Preview

Far Eastern Journal of Infectious Pathology

Advanced search

GENETIC DIVERSITY OF HEPATITIS B AND C VIRUSES AMONG POPULATION OF THE SAKHALIN OBLAST

Abstract

Serological and molecular-genetic analysis was performed for 39 samples of blood serum/plasma obtained from patients diagnosed with chronic viral hepatitis residing in the territory of the Sakhalin oblast. HBV DNA was revealed in 7 out of 18 samples of blood plasma of the patients with revealed serological markers of hepatitis B virus. HBV genotype D including subgenotypes D1, D2, D3 was detected in 5 samples. HBV subtype A was revealed in 2 out of 7 samples. HCV RNA was isolated in 24 out of 32 (68.6±5.5%) blood plasma samples positive for HCV antibodies that were detected with ELISA. Molecular-genetic survey of hepatitis C virus revealed circulation of subtypes 1a, 1b, 2a and 3a with predominance of subtype 3a.

About the Authors

V. O. Kotova
FBUN Khabarovsk research institute of epidemiology and microbiology of the Federal service for surveillance on consumers rights protection and human wellbeing (Rospotrebnadzor)
Russian Federation

 Khabarovsk 



E. A. Bazykina
FBUN Khabarovsk research institute of epidemiology and microbiology of the Federal service for surveillance on consumers rights protection and human wellbeing (Rospotrebnadzor)
Russian Federation

 Khabarovsk 



L. A. Balakhontseva
FBUN Khabarovsk research institute of epidemiology and microbiology of the Federal service for surveillance on consumers rights protection and human wellbeing (Rospotrebnadzor)
Russian Federation

 Khabarovsk 



O. E. Trotsenko
FBUN Khabarovsk research institute of epidemiology and microbiology of the Federal service for surveillance on consumers rights protection and human wellbeing (Rospotrebnadzor)
Russian Federation

 Khabarovsk 



O. A. Funtusova
Regional Rospotrebnadzor office in the Sakhalin oblast
Russian Federation

 Yuzhno-Sakhalinsk 



E. A. Lomakina
Sakhalin Regional AIDS Center
Russian Federation

 Yuzhno-Sakhalinsk 



References

1. ВОЗ: Информационный бюллетень. Гепатит С. - 2021, ВОЗ: Информационный бюллетень. Гепатит В. - 2021. www.who.int.

2. Герасимова В. В., Максимова Н.Р., Левакова И.А., Мукомолов С.Л. Молекулярная эпидемиология вируса гепатита В в Якутии // Якутский медицинский журнал. –2014. – № 3(47). – С. 54-57.

3. Государственный доклад «О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации по Республике Саха (Якутия) в 2022 году», https://www.rospotrebnadzor.ru/documents/details.php?ELEMENT_ID=25076

4. Елпаева Е.А., Никитина О.Е., Писарева М.М., Шилова И.В. и др. Генетические варианты вируса гепатита В у пациентов с хроническим гепатитом В // Журнал инфектологии. - 2015. - Т.7, №3. - C.44-50.

5. Кочнева Г.В., Мануйлов В.А., Нетесова И.Г., Чуб Е.В. и др. Генотипы и субгенотипы изолятов вируса гепатита В на территории Сибири // Проблемы Особо Опасных Инфекций. – 2011. - №3 (109). - С.31-35.

6. Кравченко А.В., Куимова У.А., Ганкина Н.Ю., Канестри В.Г., Чуланов В.П. Предикторы устойчивого вирусологического ответа при терапии хронического гепатита пегилированным интерфероном и рибавирином у больных ВИЧ-инфекцией // Инфекционные болезни. - 2014. - Т. 12, № 2. - С. 30–34.

7. Кюрегян К.К., Михайлов М.И. Молекулярно-биологические основы контроля вирусных гепатитов. - Москва: «Икар», 2013. - 336 с.

8. Львов, Д. К., Самохвалов Е.И., Миширо С., Тсуда Ф., Селиванов Н.А., Окамото Х., Стаханова В.М. Закономерности распространения вируса гепатита С и его генотипов в России и странах СНГ // Вопросы вирусологии. - 1997. - № 4. - С. 157-161.

