infectpataogДальневосточный журнал инфекционной патологииFar Eastern Journal of Infectious Pathology2073-2899ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзораinfectpataog-424Research ArticleСтатьиОбзор научно-практических результатов деятельности Хабаровского НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора, полученных в 2022 году с использованием молекулярно-генетических технологийReview of science-to-practice activity of the Khabarovsk research institute of epidemiology and microbiology of the Federal service for surveillance on consumers rights protection and human wellbeing including molecular-genetic research obtained during year 2022ТроценкоО. Е.TrotsenkoO. E.

Троценко Ольга Евгеньевна – доктор медицинских наук, директор ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора

adm@hniiem.ruКоритаТ. В.KoritaT. V.СапегаЕ. Ю.SapegaE. Yu.КотоваВ. О.KotovaV. O.БалахонцеваЛ. А.BalakhontsevaL. A.БутаковаЛ. В.ButakovaL. V.БазыкинаЕ. А.BazykinaE. A.ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзора, город Хабаровск, Российская ФедерацияРоссияFBUN Khabarovsk research institute of epidemiology and microbiology of the Federal service for surveillance on consumers rights protection and human wellbeing (Rospotrebnadzor), Khabarovsk, Russian FederationRussian Federation202301062025044511Copyright © Троценко О.Е., Корита Т.В., Сапега Е.Ю., Котова В.О., Балахонцева Л.А., Бутакова Л.В., Базыкина Е.А., 20252025Троценко О.Е., Корита Т.В., Сапега Е.Ю., Котова В.О., Балахонцева Л.А., Бутакова Л.В., Базыкина Е.А.Trotsenko O.E., Korita T.V., Sapega E.Y., Kotova V.O., Balakhontseva L.A., Butakova L.V., Bazykina E.A.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://infectpataog.elpub.ru/jour/article/view/424

В процессе эволюции энтеровирусов, ротавирусов, норовирусов, вируса иммунодефицита человека, вирусов гепатитов В и С, а также нового коронавируса происходят различные генетические перестройки, приводящие к возникновению новых генетических вариантов, обуславливающих осложнение эпидемической ситуации в различных регионах. В настоящее время в Дальневосточном федеральном округе Российской Федерации, благодаря более широкому использованию молекулярно-генетических методов исследования с использованием анализа нуклеотидных последовательностей генома возбудителей, имеется возможность установления эпидемиологических связей между случаями заболеваний и оценки единства или множественности источников в очагах указанных инфекций. Показано, что постоянный мониторинг за циркуляцией вышеперечисленных вирусов необходим для выявления признаков ухудшения эпидемической ситуации в конкретной географической зоне. Одним из таких признаков является обнаружение среди населения нового генетического варианта возбудителя, преимущественно вследствие его заноса из разных территорий России или из других стран мира.

Various genetic rearrangements occur in the process of evolution of the enteroviruses, rotaviruses, noroviruses, HIV, HBV, HCV and SARS-CoV-2. They lead to emergence of new genetic variants that cause aggravation of the epidemic situation in various regions of the country. Currently, wide application of molecular-genetic methods based on the analysis of nucleotide sequences of causative agent’s genome in the Far Eastern Federal District of the Russian Federation allows to establish epidemiological relationship between disease cases and estimate whether the foci of infection were formed due to a single pathogen or several causative agents. It has been shown that constant surveillance of the above mentioned viruses circulation is necessary to identify signs of epidemic situation deterioration in a particular geographical area. One of these signs is detection of a new genetic variant of pathogen that was most likely imported from a different constituent entity of the Russian Federation or other countries.

