infectpataogДальневосточный журнал инфекционной патологииFar Eastern Journal of Infectious Pathology2073-2899ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии Роспотребнадзораinfectpataog-309Research ArticleОРИГИНАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ. ОРВИ И ВНЕБОЛЬНИЧНЫЕ ПНЕВМОНИИ В ПЕРИОД ПАНДЕМИИ НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИORIGINAL RESEARCHES. SARS AND COMMUNITY-ACCOMBINED PNEUMONIA DURING THE NEW CORONAVIRUS INFECTION PANDEMICВзаимообусловленность заболеваемости ОРВИ и новой коронавирусной инфекцией в Республике Саха (Якутия) на современном этапеInterdependence of ARVI and new coronavirus infection incidence in the Republic Sakha (Yakutia) at present periodБазыкинаЕ. А.BazykinaE. A.

Базыкина Елена Анатольевна – научный сотрудник лаборатории эпидемиологии и профилактики ВИЧ-инфекции и вирусных гепатитов.

Хабаровск

Khabarovsk

adm@hniiem.ruТроценкоО. Е.TrotsenkoO. E.

Хабаровск

Khabarovsk

КоритаТ. В.KoritaT. V.

Хабаровск

Khabarovsk

ИгнатьеваМ. Е.IgnatyevaM. E.

Якутск

Yakutsk

БудацыреноваЛ. В.BudatsirenovaL. V.

Якутск

Yakutsk

ФБУН Хабаровский НИИ эпидемиологии и микробиологии РоспотребнадзораРоссияFBUN Khabarovsk research institute of epidemiology and microbiology of the Federal service for surveillance on consumers rights protection and human wellbeingRussian FederationУправление Роспотребнадзора по Республике Саха (Якутия)РоссияRepublic Sakha (Yakutia) Rospotrebnadzor regional officeRussian Federation2022290520250431426Copyright © Базыкина Е.А., Троценко О.Е., Корита Т.В., Игнатьева М.Е., Будацыренова Л.В., 20252025Базыкина Е.А., Троценко О.Е., Корита Т.В., Игнатьева М.Е., Будацыренова Л.В.Bazykina E.A., Trotsenko O.E., Korita T.V., Ignatyeva M.E., Budatsirenova L.V.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://infectpataog.elpub.ru/jour/article/view/309

Острые респираторные вирусные инфекции (ОРВИ) являются одними из наиболее распространенных инфекционных заболеваний. Учитывая тот факт, что SARS-CoV-2 имеет сходный путь передачи с другими возбудителями ОРВИ, оценка влияния данного патогена на общую заболеваемость ОРВИ является важным вопросом современного здравоохранения.

Целью исследования стало изучение связи между заболеваемостью ОРВИ и новой коронавирусной инфекцией в Республике Саха (Якутия) на современном этапе.

Результаты исследования

Результаты исследования. В ходе эпидемиологического анализа заболеваемости ОРВИ на территории Республики Саха (Якутия), проведенного за период времени с 03.01.2022 г. по 09.10.2022 г., выявлены периоды устойчивого превышения эпидемического порога в сочетании с нарастанием темпов прироста недельной заболеваемости ОРВИ по сравнению с предыдущими неделями. Приведена характеристика заболеваемости ОРВИ в разных возрастных группах. Показано влияние детского населения на эпидемический процесс ОРВИ в Республике Саха (Якутия). Выполнено сравнение заболеваемости ОРВИ с аналогичным периодом 2021 года с целью выявления отличий в динамике эпидемического процесса. На основе данных лабораторных исследований показаны различия в этиологической структуре возбудителей ОРВИ в Якутии в анализируемый период 2022 г. в сравнении с 2019 и 2021 гг. Продемонстрировано влияние пандемии COVID-19 и различных геновариантов SARS-CoV-2 (альфа, дельта и омикрон) на динамику эпидемического процесса ОРВИ в разные периоды наблюдения (2021 и 2022 гг.). Показано, что появление новых вариантов SARS-CoV-2 сопровождается всплеском заболеваемости ОРВИ. Отмечено увеличение роли группы возбудителей ОРВИ, суммарно включающей сезонные коронавирусы, метапневмовирусы и бокавирусы, в 2021 и 2022 гг. по сравнению с 2019 г., а также превалирование парагриппа 1,3 типов в структуре респираторных возбудителей ОРВИ в годы наблюдения. Корреляционный анализ не позволил установить связи частоты выявления вирусов, изученных в ходе анализа, с заболеваемостью ОРВИ, за исключением вируса гриппа H3N2, который в течение первых четырех месяцев 2022 г. внёс вклад в эпидемический процесс ОРВИ.

Выводы

Выводы: Появление вируса SARS-CoV-2, в особенности его новых генетических вариантов, оказало значительное влияние не только на заболеваемость ОРВИ среди населения Республики Саха Якутия, но и на этиологическую структуру других респираторных вирусов, циркулировавших в 2021 и 2022 гг.