9. Мукомолов С.Л., Левакова Л.Г., Сулягина Е.В., Синайская Е.В., Болсун Д.Д., Иванова Н.В. Современная эпидемиология гепатита С в России // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2012. - № 6. - C. 21–25.

10. Семенов А.В., Останкова Ю.В., Герасимова В.В., Бичурина М.А., Козлов А.В., Мукомолов С.Л., Тотолян А.А. Молекулярно-эпидемиологические особенности изолятов вируса гепатита С из разных регионов Республики Саха (Якутия) // Инфекция и иммунитет. – 2015. - Т.5, №4. - С.359-372.

11. Соболева Н.В., Карлсен А.А., Кожанова Т.В., Кичатова В.С., Клушкина В.В., Исаева О.В., Игнатьева М.Е., Романенко В.В., Ооржак Н.Д., Малинникова Е.Ю., Кюрегян К.К., Михайлов М.И. Распространенность вируса гепатита С среди условно здорового населения Российской Федерации // Журнал инфектологии. - 2017. - Т.9, №2. - С.56-64.

12. Чуб Е.В., Кочнева Г.В., Гранитов В.М. и др. Рекомбинанты вируса гепатита С типа 2k/1b у населения Алтайского края // Инфекционные болезни. - 2007. - Т.5, № 4. С.5-11.

13. Чуланов В.П. Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В: Автореф. дис. …докт. мед. наук: 14.02.02. – Москва, 2013. – 47 с.

14. Borgia S. M., Hedskog C., Parhy B. et al. Identification of a novel hepatitis C virus genotype from Punjab, India: expanding classification of hepatitis C virus into 8 genotypes // J Infect Dis. – 2018. – Vol.288, №11. – Р.1722-1729. doi: 10.1093/infdis/jiy401.

15. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), 2022 URL: https://talk.ictvonline.org/ictv_wikis/flaviviridae/w/sg_flavi/56/hcv-classification. (Accessed: 15.05.2023).

16. Kramvis A, Kew M, Francois G. Hepatitis B virus genotypes // Vaccine. – 2005. - Vol.23, №19. – Р.2409-23. doi: 10.1016/j.vaccine.2004.10.045.

17. Kramvis A, Kew MC. Relationship of genotypes of hepatitis B virus to mutations, disease progression and response to antiviral therapy // J Viral Hepat. – 2005. – Vol.12, №5. – Р.456-64. doi: 10.1111/j.1365-2893.2005.00624.x.

18. Kramvis A. Genotypes and genetic variability of hepatitis B virus // Intervirology. -2014. -Vol.57, №3-4. – Р.141-50. doi: 10.1159/000360947.

19. Lin CL, Kao JH. The clinical implications of hepatitis B virus genotype: Recent advances. // J Gastroenterol Hepatol. – 2011. – Vol.26. – P.123-130. doi.org/10.1111/j.1440-1746.2010.06541.x

20. Rajhi M., Ghedira K., Chouikha A. et al. Phylogenetic Analysis and Epidemic History of Hepatitis C Virus Genotype 2 in Tunisia, North Africa // PLoS One. – 2016. - Vol4, № 11. - e0153761. doi:10.1371/journal.pone.0153761.

21. Tamura K., Stecher G., Peterson D. et al. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0 // Molecular Biology and Evolution. – 2013. - №30. - Р..2725-2729. doi: 10.1093/molbev/mst197.

22. Tatematsu K. A genetic variant of hepatitis B virus divergent from known Human and ape genotypes isolated from a Japanese patient and provisionally assigned to new genotype J // J. Virol. – 2009. – V.83, №20. – P.10538-10547. doi: 10.1128/JVI.00462-09.

23. Wang Z., Liu Z., Zeng G. et al. A new intertype recombinant between genotypes C and D of hepatitis B virus identified in China // J. Gen. Virol. –2005. – Vol. 86. – P. 985-990. doi: 10.1099/vir.0.80771- 0


Review

For citations:


Kotova V.O., Bazykina E.A., Balakhontseva L.A., Trotsenko O.E., Funtusova O.A., Lomakina E.A. GENETIC DIVERSITY OF HEPATITIS B AND C VIRUSES AMONG POPULATION OF THE SAKHALIN OBLAST. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2023;(45):32-41. (In Russ.)

Views: 6


Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 2073-2899 (Print)