infectpataogДальневосточный журнал инфекционной патологииFar Eastern Journal of Infectious Pathology2073-2899ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора10.62963/2073-2899-2025-51-6-15infectpataog-557Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ. ВИЧ-ИНФЕКЦИЯORIGINAL RESEARCHES. HIV INFECTIONДАННЫЕ ТЕКУЩЕГО МОНИТОРИНГА РАЗВИТИЯ РЕЗИСТЕНТНОСТИ ВИЧ-1 У ЖИТЕЛЕЙ С ВИЧИНФЕКЦИЕЙ ТОМСКОЙ ОБЛАСТИCURRENT MONITORING DATA ON THE DEVELOPMENT OF HIV-1 RESISTANCE IN RESIDENTS WITH HIV INFECTION IN THE TOMSK REGIONОсиповаИ. П.OsipovaI. P.

Осипова Ирина Павловна – младший научный сотрудник отдела ретровирусов,

п. Кольцово

Koltsovo

osipova_ip@vector.nsc.ruКрикливаяН. П.KriklivayaN. P.

п. Кольцово

Koltsovo

ГашниковаМ. П.GashnikovaM. P.

п. Кольцово

Koltsovo

ГотфридЛ. Г.GotfridL. G.

п. Кольцово

Koltsovo

АрхиповА. М.ArkhipovA. M.

г. Томск

Tomsk

ШейманТ. Н.SheimanT. N.

г. Томск

Tomsk

ТотменинА. В.TotmeninA. V.

п. Кольцово

Koltsovo

КаминскийО. О.KaminskyO. O.

г. Томск

Tomsk

ГашниковаН. М.GashnikovaN. M.

п. Кольцово

Koltsovo

ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» РоспотребнадзораРоссияState Research Center of Virology and Biotechnology “Vector” of RospotrebnadzorRussian FederationОГБУЗ «Томский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и другими и инфекционными заболеваниями»РоссияTomsk Regional Center for the Prevention and Control of AIDS and Other Infectious DiseasesRussian Federation202523042026051615Copyright © Осипова И.П., Крикливая Н.П., Гашникова М.П., Готфрид Л.Г., Архипов А.М., Шейман Т.Н., Тотменин А.В., Каминский О.О., Гашникова Н.М., 20262026Осипова И.П., Крикливая Н.П., Гашникова М.П., Готфрид Л.Г., Архипов А.М., Шейман Т.Н., Тотменин А.В., Каминский О.О., Гашникова Н.М.Osipova I.P., Kriklivaya N.P., Gashnikova M.P., Gotfrid L.G., Arkhipov A.M., Sheiman T.N., Totmenin A.V., Kaminsky O.O., Gashnikova N.M.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://infectpataog.elpub.ru/jour/article/view/557

В работе представлены результаты молекулярно-эпидемиологического мониторинга за ВИЧ-1 в Томской области. Целью исследования был анализ развития и распространения ВИЧ-1, резистентных к препаратам антиретровирусной терапии. Показано, что на территории Томской области продолжает доминировать генетический вариант ВИЧ-1 CRF63_02A6, выявленный в 75% образцов, субтип А6 выявляется примерно в 15% и в 10% случаев – возникающие уникальные рекомбинантные формы вируса. Передача первично резистентных ВИЧ происходит в 9,5% случаев, в 50% регистрируется ВИЧ-1 с мутацией K103N, вызывающей высокие уровни резистентности к невирапину и эфавиренцу. При неэффективности АРТ в 78% случаев развивается резистентность ВИЧ-1 среднего и высокого уровня, в 53% случаев выделены ВИЧ-1, резистентные к НИОТ и ННИОТ. Лидирует по частоте выявления среди НИОТ мутация M184V/I (65,6%), ответственная за резистентность высокого уровня к ламивудину и эмтрицитабину. Встречаемость других мутаций ВИЧ к НИОТ не превышает 10%. Среди мутаций ВИЧ к ННИОТ K103N найдена в 28% случаев, чаще выявляется мутация V106I (29,3%), являющаяся основной мутацией резистентности вируса к элсульфавирину (ESV). Присутствуют и другие замены, связанные со снижением чувствительности вируса к ESV – это мутации в кодонах E138K (16,0%), Y181C (13,3%), A98G (10,7%), Y188L/Н (6,6%), L100I (2,7%), M230L (2,7%) и F227L (1,3%). У 10 из 77 (13,0%) пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ выделены ВИЧ-1 со сниженной чувствительностью к ИИ. В 18,2% случаев ЛЖВ с неэффективной АРТ имели вирусную нагрузку от 200 тыс. до 2 млн копий РНК/мл, выделенные у них вирусы обладали высоким и средним уровнями резистентности к 2-4 классам препаратов АРТ одновременно. Полученные результаты указывают на актуальность расширения доступа ЛЖВ к анализу резистентности ВИЧ и важность усиления мониторинга эффективности проводимой АРТ.