Acute respiratory viral infections (ARVI) are among the most common infectious diseases. Given the fact that SARS-CoV-2 has a similar transmission route with other ARVI pathogens, assessing the impact of this pathogen on the overall incidence of ARVI is an important issue in modern healthcare. The aim of the research was to study relationship between incidence of acute respiratory viral infections and a COVID-19 in the Republic of Sakha (Yakutia) at present period.

Results

Results. Epidemiological analysis of the ARVI incidence in the Republic of Sakha (Yakutia) showed periods of continuous excess of epidemic threshold as well as increase in the growth rate of the weekly incidence of acute respiratory viral infections compared with previous weeks for the period from 01 March to 10 September of year 2022. The characteristic of ARVI morbidity in different age groups was given. The impact of the child population on the epidemic process of SARS in the Republic of Sakha (Yakutia) was shown. Comparative analysis of ARVI incidence during year 2022 with the same period of the year 2021 was performed in order to reveal differences of the epidemic process dynamics.Comparison of ARVI pathogens etiological structure in Yakutia that was based on laboratory data were analyzed during years 2022 2019 and 2021. Influence of COVID-19 pandemic and various SARS-CoV-2 genovariants (alpha, delta and omicron) on the dynamics of the epidemic process of SARS in different periods of observation was demonstrated for years 2021 and 2022. Analysis showed that emergence of new SARS-CoV-2 variants is accompanied by an increase of ARVI incidence.An increase of different ARVI pathogens abundance, including human coronavirus (HCoV), human metapneumovirus and bocavirus, was noted during years 2021 and 2022 compared to 2019. Should be noted that parainfluenza virus types 1,3 were most prevalent during the three years of observation. Correlation analysis did not show a relationship between frequency detection of the ARVI viruses and ARVI incidence, with the exception of the H3N2 influenza virus, which during the first four months of year 2022 contributed to ARVI epidemic process.

Conclusions

Conclusions: Emergence of the SARS-CoV-2 virus, especially its new genetic variants, had a significant impact not only on the ARVI incidence among the population of the Republic Sakha (Yakutia), but also on the etiological structure of other respiratory viruses that were circulating during years 2021 and 2022.

