MOLECULAR EPIDEMIOLOGICAL ANALYSIS OF THE SITUATION OF CHOLERA IN THE RUSSIAN FAR EAST DURING THE SEVENTH PANDEMIC

The analysis of the situation of cholera in the Far East during the seventh pandemic was made with using modern molecular technologies. It was found, that the epidemiological onsets of cholera in the territory during the analyzed period is characterized by the registration of individual cases of introduction of infection, and as a result developing in two cases acute local outbreaks of cholera with the recovering of toxigenic pathogen from environmental objects, long-term detection of V. cholerae eltor in surface water in the satisfactory cholera period. Molecular-epidemiological analysis based on complex methodological approaches (amplification profiling, MLVA- PFGE- MLST-typing) isolates showed the ability to differentiate into separate groups according to their epidemiological significance and identified polymorphisms within these groups on the structure of individual loci, that determines the effectiveness of different approaches to identifying the causes of complications for cholera, clarifying the direction of the skid and pathways of the pathogen in the territory.

холера, молекулярно-эпидемиологический анализ, V. cholerae, молекулярное типирование, PFGE, MLVA, MLST, cholera, molecular-epidemiological analysis, molecular typing

1. Лабораторная диагностика холеры: Методические указания МУК 4.2.2218-07. - М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора

2. Миронова Л.В., Балахонов С.В., Урбанович Л.Я., Кожевникова А.С., Половинкина В.С., Куликалова Е.С., Афанасьев М.В. Молекулярно-генетический анализ эпидемически опасных штаммов Vibrio cholerae eltor, изолированных в Сибирском и Дальневосточном районах России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2012. - № 2. - С. 13-20.

3. Миронова Л.В. Афанасьев М.В. Басов Е.А., Урбанович Л.Я., Балахонов С.В. Ретроспективный макрорестрикционный анализ штаммов Vibrio cholerae eltor, изолированных при эпидемических осложнениях на дальнем востоке России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2014. - № 2. - С. 29-36.

4. Москвитина Э.А., Адаменко О.Л., Кругликов В.Д., Титова С.В., Монахова Е.В., Писанов Р.В., Иванова С.М., Анисимова Г.Б. Холера: эпидемиологическая обстановка в мире в 2005 - 2014 гг., прогноз на 2015 г. // Пробл. особо опас. инф.- 2015 - Вып.1. - С. 18-25.

5. Обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия в период подготовки и проведения саммита АТЭС-2012 / под ред. Академика РАМН Г.Г. Онищенко // Новосибирск: Наука-Центр, 2013. - 419 с.

6. Обеспечение санитарно-эпидемиологического благополучия населения при ликвидации последствий наводнения на Дальнем Востоке (2013 г.) / Под ред. Г.Г. Онищенко, С.В. Балахонова: Новосибирск: Наука-Центр, 2014.

7. Онищенко Г. Г., Марамович А. С., Голубинский Е.П. и др. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщение 1. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры эльтор в г. Владивостоке // Журн. микробиол. - 2000. - № 5. - С. 26-31.

8. Онищенко Г.Г., Марамович А.С., Голубинский Е.П. и др. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщение 2. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры эльтор в г. Южно-Сахалинск // Журн. микробиол. - 2000. - № 5. - С.31-35.

9. Garg P., Aydanian A., Smith D., Glenn M.J., Nair G.B., Stine O.C. Molecular Epidemiology of O139 Vibrio cholerae: Mutation, Lateral Gene Transfer, and Founder Flush. Emerg // Infect. Dis. - 2003. - V. 9(7). - P. 810-814.

10. Kim E.J., Lee D., Moon S.H., Lee C.H., Kim D.W. CTX Prophages in Vibrio cholerae O1 Strains // J. Microbiol. Biotechnol. - 2014. - V. 24(6). - P. 725-731

11. Standard operating procedure for PFGE of Vibrio cholerae and Vibrio parahaemolyticus. Interational Molecular Subtyping Network for Foodborne Disease Surveillance // Pulsenet International. 2013. Available at: http://www.pulsenetinternational.org/assets/PulseNet/uploads/pfge/PNL06_Vchol-VparahPFGEprotocol. pdf (accessed 22 January 2013).

12. Weekly epidemiological record - 2011. - Vol.86, No. 31 - P. 325-340.

13. Weekly epidemiological record - 2012. - Vol.87, No. 31-32 - P. 289 - 304.

14. Weekly epidemiological record - 2013. - Vol.88, No. 31- 32 - P. 321-336.

15. Weekly epidemiological record - 2014. - Vol.89, No. 31 - P. 345-356.