The paper presents the results of a molecular epidemiological study on HIV-1 infection in the Tomsk region. The goal of the study was to investigate development and spread of resistant strains of HIV-1 to antiretroviral drugs. It has been found that the genetic variant CRF63_02A6 of HIV-1 continues to dominate, accounting for 75% of all samples. Subtype A6 is present in about 15%, and unique recombinant forms occur in 10%. Transmission of primary resistant strains occurs in 9.5%, and HIV1 carrying the K103N mutation, which causes high resistance to nevirapine and efavirenz, is registered in half of these cases. When antiretroviral treatment is ineffective, resistant strains develop in 78%, and resistance to both nucleoside and non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs and NNRTIs) is observed in 53%. The M184V/I mutation, responsible for resistance to lamivudine and emtricitabine, is the most common among NRTI mutations, accounting for 65.6% of cases. Incidence of other HIV mutations that are resistant to NIOTs does not exceed 10%. Among mutations to NNRTIs, the K103N mutation was found in 28% of cases, and the V106I mutation, which is the main resistance mutation to elsulfavirine (ESV), was detected more often. There are also other substitutions associated with a decrease in sensitivity to ESV, including mutations in codons E138, Y181, A98, Y188, L100, M230, and F227. HIV-1 with reduced sensitivity to AI was isolated from 13% of patients with virological failure of ART. It is important to note that some patients showed significant resistance to bictegravir and dolutegravir, which is a negative prognostic factor. In 18% of cases, HIV-1 was resistant to 2-4 classes of ART medications, and these viruses were isolated from patients with viral loads ranging from 200,000 to 2 million RNA copies/ml. The obtained results emphasize the need to expand access to HIV resistance testing for people living with HIV and importance of antiretroviral therapy (ART) efficiency surveillance.

