CHARACTERISTICS AND LEVELS OF BACTERIAL PATHOGENS ISOLATION IN PATIENTS SUFFERING FROM COMMUNITY-ACQUIRED PNEUMONIA DEPENDING OF LENGTH OF HOSPITAL STAY (NOVEMBER-DECEMBER OF YEAR 2020)

The research presents characteristics of drug resistance and levels of bacterial pathogens detection in sputum of 82 patients with pneumonia depending upon length of their hospital stay: 44 patients were examined on 1st – 3rd day of hospitalization, 17 patients – on 4-10 day of hospitalization, 21 patients – on 11th – 22nd day of hospitalization. Bacterial microflora was isolated in 64 from 82 observed patients (78.0±4.6%). Significant Gramm-negative pathogens (Klebsiella pneumoniae, Escherichiae coli, Acinetobacter baumannii complex, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia) were identified rarely in patients suffering from moderate severity of the disease (7.3±2.9%; 2.4±1.7%; 3.7±2.1%; 2.4±1.7%; 1.2±1.2%, respectively).Drug resistant forms of K. pneumoniae, E. coli – producents of ESBL were isolated in group of patients that had longest hospital stay. Gramnegative nonfermentable bacteria (A. baumannii complex, P. aeruginosa, S. maltophilia) were detected in patients that were examined in first days of hospitalization as well as in those that were hospitalized during a long period of time. Should be noted that A. baumannii carbapenemaseproducers were isolated from patients that underwent a long course of outpatient treatment (up to one month).

High levels of fungi Candida spp. detection were revealed during all periods of inpatient observation (65.9±7.1%; 70.6±11.4%; 42.8±11.1%). All four species of Candida spp. (albicans, glabrata, tropicalis, krusei) were isolated during all periods of inpatient observation

1. Цинзерлинг В.А., Свистунов В.В., Макарова А.Е., Ботвинкин А.Д. Современные подходы к анализу смертности от пневмоний. Журнал инфектологии 2016; 8(4): 5-10.

2. Цинзерлинг В.А., Свистунов В.В. Пневмококковая (крупозная) пневмония: клиникоморфологический особенности. Архив патологии 2013; 3:22-30.

3. Du Toit A. Measles increases the risk of other infections. Nat. Rev. Microbiol. 2019; 18:2. DOI: 10.1038/s41579-019-0301-7.

4. Zhou Y., Guo S., He Y., Zuo Q., Liu D., Xiao M., Fan J., Li X. COVID-19 Is Distinct From SARSCoV-2-Negative Community-Acquired Pneumonia. Front. Cell. Infect. Microbiol. 2020; https://doi.org/10.3389/fcimb.2020.00322.

5. Куцевалова О.Ю., Козель Ю.Ю., Розенко Д.А., Мартынов Д.В., Коршункова О.В. Анализ антибиотикорезистентности основных грамотрицательных патогенов в стационарах Ростова-на-Дону и области. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия 2020; 22(2): 143-148.

6. Попова А.Ю., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Носков А.К., Ковалев Е.В., Чемисова О.С., Твердохлебова Т.И., Павлович Н.В., Водопьянов С.О., Цимбалистова М.В., Гаевская Н.Е., Воловикова С.Ф., Стенина С.И., Гудуева Е.Н., Сагакянц М.М., Алешукина А.В., Слись С.С. Особенности этиологии внебольничных пневмоний, ассоциированных с COVID-19. https://doi.org/10.21055/preprints-3111913. Дата обращения 27.05.2021.

7. Гончаров А.Е., Зуева Л.П., Мохов А.С., Колоджиева В.В., Мельцер А.А., Смирнова М.В., Хавлина Т.В., Оришак Е.А. Распространение мультиантибиотикорезистентных возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, в стационарах для лечения пациентов с COVID-19. Практические аспекты эпидемиологии и вакцинопрофилактики. 2021;20(2):68-73.

8. А.В. Караулов, С.С. Афанасьев, В.А. Алешкин, Н.Л. Бондаренко, Е.А. Воропаева, М.С. Афанасьев, Ю.В. Несвижский, А.В. Алешкин, О.Ю. Борисова, Е.Г. Овсянникова, О.В. Рубальский, А.Л. Пылев, С.С. Бочкарева, В.Г. Сердюков, Е.Е. Рубальская, А.Д. Воропаев, Р.С. Махмудов. Механизмы приобретения вирулентности условно-патогенными микроорганизмами и формирования пула нозокомиальных штаммов в микробиоценозах слизистых открытых полостей организма. Астраханский медицинский журнал. 2018; 13(2 ): 17-31. DOI 10.17021/2018.13.2.17.31.

9. Crossman, L. C., V. C. Gould, J. M. Dow, G. S. Vernikos, A. Okazaki, M. Sebaihia, D. Saunders, C. Arrowsmith, T. Carver, N. Peters, E. Adlem, A. Kerhornou, A. Lord, L. Murphy, K. Seeger, R. Squares, S. Rutter, M. A. Quail, M. A. Rajandream, D. Harris, C. Churcher, S. D. Bentley, J. Parkhill, N. R. Thomson, M. B. Avison. The complete genome, comparative and functional analysis of Stenotrophomonas maltophilia reveals an organism heavily shielded by drug resistance determinants Genome Biol 2008; 9: R74. DOI: 10.1186/gb-2008-9-4-r74.

10. Toleman, M. A., P. M. Bennett, D. M. Bennett, R.N. Jones, and T. R. Walsh. Global emergence of trimethoprim/sulfamethoxazole resistance in Stenotrophomonas maltophilia mediated by acquisition of sul genes. Emerg Infect Dis 2007; 13: 559-565. DOI: 10.3201/eid1304.061378.

11. Falagas, M. E., P. E. Valkimadi, Y. T. Huang, D. K. Matthaiou, and P. R. Hsueh. Therapeutic options for Stenotrophomonas maltophilia infections beyond co-trimoxazole: a systematic review. J AntimicrobChemother 2008; 62: 889-894. DOI: 10.1093/jac/dkn301.

12. Downhour, N. P., E. A. Petersen, T. S. Krueger, K. V. Tangella, and D. E. Nix. Severe cellulitis/myositis caused by Stenotrophomonas maltophilia. Ann Pharmacother 2002; 36: 63-66. DOI: 10.1345/aph.1A148.

13. Garcia Sanchez, J. E., M. L. Vazquez Lopez, A. M. Blazquez de Castro, J. A. Perez Simon, N. G. Gutierrez, I. T. Martin, and J. A. Garcia-Rodriguez. Aztreonam/clavulanic acid in the treatment of serious infections caused by Stenotrophomonas maltophilia in neutropenic patients: case reports. J Chemother 1997; 9:238-240. DOI: 10.1179/joc.1997.9.3.238.