Дальневосточный федеральный округмолекулярно-генетический мониторингфрагментное секвенированиеочаги вирусных инфекцийгенетические варианты возбудителейFar Eastern Federal districtmolecular-genetic surveillancesequencing and fragment analysisfoci of viral infectionsgenetic variants of causative agentsReferencesАкимкин В.Г., Попова А.Ю., Хафизов К.Х., Дубоделов Д.В., Углева С.В. и др. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение II: динамика циркуляции геновариантов вируса SARS-CoV-2 // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2022. – Том 99, №4. – С. 381-396. DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-295.Акимкин В.Г., Попова А.Ю., Хафизов К.Х., Дубоделов Д.В., Углева С.В. и др. COVID-19: эволюция пандемии в России. Сообщение II: динамика циркуляции геновариантов вируса SARS-CoV-2 // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2022. – Том 99, №4. – С. 381-396. DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-295.Беляков В.Д., Яфаев Р.Х. Эпидемиология / М.: Медицина. – 1989. – 416 с.Беляков В.Д., Яфаев Р.Х. Эпидемиология / М.: Медицина. – 1989. – 416 с.Бобкова М.Р. Молекулярно-генетические методы в изучении эпидемиологии инфекций, возбудители которых передаются парентеральным путем: Автореф. дисс. … д-ра. биол. наук. – М., 2002. – 42 с.Бобкова М.Р. Молекулярно-генетические методы в изучении эпидемиологии инфекций, возбудители которых передаются парентеральным путем: Автореф. дисс. … д-ра. биол. наук. – М., 2002. – 42 с.Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Троценко О.Е., Каравянская Т.Н., Карлов И.С. и др. Расследование очага групповой заболеваемости норовирусной инфекцией в дошкольном образовательном учреждении Хабаровского края (случай из практики) // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 139-141.Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Троценко О.Е., Каравянская Т.Н., Карлов И.С. и др. Расследование очага групповой заболеваемости норовирусной инфекцией в дошкольном образовательном учреждении Хабаровского края (случай из практики) // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 139-141.Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Карлов И.С. Водные вспышки норовирусной инфекции в пос. Многовершинный Хабаровского края // Материалы XII Съезда ВНПОЭМП (26-28 октября 2022 г., Москва) / под ред. профессора А.Ю. Поповой, академика РАН, профессора В.Г. Акимкина. – М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2022. – 654 с. (С. 334-335).Бутакова Л.В., Сапега Е.Ю., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Карлов И.С. Водные вспышки норовирусной инфекции в пос. Многовершинный Хабаровского края // Материалы XII Съезда ВНПОЭМП (26-28 октября 2022 г., Москва) / под ред. профессора А.Ю. Поповой, академика РАН, профессора В.Г. Акимкина. – М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2022. – 654 с. (С. 334-335).Зайцева Н.Н., Ефимов Е.И., Носов Н.Н., Парфенова О.В., Пекшева О.Ю. Современные молекулярно-генетические методы исследования в эпидемиологическом надзоре за ВИЧ-инфекцией // МЕДИАЛЬ. – 2014. - №2 (12). – С. 122-133.Зайцева Н.Н., Ефимов Е.И., Носов Н.Н., Парфенова О.В., Пекшева О.Ю. Современные молекулярно-генетические методы исследования в эпидемиологическом надзоре за ВИЧ-инфекцией // МЕДИАЛЬ. – 2014. - №2 (12). – С. 122-133.Зайцева Т.А., Каравянская Т.Н., Чистяк В.М., Гарбуз Ю.А., Резник В.И., Лебедева Л.А., Троценко О.Е., Корита Т.В. Роль водного фактора в возникновении вспышечной заболеваемости острыми кишечными инфекциями вирусной этиологии (на примере Хабаровского края) // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2015. - №29. – С. 17-25.Зайцева Т.А., Каравянская Т.Н., Чистяк В.М., Гарбуз Ю.А., Резник В.И., Лебедева Л.А., Троценко О.Е., Корита Т.В. Роль водного фактора в возникновении вспышечной заболеваемости острыми кишечными инфекциями вирусной этиологии (на примере Хабаровского края) // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2015. - №29. – С. 17-25.Котова В.О., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, выделенных на территориях Дальневосточного федерального округа (анализ за 2021-2022 гг. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №43. – С. 84-92.Котова В.О., Троценко О.Е., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, выделенных на территориях Дальневосточного федерального округа (анализ за 2021-2022 гг. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №43. – С. 84-92.Котова В.О., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А., Троценко О.Е. Мутации резистентности ВИЧ к у пациентов Сахалинской области и Республики Саха (Якутия) // Материалы XII Съезда ВНПОЭМП (26-28 октября 2022 г., Москва) / под ред. профессора А.Ю. Поповой, академика РАН, профессора В.Г. Акимкина. – М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2022. – 654 с. (С. 392-393).Котова В.О., Балахонцева Л.А., Базыкина Е.А., Троценко О.Е. Мутации резистентности ВИЧ к у пациентов Сахалинской области и Республики Саха (Якутия) // Материалы XII Съезда ВНПОЭМП (26-28 октября 2022 г., Москва) / под ред. профессора А.Ю. Поповой, академика РАН, профессора В.Г. Акимкина. – М.: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2022. – 654 с. (С. 392-393).Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Курганова О.П. и др. Особенности эпидемического прцесса энтеровирусной инфекции в субъектах Дальневосточного и Сибирского федеральных округов в 2021 г. и прогноз заболеваемости на 2022 г. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 70-79.Сапега Е.Ю., Бутакова Л.В., Троценко О.Е., Зайцева Т.А., Курганова О.П. и др. Особенности эпидемического прцесса энтеровирусной инфекции в субъектах Дальневосточного и Сибирского федеральных округов в 2021 г. и прогноз заболеваемости на 2022 г. // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 70-79.Троценко О.Е., Котова В.О., Сапега Е.Ю., Балахонцева Л.А., Бутакова Л.В. и др. Внедрение методов молекулярно-генетического анализа в практику этиологической расшифровки очагов инфекционных болезней в Хабаровском крае // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2016. - №31. – С. 6-11.Троценко О.Е., Котова В.О., Сапега Е.Ю., Балахонцева Л.А., Бутакова Л.В. и др. Внедрение методов молекулярно-генетического анализа в практику этиологической расшифровки очагов инфекционных болезней в Хабаровском крае // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2016. - №31. – С. 6-11.Троценко О.Е., Корита Т.В., Котова В.О., Сапега Е.Ю., Курганова О.П., Зайцева Т.А. и др. Эпидемиологические и молекулярно-генетические особенности инфекции COVID-19 в пятую волну пандемии в субъектах Дальневосточного федерального округа Российской Федерации // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 54-69.Троценко О.Е., Корита Т.В., Котова В.О., Сапега Е.Ю., Курганова О.П., Зайцева Т.А. и др. Эпидемиологические и молекулярно-генетические особенности инфекции COVID-19 в пятую волну пандемии в субъектах Дальневосточного федерального округа Российской Федерации // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. – 2022. - №42. – С. 54-69.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.