ВИЧ-инфекцияантиретровирусная терапиямутации резистентности ВИЧлекарственная устойчивость ВИЧ-1Томская областьHIV infectionantiretroviral therapyHIV resistance mutationsHIV-1 drug resistanceTomsk RegionReferencesКириченко А. А. и др. Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 у пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ в России (2013-2021 гг.) //Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2021. – Т. 11. – №. 3. – С. 53-62. https://doi.org/10.18565/epidem.2021.11.3.53- 62.Кириченко А. А. и др. Лекарственная устойчивость ВИЧ-1 у пациентов с вирусологической неэффективностью АРТ в России (2013-2021 гг.) //Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2021. – Т. 11. – №. 3. – С. 53-62. https://doi.org/10.18565/epidem.2021.11.3.53- 62.Кравченко А. В. и др. Эффективность и безопасность нового российского ненуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы элсульфавирина в первой линии лечения ВИЧинфекции в комбинации с двумя нуклеозидными/нуклеотидными ингибиторами обратной транскриптазы–исследование 96 недель //Журнал инфектологии. – 2018. – Т. 10. – №. 2. – С. 76-82.Кравченко А. В. и др. Эффективность и безопасность нового российского ненуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы элсульфавирина в первой линии лечения ВИЧинфекции в комбинации с двумя нуклеозидными/нуклеотидными ингибиторами обратной транскриптазы–исследование 96 недель //Журнал инфектологии. – 2018. – Т. 10. – №. 2. – С. 76-82.Марина Бобкова, Лекарственная устойчивость ВИЧ. ЛитРес, 2017.Марина Бобкова, Лекарственная устойчивость ВИЧ. ЛитРес, 2017.Н. М. Гашникова et al., “A Rapid Expansion of HIV-1 CRF63_02A1 Among Newly Diagnosed HIV-Infected Individuals in the Tomsk Region, Russia,” AIDS Research and Human Retroviruses, vol. 31, no. 4, pp. 456–460, Apr. 2015, doi: https://doi.org/10.1089/aid.2014.0375.Н. М. Гашникова et al., “A Rapid Expansion of HIV-1 CRF63_02A1 Among Newly Diagnosed HIV-Infected Individuals in the Tomsk Region, Russia,” AIDS Research and Human Retroviruses, vol. 31, no. 4, pp. 456–460, Apr. 2015, doi: https://doi.org/10.1089/aid.2014.0375.Соколова Е.В., Ладная Н.Н., Покровский В.В. и др. Влияние антиретровирусной терапии на развитие эпидемии ВИЧ-инфекции в Российской Федерации // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2023. – Т. 13. – № 3. – С. 20–26. https://doi.org/10.18565/epidem.2023.13.3.20-6.Соколова Е.В., Ладная Н.Н., Покровский В.В. и др. Влияние антиретровирусной терапии на развитие эпидемии ВИЧ-инфекции в Российской Федерации // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. – 2023. – Т. 13. – № 3. – С. 20–26. https://doi.org/10.18565/epidem.2023.13.3.20-6.“HIV drug resistance – brief report 2024,” [online] www.who.int. https://www.who.int/publications/i/item/9789240086319 (Дата обращения 24.10.2025)“HIV drug resistance – brief report 2024,” [online] www.who.int. https://www.who.int/publications/i/item/9789240086319 (Дата обращения 24.10.2025)“HIV sequence database main page,” [online] www.hiv.lanl.gov. https://www.hiv.lanl.gov/content/sequence/HIV/mainpage.html (Дата обращения 18.10.2025).“HIV sequence database main page,” [online] www.hiv.lanl.gov. https://www.hiv.lanl.gov/content/sequence/HIV/mainpage.html (Дата обращения 18.10.2025).Alonso S, Salazar E, Gálvez N, Navas J, Quintana C, Orózco N, Prieto L, Navarro ML, Guillén S, Gómez-Alba JM, Medina-Sánchez C, Juarez J, Holguín A. Prevalence of acquired resistance to antiretrovirals in children and adolescents living with HIV under clinical follow-up at the Roosevelt Hospital in Guatemala. J Infect Public Health. 2025, vol. 18, no. 9, pp. 102827. https://doi.org/10.1016/j.jiph.2025.102827.Alonso S, Salazar E, Gálvez N, Navas J, Quintana C, Orózco N, Prieto L, Navarro ML, Guillén S, Gómez-Alba JM, Medina-Sánchez C, Juarez J, Holguín A. Prevalence of acquired resistance to antiretrovirals in children and adolescents living with HIV under clinical follow-up at the Roosevelt Hospital in Guatemala. J Infect Public Health. 