пандемияCOVID-19ОРВИзаболеваемостьРеспублика Саха (Якутия)pandemicCOVID-19ARVIincidenceRepublic Sakha (Yakutia)ReferencesАнтонец Д.В., Старчевская М.Е., Колосова Н.П., Суслопаров И.М., Даниленко А.В., Боднев С.А., Швалов А.Н., Трегубчак Т.В., Рыжиков А.Б., Пьянков О.В., Максютов Р.А. Предварительный анализ генетической изменчивости изолятов вируса SARS-CoV-2, относящихся к варианту Омикрон, циркулирующих на территории Российской Федерации // COVID-19-PREPRINTS.MICROBE.RU. – 2022. – doi.org/10.21055/preprints-3112049.Антонец Д.В., Старчевская М.Е., Колосова Н.П., Суслопаров И.М., Даниленко А.В., Боднев С.А., Швалов А.Н., Трегубчак Т.В., Рыжиков А.Б., Пьянков О.В., Максютов Р.А. Предварительный анализ генетической изменчивости изолятов вируса SARS-CoV-2, относящихся к варианту Омикрон, циркулирующих на территории Российской Федерации // COVID-19-PREPRINTS.MICROBE.RU. – 2022. – doi.org/10.21055/preprints-3112049.Белов А.Б., Куликов П.В. Решенные и проблемные вопросы эпидемиологии гриппа через сто лет после пандемии «испанки» // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2019. – Т. 18, № 5. – С.109-120. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2019-18-5-109-120Белов А.Б., Куликов П.В. Решенные и проблемные вопросы эпидемиологии гриппа через сто лет после пандемии «испанки» // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2019. – Т. 18, № 5. – С.109-120. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2019-18-5-109-120Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., Воронина О.Л., Игнатьева А.В., и др. Особенности циркуляции возбудителей ОРВИ на фоне появления и широкого распространения SARS-CoV-2 в 2018–2021 годы // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. – Т. 21, № 4. – С. 16-26. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-4-16-26Бурцева Е.И., Колобухина Л.В., Воронина О.Л., Игнатьева А.В., и др. Особенности циркуляции возбудителей ОРВИ на фоне появления и широкого распространения SARS-CoV-2 в 2018–2021 годы // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. – Т. 21, № 4. – С. 16-26. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-4-16-26. Карпова Л.С., Волик К.М., Смородинцева Е.А., Столярова Т.П., Поповцева Н.М., Столяров К.А. Влияние гриппа различной этиологии на другие ОРВИ у детей и взрослых в 2014-2016 годах // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2018. – Т. 17, №6 – С. 35-47. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2018-17-35-47. Карпова Л.С., Волик К.М., Смородинцева Е.А., Столярова Т.П., Поповцева Н.М., Столяров К.А. Влияние гриппа различной этиологии на другие ОРВИ у детей и взрослых в 2014-2016 годах // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. – 2018. – Т. 17, №6 – С. 35-47. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2018-17-35-47Кириллина К. С. Современные тенденции изменения климата республики Саха (Якутия) // Ученые записки Российского государственного гидрометеорологического университета. – 2013. – №. 30. – С. 69-77.Кириллина К. С. Современные тенденции изменения климата республики Саха (Якутия) // Ученые записки Российского государственного гидрометеорологического университета. – 2013. – №. 30. – С. 69-77.Киселева И.В., Ксенафонтов. А.Д. Рино- и РС-вирусы в пандемию COVID-19 // Инфекция и иммунитет. – 2022. – Т. 4, № 12. – С. 624-638.Киселева И.В., Ксенафонтов. А.Д. Рино- и РС-вирусы в пандемию COVID-19 // Инфекция и иммунитет. – 2022. – Т. 4, № 12. – С. 624-638.Кравченко Н.А., Казанова В.Б., Хакимова М.И., Гаврилова Т.А., Зайкова З.А., Ботвинкин А.Д. Динамика заболеваемости и этиологической структуры острых респираторных инфекций накануне и в первый год распространения COVID-19 в Иркутской области //Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. – Т. 21, № 3. – С. 50-62. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-3-50-62Кравченко Н.А., Казанова В.Б., Хакимова М.И., Гаврилова Т.А., Зайкова З.А., Ботвинкин А.Д. Динамика заболеваемости и этиологической структуры острых респираторных инфекций накануне и в первый год распространения COVID-19 в Иркутской области //Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. – Т. 21, № 3. – С. 50-62. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-3-50-62Краснова Е.И., Карпович Г.С., Проворова В.В., Шестаков А.Е., Казакова Ю.В. Грипп в период пандемии COVID-19, эпидемиологическая характеристика, подходы к вакцинации // Лечащий Врач. – 2021. – № 4. – С. 50-56. https://doi.org/10.51793/OS.2021.98.48.009Краснова Е.И., Карпович Г.С., Проворова В.В., Шестаков А.Е., Казакова Ю.В. Грипп в период пандемии COVID-19, эпидемиологическая характеристика, подходы к вакцинации // Лечащий Врач. – 2021. – № 4. – С. 50-56. https://doi.org/10.51793/OS.2021.98.48.009Семененко Т.А., Акимкин В.Г., Бурцева Е.И., Ноздрачева А.В., и др. Особенности эпидемической ситуации по острым респираторным вирусным инфекциям с учетом пандемического распространения COVID-19 // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. –Т. 21, № 4. – С. 4-15. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-4-4-15Семененко Т.А., Акимкин В.Г., Бурцева Е.И., Ноздрачева А.В., и др. Особенности эпидемической ситуации по острым респираторным вирусным инфекциям с учетом пандемического распространения COVID-19 // Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. – 2022. –Т. 21, № 4. – С. 4-15. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2022-21-4-4-15Хабарова А. В., Соцкая Я. А. Особенности гриппа в период пандемии COVID-19 // Экологические проблемы экспериментальной и клинической медицины. – 2021. – С. 199-207.Хабарова А. В., Соцкая Я. А. Особенности гриппа в период пандемии COVID-19 // Экологические проблемы экспериментальной и клинической медицины. – 2021. – С. 199-207.Хунафина, Д. Х., Рахматуллина, Г. С., Асадуллина, О. А., Хасанова, Г. и дрю. Заболеваемость ОРВИ и гриппом за 2019 год по данным ГБУЗ РБ ИКБ № 4 //Фундаментальные и прикладные аспекты иммунологии, генетики и инфектологии. – 2020. – С. 155-163.Хунафина, Д. Х., Рахматуллина, Г. С., Асадуллина, О. А., Хасанова, Г. и дрю. Заболеваемость ОРВИ и гриппом за 2019 год по данным ГБУЗ РБ ИКБ № 4 //Фундаментальные и прикладные аспекты иммунологии, генетики и инфектологии. – 2020. – С. 155-163.Ortiz-Prado E., Simbaña-Rivera K., Gomez-Barreno L., Rubio-Neira M., et al. Clinical, molecular, and epidemiological characterization of the SARS-CoV-2 virus and the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19), a comprehensive literature review // Diagnostic microbiology and infectious disease. – 2020. – Vol. 98, №. 1. – P. 115094.Ortiz-Prado E., Simbaña-Rivera K., Gomez-Barreno L., Rubio-Neira M., et al. Clinical, molecular, and epidemiological characterization of the SARS-CoV-2 virus and the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19), a comprehensive literature review // Diagnostic microbiology and infectious disease. – 2020. – Vol. 98, №. 1. – P. 115094.Willet B.J., Grove J., MacLean O.A., Wilkie C., et al. The hyper-transmissible SARS-CoV-2 Omicron variant exhibits significant antigenic change, vaccine escape and a switch in cell entry mechanism // medRxiv. –2022. DOI: 10.1101/2022.01/03.21268111.Willet B.J., Grove J., MacLean O.A., Wilkie C., et al. The hyper-transmissible SARS-CoV-2 Omicron variant exhibits significant antigenic change, vaccine escape and a switch in cell entry mechanism // medRxiv. –2022. DOI: 10.1101/2022.01/03.21268111.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.