COMPARATIVE ANALYSIS OF THE EFFECTIVENESS OF PCR TEST SYSTEMS FOR GENOTYPING HEPATITIS C VIRUS VARIANTS DISTRIBUTED ON THE TERRITORY OF PRIMORSKY KRAI
https://doi.org/10.62963/2073-2899-2024-47-30-32
Abstract
A comparative analysis of the effectiveness of two commercial sets of PCR test systems has been carried out: "Polyvir HCV genotype" and "AmpliSens HCV-genotype-FL" designed for genotyping hepatitis C virus (Amarillovirales: Flaviviridae, Hepacivirus). The work uses blood serum samples obtained from patients who are registered with chronic hepatitis C in the Primorsky krai.
About the Authors
R. V. OmelchenkoRussian Federation
Vladivostok
Yu. A. Belov
Russian Federation
Vladivostok
P. G. Milovankin
Russian Federation
Vladivostok
M. V. Pavlyuk
Russian Federation
Vladivostok
T. S. Sitdikova
Russian Federation
Vladivostok
A. I. Simakova
Russian Federation
Vladivostok
O. B. Romanova
Russian Federation
Vladivostok
M. Yu. Shchelkanov
Russian Federation
Vladivostok
References
1. Беседнова Н.Н., Андрюков Б.Г., Запорожец Т.С. и др. Оболочечные вирусы – патогенетическая мишень лектинов цианобактерий // Антибиотики и химиотерапия. – 2022. – Т.67, №5-6. – С. 39-60.
2. Беседнова Н.Н., Запорожец Т.С., Ермакова С.П. и др. Природные соединения – потенциальная основа средств профилактики и терапии гепатита С // Антибиотики и химиотерапия. – 2023. – Т.68 ,№11-12. – С. 75-90.
3. Дземова А.А., Ганченко Р.А., Трифонова Г.Ф. и др. Хронический гепатит Св Российской Федерации после начала программы элиминации HCV-инфекции // Гепатология и гастроэнтерология.- 2020. – Т.4, №2.- С. 165-170.
4. Иванов А.В., Кузякин А.О., Кочетков С.Н. Молекулярная биология вируса гепатита С // Успехи биологической химии. – 2005. - № 45. - С. 37-86.
5. Котова В.О., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А. и др. Генетическое разнообразие вируса гепатита Ссреди населения Нанайского района Хабаровского края // Инфекция и иммунитет. – 2021. – Т.11, №1. – С. 148-156.
6. Кочнева Г.В., Карташов М.Ю., Кривошеина Е.И. и др. О возможности искоренения гепатита C в России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2021. – Т.39,№1. – С. 31-41.
7. Лиознов Д.А., Дунаева Н.В., Чунг Н.Х. и др. Хронический гепатит С: современное состояние проблемы // Нефрология. - 2019. - Т.23, №4. – С.36-46.
8. Мамедов М.К., Михайлов М.И. Основные направления и этапы изучения вируса гепатита С и вызываемой им инфекции и важнейшие достижения в борьбе с вирусным гепатитом С // Биомедицина (Баку). - 2019. – Т.17, №3. - С. 4-17.
9. Медицинская вирусология / Ред.: Д.К. Львов. М.: Мед.информ. агенство (МИА), 2008 - 655 с.
10. Омельченко Р.В., Ручко И.А., Абашина В.Л. Заболеваемость парентеральными вирусными гепатитами на территории Приморского края в 2011-2021 году // В сб.: Санитарноэпидемиологический щит Дальнего Востока: результаты деятельности, взгляд в будущее: сборник статей Всероссийской научно-практической конференции с международным участием, посвященной 100-летию со дня образования государственной санитарно-эпидемиологической службы России. Владивосток – 2022. - С. 75-80.
11. Омельченко Р.В., Щелканов М.Ю. Эпидемиология вирусного гепатита Св Приморском крае // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2023. - №45. – С.133-134.
12. Патлусов Е.П., Валамина И.Е., Кузнецов П.Л. и др. Особенности нарушения липидного и углеводного обмена у больных хроническим гепатитом Св зависимости от генотипа // Медицинский вестник Башкортостана. – 2019. – Т.14, №5. – С. 23-30.
13. Руководство по вирусологии. Вирусы и вирусные инфекции человека и животных / Ред.: Д.К. Львов. М.: Мед.информ. агенство (МИА), 2013 - 1200 с.
14. Borgia S.M., Hedskog C., Parhy B., et al. Identification of a novel Hepatitis C virus genotype from Punjab, India: Expanding classification of Hepatitis C virus into 8 genotypes // J. Infect. Dis. – 2018. – V.218, N11. – P. 1722-1729.
15. Coppola N., Minichini C., Starace M., et al. Clinical impact of the hepatitis C virus mutations in the era of directly acting antivirals // J. Med. Virol. – 2016. – V.88, N10. – P. 1659-1671.
16. Galli A., Bukh J. Mechanisms and consequences of genetic variation in hepatitis C virus (HCV) // Curr. Top.Microbiol.Immunol. – 2023. - N439. – P. 237-264.
17. Martinez M.A., Franco S. Therapy implications of Hepatitis C virus genetic diversity // Viruses. – 2020. – V.13, N1. –P. 41.
18. Tsukiyama-Kohara K., Kohara M. Hepatitis C virus: Viral quasispecies and genotypes // Int. J. Mol. Sci. – 2017. - V.19, N1. – Р.23.
19. WHO. Global health sector strategies on, respectively, HIV, viral hepatitis and sexually transmitted infections for the period 2022-2030 // 2022; URL: https://www.who.int/publications/i/item/9789240053779
Review
For citations:
Omelchenko R.V., Belov Yu.A., Milovankin P.G., Pavlyuk M.V., Sitdikova T.S., Simakova A.I., Romanova O.B., Shchelkanov M.Yu. COMPARATIVE ANALYSIS OF THE EFFECTIVENESS OF PCR TEST SYSTEMS FOR GENOTYPING HEPATITIS C VIRUS VARIANTS DISTRIBUTED ON THE TERRITORY OF PRIMORSKY KRAI. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2024;(47):30-32. (In Russ.) https://doi.org/10.62963/2073-2899-2024-47-30-32