2025, vol. 18, no. 9, pp. 102827. https://doi.org/10.1016/j.jiph.2025.102827.Ankunda C, Emunyu J, Namasambi S, Sserunjogi C, Kyomuhangi B, Mumbere I, Nakaweesi J. Prevalence of drug resistance mutations and their association with time to virological failure in people living with HIV in Uganda. BMC Infect Dis. 2025, vol. 25, no. 1, pp. 1241. https://doi.org/10.1186/s12879-025- 11607-w.Ankunda C, Emunyu J, Namasambi S, Sserunjogi C, Kyomuhangi B, Mumbere I, Nakaweesi J. Prevalence of drug resistance mutations and their association with time to virological failure in people living with HIV in Uganda. BMC Infect Dis. 2025, vol. 25, no. 1, pp. 1241. https://doi.org/10.1186/s12879-025- 11607-w.D. P. Zyryanova et al., “Detection of HIV-1 resistant to antiretroviral drugs among tomsk oblast population with newly diagnosed HIV-infection,” Journal Infectology, vol. 12, no. 2, pp. 88–96, Jun. 2020, doi: https://doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-2-88-96.D. P. Zyryanova et al., “Detection of HIV-1 resistant to antiretroviral drugs among tomsk oblast population with newly diagnosed HIV-infection,” Journal Infectology, vol. 12, no. 2, pp. 88–96, Jun. 2020, doi: https://doi.org/10.22625/2072-6732-2020-12-2-88-96.E. Ozhmegova et al., “Prevalence of HIV drug resistance at antiretroviral treatment failure across regions of Russia,” HIV Medicine, vol. 25, no. 7, pp. 862–872, Apr. 2024, doi: https://doi.org/10.1111/hiv.13642.E. Ozhmegova et al., “Prevalence of HIV drug resistance at antiretroviral treatment failure across regions of Russia,” HIV Medicine, vol. 25, no. 7, pp. 862–872, Apr. 2024, doi: https://doi.org/10.1111/hiv.13642.Garland JM, Mayan H, Kantor R. Treatment of Advanced HIV in the Modern Era. Drugs. 2025, vol. 85, no. 7, pp. 883–909. https://doi.org/10.1007/s40265-025-02181-1.Garland JM, Mayan H, Kantor R. Treatment of Advanced HIV in the Modern Era. Drugs. 2025, vol. 85, no. 7, pp. 883–909. https://doi.org/10.1007/s40265-025-02181-1.I. Mimtsoudis, O. Tsachouridou, K. Akinosoglou, and S. Metallidis, “Treatment Management Challenges in Naïve and Experienced HIV-1-Infected Individuals Carrying the M184V Mutation,” Viruses, vol. 16, no. 9, p. 1392, Aug. 2024, doi: https://doi.org/10.3390/v16091392.I. Mimtsoudis, O. Tsachouridou, K. Akinosoglou, and S. Metallidis, “Treatment Management Challenges in Naïve and Experienced HIV-1-Infected Individuals Carrying the M184V Mutation,” Viruses, vol. 16, no. 9, p. 1392, Aug. 2024, doi: https://doi.org/10.3390/v16091392.J. M. Garland, H. Mayan, and R. Kantor, “Treatment of Advanced HIV in the Modern Era,” Drugs, vol. 85, no. 7, May 2025, doi: https://doi.org/10.1007/s40265-025-02181-1.J. M. Garland, H. Mayan, and R. Kantor, “Treatment of Advanced HIV in the Modern Era,” Drugs, vol. 85, no. 7, May 2025, doi: https://doi.org/10.1007/s40265-025-02181-1.Joint United Nations Programme on HIV/AIDS et al. Aids, Crisis, and the Power to Transform: UNAIDS Global Aids Update-2025, Geneva: Joint United Nations Programme on HIV //AIDS. – 2025.Joint United Nations Programme on HIV/AIDS et al. Aids, Crisis, and the Power to Transform: UNAIDS Global Aids Update-2025, Geneva: Joint United Nations Programme on HIV //AIDS. – 2025.K. J. Metzner et al., “Reappearance of Minority K103N HIV-1 Variants after Interruption of ART Initiated during Primary HIV-1 Infection,” PLOS ONE, vol. 6, no. 7, pp. e21734–e21734, Jul. 2011, doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0021734.K. J. Metzner et al., “Reappearance of Minority K103N HIV-1 Variants after Interruption of ART Initiated during Primary HIV-1 Infection,” PLOS ONE, vol. 6, no. 7, pp. e21734–e21734, Jul. 2011, doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0021734.Kirichenko, A.; Kireev, D.; Lopatukhin, A.; Murzakova, A.; Lapovok, I.; Saleeva, D.; Ladnaya, N.; Gadirova, A.; Ibrahimova, S.; Safarova, A.; et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS ONE. 2022, vol. 17, no.1, pp. e0257731. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0257731.Kirichenko, A.; Kireev, D.; Lopatukhin, A.; Murzakova, A.; Lapovok, I.; Saleeva, D.; Ladnaya, N.; Gadirova, A.; Ibrahimova, S.; Safarova, A.; et al. Prevalence of HIV-1 drug resistance in Eastern European and Central Asian countries. PLoS ONE. 2022, vol. 17, no.1, pp. e0257731. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0257731.L.-T. Nguyen, H. A. Schmidt, A. von Haeseler, and B. Q. Minh, “IQ-TREE: A Fast and Effective Stochastic Algorithm for Estimating Maximum-Likelihood Phylogenies,” Molecular Biology and Evolution, vol. 32, no. 1, pp. 268–274, Nov. 2014, doi: https://doi.org/10.1093/molbev/msu300.L.