МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ШТАММОВ ЭНТЕРОВИРУСОВ, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
Аннотация
В статье приведены результаты филогенетического анализа 5-ти разновидностей штаммов энтеровирусов, циркулирующих на территории Дальневосточного федерального округа Российской Федерации (Коксаки А-6, ЕСНО-18, ЕСНО-30, Коксаки В-4 и Коксаки В-5). На основе филогенетических взаимоотношений установлены возможные эпидемиологические связи с аналогичными серотипами энтеровирусов, выявленными в других странах.
Об авторах
Елена Юрьевна Сапега
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
Людмила Васильевна Бутакова
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
Валерия Олеговна Котова
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
О. Е. Троценко
ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора
Россия
Россия
Т. А. Зайцева
Управление Роспотребнадзора по Хабаровскому краю
Россия
Россия
О. П. Курганова
Управление Роспотребнадзора по Амурской области
Россия
Россия
М. Е. Игнатьева
Управление Роспотребнадзора по Республике Саха (Якутия)
Россия
Россия
Ю. А. Гарбуз
ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Хабаровском крае»
Россия
Россия
Б. Б. Дарижапов
Управление Роспотребнадзора по Сахалинской области
Россия
Россия
В. А. Янович
Управление Роспотребнадзора по Еврейской автономной области
Россия
Россия
Список литературы
1. Лукашев В.В. Молекулярная эволюция и филогенетический анализ. - М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2009. - 256 с. : ил.
2. Oberste M.S., Maher K, Williams AJ, Dybdahl- Sissoko N, Brown BA, Gookin MS, Peñaranda S, Mishrik N, Uddin M, Pallansch MA. Species-specific RT-PCR amplification of human enteroviruses: a tool for rapid species identification of uncharacterized enteroviruses // J. Gen. Virol. - 2006. - Vol. 87, № 1. - P. 119-128.
3. Nix WA, Oberste MS, Pallansch MA. Sensitive, seminested PCR amplification of VP1 sequences for direct identification of all enterovirus serotypes from original clinical specimens // J. Clin. Microbiol. - 2006. - Vol. 44, № 8. - Р. 2698-704.
4. Tamura K, Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees // Mol. Biol. Evol. - 1993. - Vol. 10. - P. 512-526.
5. Tamura K., Stecher G., Peterson D., Filipski A., Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 6.0. // Molecular Biology and Evolution. - 2013. - Vol. 30. - Р. 2725-2729.
Рецензия
Для цитирования:
Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Котова В.О., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Курганова О.П., Игнатьева М.Е., Гарбуз Ю.А., Дарижапов Б.Б., Янович В.А. МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ И ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ШТАММОВ ЭНТЕРОВИРУСОВ, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ДАЛЬНЕВОСТОЧНОГО ФЕДЕРАЛЬНОГО ОКРУГА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2015;(28):26-33.
For citation:
Sapega E.Yu., Butakova L.V., Kotova V.O., Trotsenko O.E., Zaitseva T.A., Kurganova O.P., Ignat’Eva M.E., Garbuz Yu.A., Darizhapov B.B., Yanovich V.A. Molecular-genetic variability and phylogenetic analysis of enterovirus strains, circulating on the territory the Far East Federal District of the Russian Federation. Far Eastern Journal of Infectious Pathology. 2015;(28):26-33. (In Russ.)
Просмотров:
89
Послать статью по эл. почте 