Interdependence of ARVI and new coronavirus infection incidence in the Republic Sakha (Yakutia) at present period

Acute respiratory viral infections (ARVI) are among the most common infectious diseases. Given the fact that SARS-CoV-2 has a similar transmission route with other ARVI pathogens, assessing the impact of this pathogen on the overall incidence of ARVI is an important issue in modern healthcare. The aim of the research was to study relationship between incidence of acute respiratory viral infections and a COVID-19 in the Republic of Sakha (Yakutia) at present period.

Results. Epidemiological analysis of the ARVI incidence in the Republic of Sakha (Yakutia) showed periods of continuous excess of epidemic threshold as well as increase in the growth rate of the weekly incidence of acute respiratory viral infections compared with previous weeks for the period from 01 March to 10 September of year 2022. The characteristic of ARVI morbidity in different age groups was given. The impact of the child population on the epidemic process of SARS in the Republic of Sakha (Yakutia) was shown. Comparative analysis of ARVI incidence during year 2022 with the same period of the year 2021 was performed in order to reveal differences of the epidemic process dynamics.Comparison of ARVI pathogens etiological structure in Yakutia that was based on laboratory data were analyzed during years 2022 2019 and 2021. Influence of COVID-19 pandemic and various SARS-CoV-2 genovariants (alpha, delta and omicron) on the dynamics of the epidemic process of SARS in different periods of observation was demonstrated for years 2021 and 2022. Analysis showed that emergence of new SARS-CoV-2 variants is accompanied by an increase of ARVI incidence.An increase of different ARVI pathogens abundance, including human coronavirus (HCoV), human metapneumovirus and bocavirus, was noted during years 2021 and 2022 compared to 2019. Should be noted that parainfluenza virus types 1,3 were most prevalent during the three years of observation. Correlation analysis did not show a relationship between frequency detection of the ARVI viruses and ARVI incidence, with the exception of the H3N2 influenza virus, which during the first four months of year 2022 contributed to ARVI epidemic process.

Conclusions: Emergence of the SARS-CoV-2 virus, especially its new genetic variants, had a significant impact not only on the ARVI incidence among the population of the Republic Sakha (Yakutia), but also on the etiological structure of other respiratory viruses that were circulating during years 2021 and 2022.

1. Антонец Д.В., Старчевская М.Е., Колосова Н.П., Суслопаров И.М., Даниленко А.В., Боднев С.А., Швалов А.Н., Трегубчак Т.В., Рыжиков А.Б., Пьянков О.В., Максютов Р.А. Предварительный анализ генетической изменчивости изолятов вируса SARS-CoV-2, относящихся к варианту Омикрон, циркулирующих на территории Российской Федерации // COVID-19-PREPRINTS.MICROBE.RU. – 2022. – doi.org/10.21055/preprints-3112049.

2. Белов А.Б., Куликов П.В. Решенные и проблемные вопросы эпидемиологии гриппа через сто лет после пандемии «испанки» // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2019. – Т. 18, № 5. – С.109-120. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2019-18-5-109-120

3. Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., Воронина О.Л., Игнатьева А.В., и др. Особенности циркуляции возбудителей ОРВИ на фоне появления и широкого распространения SARS-CoV-2 в 2018–2021 годы // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. – Т. 21, № 4. – С. 16-26. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-4-16-26

4. . Карпова Л.С., Волик К.М., Смородинцева Е.А., Столярова Т.П., Поповцева Н.М., Столяров К.А. Влияние гриппа различной этиологии на другие ОРВИ у детей и взрослых в 2014-2016 годах // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2018. – Т. 17, №6 – С. 35-47. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2018-17-35-47

5. Кириллина К. С. Современные тенденции изменения климата республики Саха (Якутия) // Ученые записки Российского государственного гидрометеорологического университета. – 2013. – №. 30. – С. 69-77.

6. Киселева И.В., Ксенафонтов. А.Д. Рино- и РС-вирусы в пандемию COVID-19 // Инфекция и иммунитет. – 2022. – Т. 4, № 12. – С. 624-638.

7. Кравченко Н.А., Казанова В.Б., Хакимова М.И., Гаврилова Т.А., Зайкова З.А., Ботвинкин А.Д. Динамика заболеваемости и этиологической структуры острых респираторных инфекций накануне и в первый год распространения COVID-19 в Иркутской области //Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. – Т. 21, № 3. – С. 50-62. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-3-50-62

8. Краснова Е.И., Карпович Г.С., Проворова В.В., Шестаков А.Е., Казакова Ю.В. Грипп в период пандемии COVID-19, эпидемиологическая характеристика, подходы к вакцинации // Лечащий Врач. – 2021. – № 4. – С. 50-56. https://doi.org/10.51793/OS.2021.98.48.009

9. Семененко Т.А., Акимкин В.Г., Бурцева Е.И., Ноздрачева А.В., и др. Особенности эпидемической ситуации по острым респираторным вирусным инфекциям с учетом пандемического распространения COVID-19 // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. –Т. 21, № 4. – С. 4-15. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-4-4-15

10. Хабарова А. В., Соцкая Я. А. Особенности гриппа в период пандемии COVID-19 // Экологические проблемы экспериментальной и клинической медицины. – 2021. – С. 199-207.

11. Хунафина, Д. Х., Рахматуллина, Г. С., Асадуллина, О. А., Хасанова, Г. и дрю. Заболеваемость ОРВИ и гриппом за 2019 год по данным ГБУЗ РБ ИКБ № 4 //Фундаментальные и прикладные аспекты иммунологии, генетики и инфектологии. – 2020. – С. 155-163.

12. Ortiz-Prado E., Simbaña-Rivera K., Gomez-Barreno L., Rubio-Neira M., et al. Clinical, molecular, and epidemiological characterization of the SARS-CoV-2 virus and the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19), a comprehensive literature review // Diagnostic microbiology and infectious disease. – 2020. – Vol. 98, №. 1. – P. 115094.

13. Willet B.J., Grove J., MacLean O.A., Wilkie C., et al. The hyper-transmissible SARS-CoV-2 Omicron variant exhibits significant antigenic change, vaccine escape and a switch in cell entry mechanism // medRxiv. –2022. DOI: 10.1101/2022.01/03.21268111.