-T. Nguyen, H. A. Schmidt, A. von Haeseler, and B. Q. Minh, “IQ-TREE: A Fast and Effective Stochastic Algorithm for Estimating Maximum-Likelihood Phylogenies,” Molecular Biology and Evolution, vol. 32, no. 1, pp. 268–274, Nov. 2014, doi: https://doi.org/10.1093/molbev/msu300.M. V. Sivay et al., “Characterization of HIV-1 Epidemic in Kyrgyzstan,” Frontiers in Microbiology, vol. 12, no. 12, Oct. 2021, doi: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.753675.M. V. Sivay et al., “Characterization of HIV-1 Epidemic in Kyrgyzstan,” Frontiers in Microbiology, vol. 12, no. 12, Oct. 2021, doi: https://doi.org/10.3389/fmicb.2021.753675.M. V. Sivay et al., “HIV drug resistance among patients experiencing antiretroviral therapy failure in Russia, 2019–2021,” International Journal of Antimicrobial Agents, vol. 63, no. 2, pp. 107074– 107074, Dec. 2023, doi: https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2023.107074.M. V. Sivay et al., “HIV drug resistance among patients experiencing antiretroviral therapy failure in Russia, 2019–2021,” International Journal of Antimicrobial Agents, vol. 63, no. 2, pp. 107074– 107074, Dec. 2023, doi: https://doi.org/10.1016/j.ijantimicag.2023.107074.M. V. Sivay et al., “Spatiotemporal dynamics of HIV-1 CRF63_02A6 sub-epidemic,” Frontiers in Microbiology, vol. 13, Aug. 2022, doi: https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.946787.M. V. Sivay et al., “Spatiotemporal dynamics of HIV-1 CRF63_02A6 sub-epidemic,” Frontiers in Microbiology, vol. 13, Aug. 2022, doi: https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.946787.Rodríguez-Galet A, Ventosa-Cubillo J, Bendomo V, Eyene M, Mikue-Owono T, Nzang J, Ncogo P, Gonzalez-Alba JM, Benito A, Holguín Á. High Drug Resistance Levels Compromise the Control of HIV Infection in Pediatric and Adult Populations in Bata, Equatorial Guinea. Viruses. 2022, vol. 15, no. 1, pp. 27. https://doi.org/10.3390/v15010027.Rodríguez-Galet A, Ventosa-Cubillo J, Bendomo V, Eyene M, Mikue-Owono T, Nzang J, Ncogo P, Gonzalez-Alba JM, Benito A, Holguín Á. High Drug Resistance Levels Compromise the Control of HIV Infection in Pediatric and Adult Populations in Bata, Equatorial Guinea. Viruses. 2022, vol. 15, no. 1, pp. 27. https://doi.org/10.3390/v15010027.S. H. Abidi, L. Aibekova, S. Davlidova, A. Amangeldiyeva, B. Foley, and S. Ali, “Origin and evolution of HIV-1 subtype A6,” PLOS ONE, vol. 16, no. 12, p. e0260604, Dec. 2021, doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0260604.S. H. Abidi, L. Aibekova, S. Davlidova, A. Amangeldiyeva, B. Foley, and S. Ali, “Origin and evolution of HIV-1 subtype A6,” PLOS ONE, vol. 16, no. 12, p. e0260604, Dec. 2021, doi: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0260604.W. H. Organization, Consolidated guidelines on the use of antiretroviral drugs for treating and preventing HIV infection: recommendations for a public health approach. World Health Organization, 2016. Available: [online] https://iris.who.int/handle/10665/208825 (Дата обращения 03.10.2025).W. H. Organization, Consolidated guidelines on the use of antiretroviral drugs for treating and preventing HIV infection: recommendations for a public health approach. World Health Organization, 2016. Available: [online] https://iris.who.int/handle/10665/208825 (Дата обращения 03.10.2025).Wensing AM, Calvez V, Ceccherini-Silberstein F, et al. 2022 update of the drug resistance mutations in HIV-1. Top Antivir Med. 2022, vol. 30, no. 4, pp. 559–574.Wensing AM, Calvez V, Ceccherini-Silberstein F, et al. 2022 update of the drug resistance mutations in HIV-1. Top Antivir Med. 2022, vol. 30, no. 4, pp. 559–574.www.unaids.org. (n.d.). Информационный бюллетень - Глобальная статистика по ВИЧ. [online] Available at: https://www.unaids.org/ru/resources/fact-sheet (Дата обращения 22.10.2025).www.unaids.org. (n.d.). Информационный бюллетень - Глобальная статистика по ВИЧ. [online] Available at: https://www.unaids.org/ru/resources/fact-sheet (Дата обращения 22.10.2025).X. Pang et al., “Emergence of HIV-1 drug resistance mutations among children and adolescents undergoing prolonged antiretroviral therapy in Guangxi,” Journal of global antimicrobial resistance, vol. 37, no. 37, pp. 208–213, Jun. 2024, doi: https://doi.org/10.1016/j.jgar.2024.03.013.X. Pang et al., “Emergence of HIV-1 drug resistance mutations among children and adolescents undergoing prolonged antiretroviral therapy in Guangxi,” Journal of global antimicrobial resistance, vol. 37, no. 37, pp. 208–213, Jun. 2024, doi: https://doi.org/10.1016/j.jgar.2024.03.013.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.