 2016-2020 гг. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2021. - № 41. - С.44-52.
11. ЮНЭЙДС. Информационный бюллетень 2021. //https://www.unaids.org/sites/default/files/media_asset
12. Bobkov A., Cheingsong-Popov R., Selimova L. et al. An HIV type 1 epidemic among injecting drug users in the former Soviet union caused by a homogeneous subtype A strain // AIDS Research and Human Retroviruses. - 1997. - Vol. 13, № 14. - Р.1195–1201.
13. Bobkov A., Kazennova E., Khanina T. et al. An HIV type 1 subtype a strain of low genetic diversity continues to spread among injecting drug users in Russia: study of the new local outbreaks in Moscow and Irkutsk //AIDS Research and Human Retroviruses. - 2001. - Vol. 17, №3. Р. 257–261.
14. Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. - 2013. – Vol.4, № 5. – P.204–212.
15. Foley B.T., Leitner T, Paraskevis D, and Peeters M. Primate Immunodeficiency virus classification and nomenclature: review // Infection Genetics and Evolution. - 2016. - Vol. 46. P.150–158.
16. Melikian G.L., Rhee S.Y., Taylor J., Fessel W.J., Kaufman D., Towner W., Troia-Cancio P.V., Zolopa A., Robbins G.K., Kagan R., Israelski D., Shafer R.W. Standardized Comparison of the Relative Impacts of HIV-1 ReverseTranscriptase (RT) Mutations on Nucleoside RT Inhibitor Susceptibility // Antimicrob. Agents Chemother. – 2012. - № 5. - P. 2305–2313.
17. HIV Drug Resistance Database. Avaible at: http://hivdb.stanford.edu.
Review
For citations:
Kotova V.O., Trotsenko O.E., Balakhontseva L.A., Bazykina E.A. Molecular genetic characteristics of HIV-1 variants isolated in the subjects of the Russian Far East (analysis for 2021-2022). Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2022;(43):84-92. (In Russ.)
Views:
10
Email this article 